重庆医科大学附属妇女儿童医院外检服务项目需求公告
(略) (略)
(重庆医科大学附属 (略) )
外检服务项目需求公告
(略) 工作需要,我院目前对以下外检服务项目有需求,现将有关事项公告如下。
一、项目内容
名称 | 数量 | 备注 |
新生儿及儿童多种遗传病基因检测 |
二、项目要求
1. 服务供应商应具有良好的商业信誉和财务状况,能够独立承担民事责任能力。
2. 供应商报名时须提供包括但不限于以下资质证明文件原件或复印件(复印件必须加盖单位公章),并保证以下资料的合法性、真实性和有效性。
(1)报名资料封面:推荐项目的名称、厂商、地址、联系人姓名、联系人电话(手机+座机)、邮箱地址。
(2)行业内应用该项目的标志性用户单位名称、联系人姓名和电话号码。
(3)供应商《营业执照》、《医疗机构执业许可证》、企业法定代表人身份证明和授权委托书(需明确授权范围)等,代理商还应提供产品代理授权书。
(4)实验室开展相关检测技术和项目的医学检验资质证明,以及从事相应检验工作人员的学历和技术资质证明(实验室负责人至少应具备临床检验中级及以上专业技术职称)。
(5)项目彩页资料。
(6)实验室代表性成果和特色(如果有),包括但不限于课题、论著、论文、专利、科技奖励等。
3. 技术要求:
(1)实验室成立5年以上,具备第三方医学检验所资质,拥有高通量测序仪、PCR扩增实验室等必需实验条件,具备对高通量测序数据进行生物信息分析及遗传解读的能力;建立成熟的实验室质量控制体系,并提供完善的室内质控方案。
(2)试剂盒需包括核酸提取试剂和测序反应通用试剂(需提供相应产品注册证或试剂备案证)。
(3)检测范围(可自主选择以下两种或其中一种):
①基因包检测项目:根据国内外新生儿筛查指导意见设计专业的筛查基因包,一次性检测可防可治可早干预的明确单基因遗传病,包含至少150个以上目标基因150种以上疾病亚型(包含氨基酸、有机酸、脂肪酸等小分子遗传代谢病及糖原贮积症、溶酶体病等大分子遗传代谢病;常见血液病如地中海贫血、G6PD缺乏症、范可尼贫血等;常见神经系统疾病如SMA;常见耳聋致病基因;原发性免疫缺陷病;常见遗传性内分泌、消化、心血管、神经系统、骨骼肌肉、皮肤病等),同时分析所含基因的外显子及相邻50bp的 (略) 中的点突变、小的缺失插入突变(20bp以内),以及外显子水平的缺失重复变异,涵盖致病基因的编码外显子及常见 (略) 已知致病突变。
②全外显子检测项目:一次性检测人类基因组中#多个基因上约#个外显子突变及外显子相邻20bp的 (略) 中的点突变、小的缺失插入突变(20bp以内),以及外显子水平的缺失重复变异,涵盖致病基因的编码外显子及常见 (略) 已知致病突变。同时检测线粒体环基因组全长。解读OMIM数据库中致病机理明确的5,800多种疾病。
(4)数据解读:
①数据解读规则参考美国医学遗传学和 (略) ACMG及ClinGen相关指南;基因变异注释所用相关数据库(Omim,Clinvar,RefSeq等)需三个月至半年定期进行更新维护。
②已精准解读超过#个致病及疑似致病变异位点。
③对于部分基因外显子的缺失/重复(包括进行性假肥大性肌营养不良DMD基因连续2个外显子及以上的纯合/半合缺失;脊髓性肌肉萎缩症 SMN1基因 7号外显子纯合缺失;地中海贫血HBA/HBB基因 --SEA、-α3.7、-α4.2、Chinese、SEA-HPFH、FIL、THAI大片段缺失;希特林蛋白缺乏症:可检测SLC25A13基因IVS16ins3kb,IVS4ins6kb, c.1638_1660dup这三种特殊变异),为临床提供更全面精准的检测服务。通过针对部分 (略) 域特异位点探针的设计及生物信息学算法的开发,实现基于NGS 技术的 (略) 域的准确检测。
④提供产品配套的生信分析软件,解 (略) 变异数据解析( (略) 的VCF数据分析、解读、报告);可支持客户端完全本地化运行,无需数据回传。信息分析模块可支持样品管理、实验管理、数据管理、报告管理、多种临床检测应用的信息分析、权限设置等功能。信息本地化存储、分析及管理,与网络有物理隔绝。
