单细胞转录组测序与生信分析
单细胞转录组测序与生信分析
基本信息与申购明细
项目名称: | 单细胞转录组测序与生信分析 | 项目编号: | fjmu# |
采购单位: | 福建医科大学 | 预算金额: | #.00 |
付款方式 | 项目完成,出具结题报告,开具发票后30个工作日内完成付款 |
物品名称: | 单细胞转录组测序与生信分析 | 数量: | 6 | 单位: | 个 | ||
预算单价: | #.00 | 是否标配: | 否 | ||||
申购时间: | 2024-10-14 | 保修期(月): | 12 | ||||
送货地址: | 福建医科大学指定地点 | ||||||
设备清单列表: | |||||||
技术参数: | 一、投标人须知 1、请投标方认真阅读“网上竞价人须知”和“网上竞价使用手册”:http://** 2、请投标方将响应文件及相关证明材料(含附件)盖印签字后扫描上传。将所有扫描的图片粘贴至同一份WORD或PDF文档中,请勿逐个图片上传。 3、报价说明:参照闽财购[2010]18号文件规定,供应商提交报价必须低于公告最高限价3%(不含)以上,否则,视为无效报价。在符合采购需求且报价有效的前提下,投标报价最低值中标(报价相同的,以报价时间优先者中标)。 4、福建医科大学 (略) 相关问题请咨询0591-#。 5、若所投产品中含管理终端、操作系统、数据库等须符合《台式计算机政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕29号)、《便携式计算机政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕30号)、《一体式计算机政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕31号)、《工作站政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕32号)、《通用服务器政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕33号)、《操作系统政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕34号)、《数据库政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕35号)的相关规定(http://**),且其CPU、操作系统、集中式数据库应符合安全可靠测评要求(http://**_#.html),投标人应提供相应佐证材料。 二、技术参数: 一、待检测样本类型:人或小鼠组织。 (略) 理方法:流式分选法:从样本中通过流式分选获取CD45阴性细胞进行单细胞转录组分析。或者磁珠分选法:从样本中分选CD45阴性细胞进行单细胞转录组分析。 二、实验标准: (1) 组织解离要求:细胞活性>85%,结团率<10%,细胞浓度范围为700~1200cells/μL,细胞直径范围<40μm,有核率>70%。 (2)数据产出质量和数量要求:单细胞转录组测序数据量大于90G,Q30>85%,测序数据基因组比对率≥85%,细胞平均reads>20k。 (3)平台要求:包括10X Genomics Chromium Controller仪器、10x Genomics Chromium X仪器、Countstar Rigel S2 智能细胞分析仪、Illumina NovaSeq X plus测序仪。 三、分析标准: (1)单细胞亚群分类与分类结果可视化; (2)样本/Cluster细胞构成比例分析; (3)细胞类型定义; (4)Marker基因分析及展示; (5)功能富集分析; (6)目标细胞亚群细分,细胞亚群降维聚类分析,亚群特征基因分析,亚群注释分析; (7)Monocle2拟时序分析; (8)具备单细胞个性化分析能力,包括Monocle3拟时序分析,RNA速率分析,细胞通讯分析,WGCNA分析,SCINIC转录因子分析,单细胞CNV分析等。 四、项目周期:样本服务周期不超过25个工作日。 五、项目结果交付形式:HTML+ (略) +PDF静态(交互结果可插入报告)。 六、云平台要求:能够提供高级单细胞转录组云分析流程,云平台必须拥有完善的资料体系,综述、FAQ、文献案例解析、视频教程、分析Tips五位一体; | ||||||
售后服务要求: | 一、售后服务要求 1、投标方需定期进行项目进展汇报,使采购方及时掌握项目进度。在项目进展环节,提供实时且透明化的项目进展情况反馈服务。 2、截止采购方发表本项目主体部分论文为止,投标方需积极配合解决相关数据结果的问题并提出可行性建议。 3、投标方需配备至少2名相应技术人员对项目做售前、售后的技术指导及支持,硕士学位及以上学历,具有3年及以上相关工作经验。 4、投标方需提供24小时售后服务,采购方 (略) 、邮件、电话与相应的技术人员沟通交流。对 (略) 限于:电话、邮件、微信群、腾讯会议、现场拜访等。 5、针对项目提出的相关问题,投标方需2小时内电话或邮件回复;双方商定解决方案后,24小时内给出进展反馈。 6、投标方应提供不少于一次的测序数据解读、云平台使用等相关技术培训,积极配合招标方进行后期样本分析及样本回溯,提供2年以上的售后服务支持。 7、投标方应详细列出售后服务中心地址、电话、负责人和服务组织机构。必须保证针对本项目有单独建立的服务档案,使用、维护情况必须得到完整的记录,以保证提供的售后服务准确、周到、及时。
