各参选企业：
因工作需要，拟采购致病菌全基因组测序和宏基因组测序服务，欢迎符合要求的企业积极参加评选，比选要求如下：
一、参选公司资质要求
（一）投标人须提供以下资质材料：
1.企业营业执照[副本]复印件；
2.法定代表人身份证明材料复印件；
3.法人代表授权书原件及被授权人的身份证复印件（非法定代表人参选时提供；需法定代表人及被授权人双方签字或签章）。
4.服务商实验室需有一级及以上生物安全实验室备案。
（二）投标人须提供如下承诺函原件：
1.具有独立承担民事责任的能力的合法供应商；
2.具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；
3.具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；
4.近三年内在经营活动中无重大违法记录；
5.具备履行合同所必需的设备和专业技术能力的证明材料；
6.具备法律、行政法规规定的其他条件。
7.参加比选活动前三年内，供应商单位及其现任法定代表人、主要负责人不得具有行贿犯罪记录。
（上述资质材料均需加盖企业鲜章并胶装成册；如有涉及签字盖章，需提供完整签字盖章页；供应商未提供或提供不完整视为资格不能满足本项目要求）
二、项目预算
预算*元，最高限价*元。
采购清单

序号	标的名称	数量	计量 单位	预算单价限价 （元）	预算总价 （元）	是否进口
1	致病菌全基因组测序服务	200	株	150	*	否
2	宏基因组（DNA）测序与分析服务	100	份	500	*	否

注：采购数量致病菌200株，样本100份，总预算固定，请各供应商报单价（不得超过预算单价限价）。
三、项目概述
为持续做好疾病监测和应对工作，加强微生物室致病菌全基因组二代测序及样本宏基因组的便利性和规范性，提高测序经费的使用效益，故需统一采购二代测序服务以及宏基因组测序服务。
四、技术要求
第1包：致病菌全基因组二代测序服务

参数性质	序号	技术参数与性能指标
▲	1	样品接收：采购人提供灭活菌株或菌株核酸样品，供应商配备专人负责菌株/样品的收集及运输，根据采购人需求实时收取样品，菌株/样品需采用干冰进行运输，保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。
	2	检测设备技术：供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序，能完成双端150bp及以上测序，为确保测序数据的稳定性，供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序。
★	3	数据要求： PE150（双端测序，单向读长150bp）及以上测序。交付数据包括原始数据（rawdata）和拼接后数据（cleandata），原始数据格式为fastq，原始数据量（碱基数）≥1.5G，Q20高质量数据量（Clean data）≥1G，碱基数据质量值Q30比例≥85%，单碱基错误率低于十万分之一。拼接后数据格式为fasta。拼接后数据Scaffold数量<100个，Contig数量<200个。覆盖度要求碱基类型分布均匀，无GC分离；基因组10×覆盖度≥95%，基因区覆盖度≥98%，平均覆盖深度≥100×。
▲	4	质控要求： 每批样品收到后应立即开始核酸提取、质量检测等相应工作，进行样品浓度检测和核酸样品完整性检测，核酸样品自收到之日起，于3日内提供当批样品质量检测报告（份数按采购人要求提供）。核酸样品质量检测结果：浓度不低于5ng/ul、总量不低于100ng，无严重RNA污染、无明显降解的样品，均为合格样品，非特殊情况，不得要求重新送样。核酸提取失败的灭活菌株样品，供应商需加测或者重测。
▲	5	质控要求：文库长度250-350bp，对构建好的文库进行质量和产量的检测。
▲	6	每批样品自质量检测合格采购人回复之日起，10个工作日内交付数据。结果（包含原始数据、拼接后数据）遵照生物安全和信息保密相关规定按采购人要求发往指定服务地点。使用方有权要求供应商提供本服务检测过程中的任何相关数据。 如遇样品质量检测合格，测序污染、失败等情况，供应商需立即启动加测，并于20日内交付全部加测样品的数据，如超过20日，则该批次样品不另外收取费用。
★	7	其他服务要求 （1）供应商需按照《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》相关要求履行服务，保证信息安全，承诺函内容应包含下述内容：不可将样本及与样本有关信息透露给第三方及境外组织，保证生物安全。样品检测过程中造成的损失、污染、生物危害相关等问题，后果均由服务商承担。 （2）供应商提供的实验室需提供无任何外资、合资成份及外国员工，并保证今后不接受任何外资、合资加入。以上情况后果均由服务商承担。 （3）供应商根据服务方需求，提供现场技术服务。 （4）运输：服务商负责样本运输，运输工具必须具备冷链运输的资质；运输过程中造成的损失、污染相关等问题，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。（提供承诺函原件加盖供应商公章，格式格式见第三章“三、技术和商务投标文件格式范本”中的“（十二）保密承诺函（第2包适用）。 （5）服务地点：为方便样本运输，供应商检测地点应为 (略) 。

