玫瑰茄全基因组图谱开发采购公告

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玫瑰茄全基因组图谱开发采购公告

项目名称玫瑰茄全基因组图谱开发项目编号EJWJ*
公告开始日期*公告截止日期*
采购单位福建农林大学付款方式待结题报告交付后，付全款。
联系人中标后在我参与的项目中查看联系电话中标后在我参与的项目中查看
签约时间要求成交后30日内到货时间要求无
预 算49500.0
收货地址无
供应商资质要求

符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购商品采购数量计量单位所属分类
玫瑰茄全基因组图谱开发1项农学研究服务
品牌无
型号无
品牌2无
型号无
品牌3无
型号无
预算49500.0
技术参数及配置要求1、完成玫瑰茄样品的DNA提取，质检合格后构建三代测序基因组文库进行PacBio Revio测序技术平台HIFI测序模式测序并进行数据质控，测序数据量60Gb；构建二代测序基因组文库进行DNB-SEQ测序平台PE150测序策略测序并进行数据质控，测序数据量50G；2、完成玫瑰茄样品的*醛交联、细胞核提取，构建1个Hi-C文库，质检后基于illumina测序平台进行测序。测序数据量200Gb；3、完成4个玫瑰茄不同组织样品的RNA提取，质检合格后进行基于DNB-SEQ平台进行常规转录组测序，测序数据量6G；取不同组织部位玫瑰茄样品进行RNA提取，质检合格后基于Nanopore平台进行转录组测序，测序数据量10G；完成测序后进行HIFI单倍型基因组图谱分析，分析内容如下：(1)数据质控；(2)单倍型基因组组装（共组装2套）（组装、组装结果评估）；(3)HIC辅助基因组拼接，比对参考基因组，将组装得到的Contig挂载到染色体，挂载率>90%；(4)基因组注释基因组注释（重复序列注释、基因结构注释、基因功能注释、ncRNA注释）；(5)比较基因组学分析（基因家族分析、系统进化分析）；(6)单倍型基因组特有分析、亚基因组结构变异分析、亚基因组不对称进化分析（Ka/Ks差异分析）等位基因表达偏岐分析；4、1）供应商样本提取合格率≥98%，对于DNA提取不合格样本，提取到合格为止。2）供应商针对检测合格后的样品(样本总量≥ 100ng)，搭配自动化建库仪器，通量做到1人/4H/96个样本。3）供应商拥有自主nanopore测序仪并服务过使用Nanopore平台测序的用户，并发表过文章。
售后服务7×24小时技术支持，服务响应时限:反馈问题后2小时内;

报价地址：http://**
项目名称玫瑰茄全基因组图谱开发项目编号EJWJ*
公告开始日期*公告截止日期*
采购单位福建农林大学付款方式待结题报告交付后，付全款。
联系人中标后在我参与的项目中查看联系电话中标后在我参与的项目中查看
签约时间要求成交后30日内到货时间要求无
预 算49500.0
收货地址无
供应商资质要求

符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购商品采购数量计量单位所属分类
玫瑰茄全基因组图谱开发1项农学研究服务
品牌无
型号无
品牌2无
型号无
品牌3无
型号无
预算49500.0
技术参数及配置要求1、完成玫瑰茄样品的DNA提取，质检合格后构建三代测序基因组文库进行PacBio Revio测序技术平台HIFI测序模式测序并进行数据质控，测序数据量60Gb；构建二代测序基因组文库进行DNB-SEQ测序平台PE150测序策略测序并进行数据质控，测序数据量50G；2、完成玫瑰茄样品的*醛交联、细胞核提取，构建1个Hi-C文库，质检后基于illumina测序平台进行测序。测序数据量200Gb；3、完成4个玫瑰茄不同组织样品的RNA提取，质检合格后进行基于DNB-SEQ平台进行常规转录组测序，测序数据量6G；取不同组织部位玫瑰茄样品进行RNA提取，质检合格后基于Nanopore平台进行转录组测序，测序数据量10G；完成测序后进行HIFI单倍型基因组图谱分析，分析内容如下：(1)数据质控；(2)单倍型基因组组装（共组装2套）（组装、组装结果评估）；(3)HIC辅助基因组拼接，比对参考基因组，将组装得到的Contig挂载到染色体，挂载率>90%；(4)基因组注释基因组注释（重复序列注释、基因结构注释、基因功能注释、ncRNA注释）；(5)比较基因组学分析（基因家族分析、系统进化分析）；(6)单倍型基因组特有分析、亚基因组结构变异分析、亚基因组不对称进化分析（Ka/Ks差异分析）等位基因表达偏岐分析；4、1）供应商样本提取合格率≥98%，对于DNA提取不合格样本，提取到合格为止。2）供应商针对检测合格后的样品(样本总量≥ 100ng)，搭配自动化建库仪器，通量做到1人/4H/96个样本。3）供应商拥有自主nanopore测序仪并服务过使用Nanopore平台测序的用户，并发表过文章。
售后服务7×24小时技术支持，服务响应时限:反馈问题后2小时内;

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