1、样品制备:#方在收到样本后,3-5个工作日将质检结果发送给#方。待#方确认后开始正式实验(时间视具体样品数量及特点而定,单细胞核测序可能会适当延后1-2个工作日)。 2、建库测序:#方在获得#方确认样品合格后15-20个工作日内完成测序工作。 3、生物信息学分析:#方在完成测序工作并确认样本分组后10-15个工作日(12个样品以下,更多样品视具体工作量而定)完成标准生物信息学分析。8-12个工作日完成高级生物信息学分析(视具体工作量而定)。 4、如因为#方样本经#方检测不符合实验要求,#方有义务及时将信息反馈给#方,待#方重新送样检测合格后进行实验。 四、交货详细地点:以电 (略) 账号和交互式云分析结果,并提供纸质版结题报告。 五、报价方式、付款方式及其他要求 1、报价方式 :#方按照#方要求提供盖公章的报价文件。 2、投标报价需包含样品运输干冰,快递一切费用。。 3、付款方式:项目完成,出具结题报告,开具发票后30个工作日内完成付款。 备注:由于实验中存在的不确定因素,即使样品质检合格,#方仍不能保证实验100%的成功,双方愿意达成下述共识:若样品质检合格,实验意外失败(未达到#方对实验结果的质控标准),#方为#方继续进行重复试验,不另计费用,但需要#方继续提供样品。若重复实验成功,并且成功结题交付分析结果及原始数据,#方将项目所有款项汇入#方指定帐户;若#方不能继续提供样品,则##双方重新签订合同支付实验前期产生费用(试剂耗材物料费、 (略) 理费、送样费用)。 4、验收要求: 1.结果内容:#方完成合同中约定的内容。 2.结果发送:若为交互式云分析项目,则结果发送方式为:#方在完成本合同约定的工作后,以电 (略) 账号和交互式云分析结果给#方;若非交互式云分析项目,则结果发送方式为:#方在完成本合同约定的工作后,以电子邮件方式发送结题报告给#方,说明项目完成情况。 3.咨询服务:成果交付12个月内,#方有义务向#方提供免费的项目咨询服务。 六、违约责任 1.#方需保证合同在约定期限内完成。如因#方过错导致项目延迟,#方应及时与#方沟通,说明情况并商定合同完成时间。检测分析工作启动后,若因#方问题导致样本损毁,#方可以为#方继续重复试验,不另计技术服务费用。 2.#方需保证提交的结果与合同约定一致。如因#方提供的结果不符合双方约定,#方应重新提供。且#方应保证对其交付给#方的研究成果进行充分、详见的解释,#方需保证实验及数据分析的真实性和可靠性。 3.如果由于机器、试剂等不可预料的原因导致实验结果不合格,#方应及时通知#方并提供相应证据,同时负责重新实验。 七、本标书中 (略) ,可进行必要的咨询和补充说明。 |
基本信息与申购明细
项目名称: | 单细胞转录组测序与生信分析 | 项目编号: | fjmu# |
采购单位: | 福建医科大学 | 预算金额: | #.00 |
付款方式 | 项目完成,出具结题报告,开具发票后30个工作日内完成付款 |
物品名称: | 单细胞转录组测序与生信分析 | 数量: | 6 | 单位: | 个 | ||
预算单价: | #.00 | 是否标配: | 否 | ||||
申购时间: | 2024-10-14 | 保修期(月): | 12 | ||||
送货地址: | 福建医科大学指定地点 | ||||||
设备清单列表: | |||||||
技术参数: | 一、投标人须知 1、请投标方认真阅读“网上竞价人须知”和“网上竞价使用手册”:http://** 2、请投标方将响应文件及相关证明材料(含附件)盖印签字后扫描上传。将所有扫描的图片粘贴至同一份WORD或PDF文档中,请勿逐个图片上传。 3、报价说明:参照闽财购[2010]18号文件规定,供应商提交报价必须低于公告最高限价3%(不含)以上,否则,视为无效报价。在符合采购需求且报价有效的前提下,投标报价最低值中标(报价相同的,以报价时间优先者中标)。 4、福建医科大学 (略) 相关问题请咨询0591-#。 5、若所投产品中含管理终端、操作系统、数据库等须符合《台式计算机政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕29号)、《便携式计算机政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕30号)、《一体式计算机政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕31号)、《工作站政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕32号)、《通用服务器政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕33号)、《操作系统政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕34号)、《数据库政府采购需求标准(2023年版)》(财库〔2023〕35号)的相关规定(http://**),且其CPU、操作系统、集中式数据库应符合安全可靠测评要求(http://**_#.html),投标人应提供相应佐证材料。 二、技术参数: 一、待检测样本类型:人或小鼠组织。 (略) 理方法:流式分选法:从样本中通过流式分选获取CD45阴性细胞进行单细胞转录组分析。