第二包：宏基因组（DNA）测序与分析服务

参数性质	序号	技术参数与性能指标
	1	宏基因组（DNA）样本接收：采购人提供原始样品，供应商配备专人负责样品的收集及运输，根据采购人需求实时收取样品，样品均需采用干冰进行运输，保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。
	2	宏基因组（DNA） (略) 和策略： (略) ，能完成双端PE150测序及以上测序，为确保测序数据的稳定性，供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序。
	3	宏基因组（DNA）测序质量：碱基质量均达到Q30（99.9%）≥85%；（提供同类项目报告复印件，报告内容包括碱基质量Q30，并加盖供应商鲜章）
	4	宏基因组（DNA）测序数据统计与质控：均需进行原始序列统计，质控后序列统计，去宿主后序列统计，每份样品数据产出统计。
▲	5	宏基因组（DNA）交付数据：均需包括原始数据（rawdata，数据格式为fastq），质控后数据（cleandata，数据格式为fastq）和拼接后数据（数据格式为fasta）。
▲	6	宏基因组质控要求：每批样品收到后应立即开始DNA提取、质量检测等相应工作，使用电泳方法进行核酸样品完整性检测，使用Qubit进行样品浓度检测；DNA提取失败的样品，供应商不收取费用；样品DNA质量检测结果，浓度或总量满足建库条件，无严重RNA污染、无明显降解的样品，均为合格样品，非特殊情况，不得要求重新送样；上机测序前，对构建好的文库进行质量检测。（提供同类项目报告复印件，报告内容包括样品浓度检测报告和文库质量检测报告，并加盖供应商鲜章）
	7	供应商提供核酸提取、文库制备、测序和报告解读的全流程服务。
★	8	（1）保密要求：供应商应遵守国家法律法规，高度重视安全保密工作，供应商需提供承诺函（提供承诺函原件加盖供应商公章，格式见第三章“三、技术和商务投标文件格式范本”中的“（十）保密承诺函（第1包适用）”），承诺函内容应包含下述内容：不透露采购人及采购人系统中的数据信息；不得将样本及与样本有关信息转交于第三方及境外组织等。 （2）数据的交付与保存：供应商成交后，对于宏基因组测序，需在接收到样本30个工作日内完成该批次所有样本检测与交付；提供每份样本收费明细，以此作为付款凭证。提供3个月样本与核酸保存服务，根据采购人需求，在协商周期内返还剩余样本及核酸；下机数据同时采用移 (略) 络下载的方式进行交付，网络下载方式数据下载期限不低于30天；测序下机后的原始数据供应商需保存三年。 （3）项目验收 a.出具专业报告，样本浓度和文库浓度检测报告；下机原始数据及碱基评估报告。 b.数据量要求 宏基因组测序，原始数据量（碱基数）≥6G，单个样本数据量（reads数）≥20M，碱基数据质量值Q30比例≥85%。 DNA-宏病毒测序：原始数据量（碱基数）≥6G，单个样本数据量（reads数）≥20M，碱基数据质量值Q30比例≥85%。 RNA-宏病毒测序：原始数据量（碱基数）≥6G，单个样本数据量（reads数）≥20M，碱基数据质量值Q30比例≥85%。 对符合建库要求的样品，如测序失败，或测序数据量未达标，供应商需提供加测或者重测。对qPCR已判定为阳性的样本，如测序后未获得相应序列信息，亦视为测序失败。 （4）技术指导：供应商应根据采购人要求，到采购人指定地点进行技术支持。 （5）运输：供应商负责样本运输，运输工具需具备冷链运输资质；运输过程中造成的损失、污染相关等问题，后果均由供应商承担。运输费用由供应商承担。

