玫瑰茄全基因组图谱开发采购公告
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玫瑰茄全基因组图谱开发采购公告
| 项目名称 | 玫瑰茄全基因组图谱开发 | 项目编号 | EJWJ* |
|---|---|---|---|
| 公告开始日期 | * | 公告截止日期 | * |
| 采购单位 | 福建农林大学 | 付款方式 | 结题报告出具后付款 |
| 联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 中标后在我参与的项目中查看 |
| 签约时间要求 | 成交后30日内 | 到货时间要求 | 无 |
| 预 算 | 49500.0 | ||
| 收货地址 | 无 | ||
| 供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 | ||
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
|---|---|---|---|
| 玫瑰茄全基因组图谱开发 | 1 | 项 | 农学研究服务 |
| 品牌 | 无 |
|---|---|
| 型号 | 无 |
| 品牌2 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 品牌3 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 预算 | 49500.0 |
| 技术参数及配置要求 | 1.完成玫瑰茄基因组DNA的提取。基于PacBio测序技术平台HIFI测序模式，构建三代测序基因组文库，测序并进行数据质控。质量指标：测序1个cell，单个cell有效ccs数据量高于100Gb。 2.基于illumina测序平台，构建2个Hi-C文库并进行测序。测序文库数据量不低于250Gb，文库有效交联对数高于80％，Q30>85%。 3.完成基因组组装注释分析工作，组装得到的contig N50>60M。完成全基因组精细注释：编码基因预测；重复序列注释和转座元件分类；Non-coding RNA注释；假基因注释；基因功能注释：NR、eggNOG、GO、KEGG、TrEMBL、Swissport、Pfam和InterPro注释。完成染色体构建：Hi-C染色体定位；组装序列染色体群组划分；组装序列各群组内排序；组装序列各群组内定向；全基因组circos圈图( TE,gene,GC,共线性）评估；共线性评估；热图评估。 4.项目周期：45天 |
| 售后服务 | 要求公司技术人员能及时回复（提出12h之内）并尽快解决项目组成员提出的相关技术问题。; |
| 项目名称 | 玫瑰茄全基因组图谱开发 | 项目编号 | EJWJ* |
|---|---|---|---|
| 公告开始日期 | * | 公告截止日期 | * |
| 采购单位 | 福建农林大学 | 付款方式 | 结题报告出具后付款 |
| 联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 中标后在我参与的项目中查看 |
| 签约时间要求 | 成交后30日内 | 到货时间要求 | 无 |
| 预 算 | 49500.0 | ||
| 收货地址 | 无 | ||
| 供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 | ||
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
|---|---|---|---|
| 玫瑰茄全基因组图谱开发 | 1 | 项 | 农学研究服务 |
| 品牌 | 无 |
|---|---|
| 型号 | 无 |
| 品牌2 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 品牌3 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 预算 | 49500.0 |
| 技术参数及配置要求 | 1.完成玫瑰茄基因组DNA的提取。基于PacBio测序技术平台HIFI测序模式，构建三代测序基因组文库，测序并进行数据质控。质量指标：测序1个cell，单个cell有效ccs数据量高于100Gb。 2.基于illumina测序平台，构建2个Hi-C文库并进行测序。测序文库数据量不低于250Gb，文库有效交联对数高于80％，Q30>85%。 3.完成基因组组装注释分析工作，组装得到的contig N50>60M。完成全基因组精细注释：编码基因预测；重复序列注释和转座元件分类；Non-coding RNA注释；假基因注释；基因功能注释：NR、eggNOG、GO、KEGG、TrEMBL、Swissport、Pfam和InterPro注释。完成染色体构建：Hi-C染色体定位；组装序列染色体群组划分；组装序列各群组内排序；组装序列各群组内定向；全基因组circos圈图( TE,gene,GC,共线性）评估；共线性评估；热图评估。 4.项目周期：45天 |
| 售后服务 | 要求公司技术人员能及时回复（提出12h之内）并尽快解决项目组成员提出的相关技术问题。; |
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