(5)捕获探针不低于1M,探针设计需采用CCDS、RefSeq、Ensembl、GENCODE、ClinVar等数据库。
(6)新生儿遗传病基因筛查信息分析数据标准:
①基因包检测项目:测序平均深度大于300X,Fastq数据Q20≥90%、Q30≥85%,外 (略) 域覆盖度≥99.5%、20X覆盖度≥98.5%、30X覆盖度≥98%;核基因组有效测序深度≥100X;线粒体有效测序深度≥300X。
②全外显子检测项目:测序数据量不小于15G,Fastq数据Q20≥90%、Q30≥85%,基因组比对率>99%,数据重复率<8%,去重前深度≥150X,全外 (略) 域覆盖度≥99.5%、20X覆盖度≥98.5%、30X覆盖度≥98%,捕获效率> 85%;其中线粒体基因组平均测序深度大于1000X。
(7)本项目检测方法经过临床大样本量验证(≥#例)。
(8)可提供一代测序(Sanger)、q-PCR、STR分析及MLPA等多种验证和补充分析手段,用于检测样本和患者家系的辅助检测。
★备注★:
1.本项目不接受联合体投标,不允许转包。
2.供应商应保证所提供服务的质量,因供应商服务不规范引发的安全问题,造成的法律及经济责任由供应商承担。
三、报名截止时间、地点
1.截止时间:2025年2月14日下午17:00(北京时间),逾期或未按公告要求报名的恕不接受。
2.地点: (略) (略) 1 (略) (略) 医务科403,王老师收。
四、报名材料提交方式
1.提交时间:2025年1月24日-2025年2月14日(工作日)日上午8:30—11:30、下午14:30—17:00。
2.提交材料:按要求准备好资料及封面(格式见附件),且装订好。
五、比选议价(调研)时间、地点
(略) 安排,通过邮件或电话形式再通知,请注意查收邮件、电话。
六、联系方式
联系人:王老师
联系电话:023-#
(略) (略)
(重庆医科大学附属 (略) )
医务科
2025年1月24日
项目报名资料
公司名称(盖章):
联 系 人 姓 名 :
联 系 人 电 话 :
联 系 人 邮 箱 :
年 月 日
(略) (略)
(重庆医科大学附属 (略) )
外检服务项目需求公告
(略) 工作需要,我院目前对以下外检服务项目有需求,现将有关事项公告如下。
一、项目内容
名称 | 数量 | 备注 |
新生儿及儿童多种遗传病基因检测 |
二、项目要求
1. 服务供应商应具有良好的商业信誉和财务状况,能够独立承担民事责任能力。
2. 供应商报名时须提供包括但不限于以下资质证明文件原件或复印件(复印件必须加盖单位公章),并保证以下资料的合法性、真实性和有效性。
(1)报名资料封面:推荐项目的名称、厂商、地址、联系人姓名、联系人电话(手机+座机)、邮箱地址。
(2)行业内应用该项目的标志性用户单位名称、联系人姓名和电话号码。
(3)供应商《营业执照》、《医疗机构执业许可证》、企业法定代表人身份证明和授权委托书(需明确授权范围)等,代理商还应提供产品代理授权书。
(4)实验室开展相关检测技术和项目的医学检验资质证明,以及从事相应检验工作人员的学历和技术资质证明(实验室负责人至少应具备临床检验中级及以上专业技术职称)。
(5)项目彩页资料。
(6)实验室代表性成果和特色(如果有),包括但不限于课题、论著、论文、专利、科技奖励等。
3. 技术要求:
(1)实验室成立5年以上,具备第三方医学检验所资质,拥有高通量测序仪、PCR扩增实验室等必需实验条件,具备对高通量测序数据进行生物信息分析及遗传解读的能力;建立成熟的实验室质量控制体系,并提供完善的室内质控方案。
(2)试剂盒需包括核酸提取试剂和测序反应通用试剂(需提供相应产品注册证或试剂备案证)。
(3)检测范围(可自主选择以下两种或其中一种):
①基因包检测项目:根据国内外新生儿筛查指导意见设计专业的筛查基因包,一次性检测可防可治可早干预的明确单基因遗传病,包含至少150个以上目标基因150种以上疾病亚型(包含氨基酸、有机酸、脂肪酸等小分子遗传代谢病及糖原贮积症、溶酶体病等大分子遗传代谢病;常见血液病如地中海贫血、G6PD缺乏症、范可尼贫血等;常见神经系统疾病如SMA;常见耳聋致病基因;原发性免疫缺陷病;常见遗传性内分泌、消化、心血管、神经系统、骨骼肌肉、皮肤病等),同时分析所含基因的外显子及相邻50bp的 (略) 中的点突变、小的缺失插入突变(20bp以内),以及外显子水平的缺失重复变异,涵盖致病基因的编码外显子及常见 (略) 已知致病突变。