*五、 安全保密要求（实质性要求，在响应文件出具相应承诺函）
成交供应商应遵守国家法律法规，高度重视安全保密工作，成交供应商须与采购人签署保密协议，保密协议中应包含且不局限下述内容：不透露采购人及采购人系统中的数据信息；不得将采购方样本及其相关数据转交于第三方及境外组织等。
*六、商务要求
（一）凡样品在检测过程中发生污染、事故等各类纠纷，相关费用及其他后果均由成交供应商承担。
（二）运输：用户负责样品运输；运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由运输服务商承担。
（三） 服务商检测地点为 (略) （方便样本运输）。
（四）结果反馈时间、地点和数量。
1.合同签订后，用户根据具体需求分批次把样品交付给服务商，收到样品后按照合同要求时间交付相应结果。
2.结果（含检测序列和剩余样本）遵照生物安全和信息保密相关规定按用户要求发往指定服务地点。
（五）使用方有权要求服务商提供本服务检测过程中的任何相关数据。
（六）付款方式：
按需求完成测序服务后分批次结算，具体批次合同中约定。完成每批次服务，采购人接到中选供应商通知与票据凭证资料以后，按照资金支付有关规定，向中选供应商支付该批次价款。中选供应商须向采购人出具合法有效完整的完税发票及凭证资料进行支付结算。
注：*号项为实质性要求，须在响应文件做出完全响应，未完全响应、不满足则视为参选无效。
（七）报价格式

标的名称	计量单位	单价（元）	预算总价（元）
致病菌全基因组测序服务	株		*
宏基因组（DNA）测序与分析服务	份		*

*注：采购数量致病菌于200株，样本100份，总预算固定，请各供应商报单价（不得超过预算单价限价）。
七、评选标准：
综合评分法（附后）
八、样品及材料报送要求
(略) 根据项目要求提供相关资料及报价（资质材料一份，响应材料一式三份，一正两副；需加盖鲜章，胶装并密封）可邮寄，于2024年9月26日下午17:00 (略) 疾控中心后勤保障科谭老师，过时将不再接受资料报送。(开标时间：2024年9月29日上午9：30。开标地点：疾控中心五楼会议室)
资料邮寄地址： (略) 疾病预防控制中心， (略) 16号，资料报送电话：* *


评选标准：

序号	评分因素	分值	评分标准	说明
1	报价	12	满足比选文件要求且价格最低的比选单价报价为评审基准价，其价格分为满分。其他供应商的价格分统一按照下列公式计算：比选报价得分=(评审单价基准价／投标单价报价)×12分。	得分四舍五入，保留小数点后两位。本项目单价决定数量，各供应商报价以单价计算。
2	技术要求	70	完全符合比选文件技术要求没有负偏离的得70分。“▲”号参数每有一条负偏离的扣18分；非“▲”参数每有一条负偏离的扣4分，扣完为止。
3	履约能力	18	2024年来具有投标产品业绩的每有1个，得6分，最多得18分。提供虚假业绩证明材料，投标无效。	提供2024年以来的致病菌全基因组和样本宏基因组测序与分析同类服务合同，每份合同的检测量在50人份及以上，须附上产品合同或中标通知书复印件（加盖鲜章）