或者磁珠分选法:从样本中分选CD45阴性细胞进行单细胞转录组分析。 二、实验标准: (1) 组织解离要求:细胞活性>85%,结团率<10%,细胞浓度范围为700~1200cells/μL,细胞直径范围<40μm,有核率>70%。 (2)数据产出质量和数量要求:单细胞转录组测序数据量大于90G,Q30>85%,测序数据基因组比对率≥85%,细胞平均reads>20k。 (3)平台要求:包括10X Genomics Chromium Controller仪器、10x Genomics Chromium X仪器、Countstar Rigel S2 智能细胞分析仪、Illumina NovaSeq X plus测序仪。 三、分析标准: (1)单细胞亚群分类与分类结果可视化; (2)样本/Cluster细胞构成比例分析; (3)细胞类型定义; (4)Marker基因分析及展示; (5)功能富集分析; (6)目标细胞亚群细分,细胞亚群降维聚类分析,亚群特征基因分析,亚群注释分析; (7)Monocle2拟时序分析; (8)具备单细胞个性化分析能力,包括Monocle3拟时序分析,RNA速率分析,细胞通讯分析,WGCNA分析,SCINIC转录因子分析,单细胞CNV分析等。 四、项目周期:样本服务周期不超过25个工作日。 五、项目结果交付形式:HTML+ (略) +PDF静态(交互结果可插入报告)。 六、云平台要求:能够提供高级单细胞转录组云分析流程,云平台必须拥有完善的资料体系,综述、FAQ、文献案例解析、视频教程、分析Tips五位一体; | ||||||
售后服务要求: | 一、售后服务要求 1、投标方需定期进行项目进展汇报,使采购方及时掌握项目进度。在项目进展环节,提供实时且透明化的项目进展情况反馈服务。 2、截止采购方发表本项目主体部分论文为止,投标方需积极配合解决相关数据结果的问题并提出可行性建议。 3、投标方需配备至少2名相应技术人员对项目做售前、售后的技术指导及支持,硕士学位及以上学历,具有3年及以上相关工作经验。 4、投标方需提供24小时售后服务,采购方 (略) 、邮件、电话与相应的技术人员沟通交流。对 (略) 限于:电话、邮件、微信群、腾讯会议、现场拜访等。 5、针对项目提出的相关问题,投标方需2小时内电话或邮件回复;双方商定解决方案后,24小时内给出进展反馈。 6、投标方应提供不少于一次的测序数据解读、云平台使用等相关技术培训,积极配合招标方进行后期样本分析及样本回溯,提供2年以上的售后服务支持。 7、投标方应详细列出售后服务中心地址、电话、负责人和服务组织机构。必须保证针对本项目有单独建立的服务档案,使用、维护情况必须得到完整的记录,以保证提供的售后服务准确、周到、及时。
1、样品制备:#方在收到样本后,3-5个工作日将质检结果发送给#方。待#方确认后开始正式实验(时间视具体样品数量及特点而定,单细胞核测序可能会适当延后1-2个工作日)。 2、建库测序:#方在获得#方确认样品合格后15-20个工作日内完成测序工作。 3、生物信息学分析:#方在完成测序工作并确认样本分组后10-15个工作日(12个样品以下,更多样品视具体工作量而定)完成标准生物信息学分析。8-12个工作日完成高级生物信息学分析(视具体工作量而定)。 4、如因为#方样本经#方检测不符合实验要求,#方有义务及时将信息反馈给#方,待#方重新送样检测合格后进行实验。 四、交货详细地点:以电 (略) 账号和交互式云分析结果,并提供纸质版结题报告。 五、报价方式、付款方式及其他要求 1、报价方式 :#方按照#方要求提供盖公章的报价文件。 2、投标报价需包含样品运输干冰,快递一切费用。。 3、付款方式:项目完成,出具结题报告,开具发票后30个工作日内完成付款。 备注:由于实验中存在的不确定因素,即使样品质检合格,#方仍不能保证实验100%的成功,双方愿意达成下述共识:若样品质检合格,实验意外失败(未达到#方对实验结果的质控标准),#方为#方继续进行重复试验,不另计费用,但需要#方继续提供样品。若重复实验成功,并且成功结题交付分析结果及原始数据,#方将项目所有款项汇入#方指定帐户;若#方不能继续提供样品,则##双方重新签订合同支付实验前期产生费用(试剂耗材物料费、 (略) 理费、送样费用)。 4、验收要求: 1.结果内容:#方完成合同中约定的内容。 2.结果发送:若为交互式云分析项目,则结果发送方式为:#方在完成本合同约定的工作后,以电 (略) 账号和交互式云分析结果给#方;若非交互式云分析项目,则结果发送方式为:#方在完成本合同约定的工作后,以电子邮件方式发送结题报告给#方,说明项目完成情况。 3.咨询服务:成果交付12个月内,#方有义务向#方提供免费的项目咨询服务。 六、违约责任 1.#方需保证合同在约定期限内完成。如因#方过错导致项目延迟,#方应及时与#方沟通,说明情况并商定合同完成时间。检测分析工作启动后,若因#方问题导致样本损毁,#方可以为#方继续重复试验,不另计技术服务费用。 2.#方需保证提交的结果与合同约定一致。如因#方提供的结果不符合双方约定,#方应重新提供。且#方应保证对其交付给#方的研究成果进行充分、详见的解释,#方需保证实验及数据分析的真实性和可靠性。 3.如果由于机器、试剂等不可预料的原因导致实验结果不合格,#方应及时通知#方并提供相应证据,同时负责重新实验。 七、本标书中 (略) ,可进行必要的咨询和补充说明。 |
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