②全外显子检测项目:一次性检测人类基因组中#多个基因上约#个外显子突变及外显子相邻20bp的 (略) 中的点突变、小的缺失插入突变(20bp以内),以及外显子水平的缺失重复变异,涵盖致病基因的编码外显子及常见 (略) 已知致病突变。同时检测线粒体环基因组全长。解读OMIM数据库中致病机理明确的5,800多种疾病。
(4)数据解读:
①数据解读规则参考美国医学遗传学和 (略) ACMG及ClinGen相关指南;基因变异注释所用相关数据库(Omim,Clinvar,RefSeq等)需三个月至半年定期进行更新维护。
②已精准解读超过#个致病及疑似致病变异位点。
③对于部分基因外显子的缺失/重复(包括进行性假肥大性肌营养不良DMD基因连续2个外显子及以上的纯合/半合缺失;脊髓性肌肉萎缩症 SMN1基因 7号外显子纯合缺失;地中海贫血HBA/HBB基因 --SEA、-α3.7、-α4.2、Chinese、SEA-HPFH、FIL、THAI大片段缺失;希特林蛋白缺乏症:可检测SLC25A13基因IVS16ins3kb,IVS4ins6kb, c.1638_1660dup这三种特殊变异),为临床提供更全面精准的检测服务。通过针对部分 (略) 域特异位点探针的设计及生物信息学算法的开发,实现基于NGS 技术的 (略) 域的准确检测。
④提供产品配套的生信分析软件,解 (略) 变异数据解析( (略) 的VCF数据分析、解读、报告);可支持客户端完全本地化运行,无需数据回传。信息分析模块可支持样品管理、实验管理、数据管理、报告管理、多种临床检测应用的信息分析、权限设置等功能。信息本地化存储、分析及管理,与网络有物理隔绝。
(5)捕获探针不低于1M,探针设计需采用CCDS、RefSeq、Ensembl、GENCODE、ClinVar等数据库。
(6)新生儿遗传病基因筛查信息分析数据标准:
①基因包检测项目:测序平均深度大于300X,Fastq数据Q20≥90%、Q30≥85%,外 (略) 域覆盖度≥99.5%、20X覆盖度≥98.5%、30X覆盖度≥98%;核基因组有效测序深度≥100X;线粒体有效测序深度≥300X。
②全外显子检测项目:测序数据量不小于15G,Fastq数据Q20≥90%、Q30≥85%,基因组比对率>99%,数据重复率<8%,去重前深度≥150X,全外 (略) 域覆盖度≥99.5%、20X覆盖度≥98.5%、30X覆盖度≥98%,捕获效率> 85%;其中线粒体基因组平均测序深度大于1000X。
(7)本项目检测方法经过临床大样本量验证(≥#例)。
(8)可提供一代测序(Sanger)、q-PCR、STR分析及MLPA等多种验证和补充分析手段,用于检测样本和患者家系的辅助检测。
★备注★:
1.本项目不接受联合体投标,不允许转包。
2.供应商应保证所提供服务的质量,因供应商服务不规范引发的安全问题,造成的法律及经济责任由供应商承担。
三、报名截止时间、地点
1.截止时间:2025年2月14日下午17:00(北京时间),逾期或未按公告要求报名的恕不接受。
2.地点: (略) (略) 1 (略) (略) 医务科403,王老师收。
四、报名材料提交方式
1.提交时间:2025年1月24日-2025年2月14日(工作日)日上午8:30—11:30、下午14:30—17:00。
2.提交材料:按要求准备好资料及封面(格式见附件),且装订好。
五、比选议价(调研)时间、地点
(略) 安排,通过邮件或电话形式再通知,请注意查收邮件、电话。
六、联系方式
联系人:王老师
联系电话:023-#
(略) (略)
(重庆医科大学附属 (略) )
医务科
2025年1月24日
项目报名资料
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