各参选企业：
因工作需要，拟采购致病菌全基因组测序和宏基因组测序服务，欢迎符合要求的企业积极参加评选，比选要求如下：
一、参选公司资质要求
（一）投标人须提供以下资质材料：
1.企业营业执照[副本]复印件；
2.法定代表人身份证明材料复印件；
3.法人代表授权书原件及被授权人的身份证复印件（非法定代表人参选时提供；需法定代表人及被授权人双方签字或签章）。
4.服务商实验室需有一级及以上生物安全实验室备案。
（二）投标人须提供如下承诺函原件：
1.具有独立承担民事责任的能力的合法供应商；
2.具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；
3.具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；
4.近三年内在经营活动中无重大违法记录；
5.具备履行合同所必需的设备和专业技术能力的证明材料；
6.具备法律、行政法规规定的其他条件。
7.参加比选活动前三年内，供应商单位及其现任法定代表人、主要负责人不得具有行贿犯罪记录。
（上述资质材料均需加盖企业鲜章并胶装成册；如有涉及签字盖章，需提供完整签字盖章页；供应商未提供或提供不完整视为资格不能满足本项目要求）
二、项目预算
预算*元，最高限价*元。
采购清单

序号	标的名称	数量	计量 单位	预算单价限价 （元）	预算总价 （元）	是否进口
1	致病菌全基因组测序服务	200	株	150	*	否
2	宏基因组（DNA）测序与分析服务	100	份	500	*	否

注：采购数量致病菌200株，样本100份，总预算固定，请各供应商报单价（不得超过预算单价限价）。
三、项目概述
为持续做好疾病监测和应对工作，加强微生物室致病菌全基因组二代测序及样本宏基因组的便利性和规范性，提高测序经费的使用效益，故需统一采购二代测序服务以及宏基因组测序服务。
四、技术要求
第1包：致病菌全基因组二代测序服务

参数性质	序号	技术参数与性能指标
▲	1	样品接收：采购人提供灭活菌株或菌株核酸样品，供应商配备专人负责菌株/样品的收集及运输，根据采购人需求实时收取样品，菌株/样品需采用干冰进行运输，保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。
	2	检测设备技术：供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序，能完成双端150bp及以上测序，为确保测序数据的稳定性，供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序。
★	3	数据要求： PE150（双端测序，单向读长150bp）及以上测序。交付数据包括原始数据（rawdata）和拼接后数据（cleandata），原始数据格式为fastq，原始数据量（碱基数）≥1.5G，Q20高质量数据量（Clean data）≥1G，碱基数据质量值Q30比例≥85%，单碱基错误率低于十万分之一。拼接后数据格式为fasta。拼接后数据Scaffold数量<100个，Contig数量<200个。覆盖度要求碱基类型分布均匀，无GC分离；基因组10×覆盖度≥95%，基因区覆盖度≥98%，平均覆盖深度≥100×。
▲	4	质控要求： 每批样品收到后应立即开始核酸提取、质量检测等相应工作，进行样品浓度检测和核酸样品完整性检测，核酸样品自收到之日起，于3日内提供当批样品质量检测报告（份数按采购人要求提供）。核酸样品质量检测结果：浓度不低于5ng/ul、总量不低于100ng，无严重RNA污染、无明显降解的样品，均为合格样品，非特殊情况，不得要求重新送样。核酸提取失败的灭活菌株样品，供应商需加测或者重测。
▲	5	质控要求：文库长度250-350bp，对构建好的文库进行质量和产量的检测。
▲	6	每批样品自质量检测合格采购人回复之日起，10个工作日内交付数据。结果（包含原始数据、拼接后数据）遵照生物安全和信息保密相关规定按采购人要求发往指定服务地点。使用方有权要求供应商提供本服务检测过程中的任何相关数据。 如遇样品质量检测合格，测序污染、失败等情况，供应商需立即启动加测，并于20日内交付全部加测样品的数据，如超过20日，则该批次样品不另外收取费用。
★	7	其他服务要求 （1）供应商需按照《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》相关要求履行服务，保证信息安全，承诺函内容应包含下述内容：不可将样本及与样本有关信息透露给第三方及境外组织，保证生物安全。样品检测过程中造成的损失、污染、生物危害相关等问题，后果均由服务商承担。 （2）供应商提供的实验室需提供无任何外资、合资成份及外国员工，并保证今后不接受任何外资、合资加入。以上情况后果均由服务商承担。 （3）供应商根据服务方需求，提供现场技术服务。 （4）运输：服务商负责样本运输，运输工具必须具备冷链运输的资质；运输过程中造成的损失、污染相关等问题，后果均由服务商承担。运输费用由服务商承担。（提供承诺函原件加盖供应商公章，格式格式见第三章“三、技术和商务投标文件格式范本”中的“（十二）保密承诺函（第2包适用）。 （5）服务地点：为方便样本运输，供应商检测地点应为 (略) 。

第二包：宏基因组（DNA）测序与分析服务

参数性质	序号	技术参数与性能指标
	1	宏基因组（DNA）样本接收：采购人提供原始样品，供应商配备专人负责样品的收集及运输，根据采购人需求实时收取样品，样品均需采用干冰进行运输，保障实验室样品的质量不因运输过程而受损。
	2	宏基因组（DNA） (略) 和策略： (略) ，能完成双端PE150测序及以上测序，为确保测序数据的稳定性，供应商应使用固定型号的测序仪器进行测序。
	3	宏基因组（DNA）测序质量：碱基质量均达到Q30（99.9%）≥85%；（提供同类项目报告复印件，报告内容包括碱基质量Q30，并加盖供应商鲜章）
	4	宏基因组（DNA）测序数据统计与质控：均需进行原始序列统计，质控后序列统计，去宿主后序列统计，每份样品数据产出统计。
▲	5	宏基因组（DNA）交付数据：均需包括原始数据（rawdata，数据格式为fastq），质控后数据（cleandata，数据格式为fastq）和拼接后数据（数据格式为fasta）。
▲	6	宏基因组质控要求：每批样品收到后应立即开始DNA提取、质量检测等相应工作，使用电泳方法进行核酸样品完整性检测，使用Qubit进行样品浓度检测；DNA提取失败的样品，供应商不收取费用；样品DNA质量检测结果，浓度或总量满足建库条件，无严重RNA污染、无明显降解的样品，均为合格样品，非特殊情况，不得要求重新送样；上机测序前，对构建好的文库进行质量检测。（提供同类项目报告复印件，报告内容包括样品浓度检测报告和文库质量检测报告，并加盖供应商鲜章）
	7	供应商提供核酸提取、文库制备、测序和报告解读的全流程服务。
★	8	（1）保密要求：供应商应遵守国家法律法规，高度重视安全保密工作，供应商需提供承诺函（提供承诺函原件加盖供应商公章，格式见第三章“三、技术和商务投标文件格式范本”中的“（十）保密承诺函（第1包适用）”），承诺函内容应包含下述内容：不透露采购人及采购人系统中的数据信息；不得将样本及与样本有关信息转交于第三方及境外组织等。 （2）数据的交付与保存：供应商成交后，对于宏基因组测序，需在接收到样本30个工作日内完成该批次所有样本检测与交付；提供每份样本收费明细，以此作为付款凭证。提供3个月样本与核酸保存服务，根据采购人需求，在协商周期内返还剩余样本及核酸；下机数据同时采用移 (略) 络下载的方式进行交付，网络下载方式数据下载期限不低于30天；测序下机后的原始数据供应商需保存三年。 （3）项目验收 a.出具专业报告，样本浓度和文库浓度检测报告；下机原始数据及碱基评估报告。 b.数据量要求 宏基因组测序，原始数据量（碱基数）≥6G，单个样本数据量（reads数）≥20M，碱基数据质量值Q30比例≥85%。 DNA-宏病毒测序：原始数据量（碱基数）≥6G，单个样本数据量（reads数）≥20M，碱基数据质量值Q30比例≥85%。 RNA-宏病毒测序：原始数据量（碱基数）≥6G，单个样本数据量（reads数）≥20M，碱基数据质量值Q30比例≥85%。 对符合建库要求的样品，如测序失败，或测序数据量未达标，供应商需提供加测或者重测。对qPCR已判定为阳性的样本，如测序后未获得相应序列信息，亦视为测序失败。 （4）技术指导：供应商应根据采购人要求，到采购人指定地点进行技术支持。 （5）运输：供应商负责样本运输，运输工具需具备冷链运输资质；运输过程中造成的损失、污染相关等问题，后果均由供应商承担。运输费用由供应商承担。

*五、 安全保密要求（实质性要求，在响应文件出具相应承诺函）
成交供应商应遵守国家法律法规，高度重视安全保密工作，成交供应商须与采购人签署保密协议，保密协议中应包含且不局限下述内容：不透露采购人及采购人系统中的数据信息；不得将采购方样本及其相关数据转交于第三方及境外组织等。
*六、商务要求
（一）凡样品在检测过程中发生污染、事故等各类纠纷，相关费用及其他后果均由成交供应商承担。
（二）运输：用户负责样品运输；运输过程中造成的损失、污染、及各类纠纷，后果均由运输服务商承担。
（三） 服务商检测地点为 (略) （方便样本运输）。
（四）结果反馈时间、地点和数量。
1.合同签订后，用户根据具体需求分批次把样品交付给服务商，收到样品后按照合同要求时间交付相应结果。
2.结果（含检测序列和剩余样本）遵照生物安全和信息保密相关规定按用户要求发往指定服务地点。
（五）使用方有权要求服务商提供本服务检测过程中的任何相关数据。
（六）付款方式：
按需求完成测序服务后分批次结算，具体批次合同中约定。完成每批次服务，采购人接到中选供应商通知与票据凭证资料以后，按照资金支付有关规定，向中选供应商支付该批次价款。中选供应商须向采购人出具合法有效完整的完税发票及凭证资料进行支付结算。
注：*号项为实质性要求，须在响应文件做出完全响应，未完全响应、不满足则视为参选无效。
（七）报价格式

标的名称	计量单位	单价（元）	预算总价（元）
致病菌全基因组测序服务	株		*
宏基因组（DNA）测序与分析服务	份		*

*注：采购数量致病菌于200株，样本100份，总预算固定，请各供应商报单价（不得超过预算单价限价）。
七、评选标准：
综合评分法（附后）
八、样品及材料报送要求
(略) 根据项目要求提供相关资料及报价（资质材料一份，响应材料一式三份，一正两副；需加盖鲜章，胶装并密封）可邮寄，于2024年9月26日下午17:00 (略) 疾控中心后勤保障科谭老师，过时将不再接受资料报送。(开标时间：2024年9月29日上午9：30。开标地点：疾控中心五楼会议室)
资料邮寄地址： (略) 疾病预防控制中心， (略) 16号，资料报送电话：* *


评选标准：

序号	评分因素	分值	评分标准	说明
1	报价	12	满足比选文件要求且价格最低的比选单价报价为评审基准价，其价格分为满分。其他供应商的价格分统一按照下列公式计算：比选报价得分=(评审单价基准价／投标单价报价)×12分。	得分四舍五入，保留小数点后两位。本项目单价决定数量，各供应商报价以单价计算。
2	技术要求	70	完全符合比选文件技术要求没有负偏离的得70分。“▲”号参数每有一条负偏离的扣18分；非“▲”参数每有一条负偏离的扣4分，扣完为止。
3	履约能力	18	2024年来具有投标产品业绩的每有1个，得6分，最多得18分。提供虚假业绩证明材料，投标无效。	提供2024年以来的致病菌全基因组和样本宏基因组测序与分析同类服务合同，每份合同的检测量在50人份及以上，须附上产品合同或中标通知书复印件（加盖鲜章）