安徽医科大学2021年09月至2021年11月政府采购意向-安徽医科大学全基因组基因芯片购置及检测服务项目
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安徽医科大学2021年09月至2021年11月政府采购意向-安徽医科大学全基因组基因芯片购置及检测服务项目
| 序号 | 采购项目名称 | 采购需求概况 | 预算金额（万元） | 预计采购时间（填写到月） | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | (略) 全基因组基因芯片购置及检测服务项目 | 标的名称:Illumina基因芯片（GSA）及检测服务标的数量: * 主要功能或目标:Illumina基因芯片（GSA）及检测需满足的要求:1、采购标的名称：Illumina基因芯片（GSA）及检测服务。2、采购标的数量: * 例。3、采购标的需满足的质量、服务、安全、时限等要求：全基因组基因芯片位点采用Tag SNP技术，每张芯片 (略) * 个样本的分型，每个样品有效分型的SNP位点数≥ * 万，且每个位点探针平均检测重数≥ * ，每条探针碱基数≥ * bp；全基因组基因芯片检测时，DNA上样量≤ * ng，全基因 (略) 需具备相同或类似基因芯片的的检测经验，且检测样本≥ * 0例，全基因组基因芯片购置周期不大于 * 个日历日，芯片检测服务周期不大于 * 个工作日，全基因组 (略) 需要基因芯片生产商认证的服务商，全基因组基因芯片检测服务要求可读率（call rate）大于 * %，成功率大于 * %，样本平均SNP可读率（call rate）大于 * %，可重复性（reproducibility）大于 * .5%。4.具体详见本项目采购文件，以采购文件要求为准。 | * .5 | 点击查看>> | 无 |
| 2 | (略) * X人全基因组建库测序分析服务项目 | 标的名称: * X人全基因组建库测序分析服务标的数量: * 主要功能或目标: * X人全基因组建库测序分析需满足的要求:1、采购标的名称： * X人全基因组建库测序分析服务。2、采购标的数量： * 例。3、采购标需满足的质量、服务等要求：使用DNBSEQ国产自主测序平台 (略) 测序，每个样品测序深度 * X，数据目标产出不低于 * GB的raw data。在总数据量达标的情况下，承诺单个样品采集数据量不低于目标数据量的 * %，完成数据过滤。测序策略：PE * 。质量要求：数据质量要求碱基错误率小于0. * 的比例（Q * ）不低于 * %。测序周期不超过2个月。4.采购标需满足的分析要求：（1）去除接头污染和低质量数据（2）数据通过 BWA 与 UCSC hg * (略) 比对（3）进行数据产量统计分析、测序深度分析、覆盖度均 * 性分析（4）SNP 变异信息检测（SAMtools、SOAPsnp、GATK）（5）SNP 的RefGene或ENSEMBL注释（6）SNP 数据库分析（与 dbSNP、千人基因组数据、ESP 外显子组数据库、ENCODE、ClinVar数据库、GWAS数据库、PVFD(BGI，正常人群突变频率数据库)、BGI-GaP（基因型与表型数据库）以及炎黄基因组（仅亚太地区） (略) 数据库注释分析）（7）单样品 SNP 保守性预测、致病性分析（仅针对人类样本，软件：SIFT, PolyPhen2,MutationAssessor,LRT,MutationTaster,FATHMM,RadialSVM, CADD，VEST3，GERP++, phyloP,phastCons,SiPhy）（8）SNP 在各基因功能元件上的分布统计（9）InDel 变异信息检测(SAMtools、GATK)（ * ）InDel 的 RefGene或ENSEMBL注释（ * ）InDel 数据库分析与 dbSNP、千人基因组数据、ESP 外显子组数据库、ENCODE、ClinVar数据库、GWAS数据库、PVFD(BGI，正常人群突变频率数据库)、BGI-GaP（基因型与表型数据库）以及炎黄基因组（仅亚太地区） (略) 数据库注释分析（ * ）InDel 在各基因功能元件上的分布统计（ * ）CNV 变异信息检测(CNVnator)（ * ）CNV的RefGene或ENSEMBL注释。5.具体详见本项目采购文件，以采购文件要求为准。 | * | 点击查看>> | 无 |
| 3 | (略) (略) 蛋白组学检测服务项目 | 标的名称:血浆 Olink Proteomics蛋组学检测项目标的数量: * 主要功能或目标:血浆 Olink Proteomics蛋组学检测需满足的要求:1、采购标的名称：血浆 Olink Proteomics蛋组学检测项目。2、采购标的数量: * 例。3、购标的需满足的质量、服务、安全、时限等要求：检测检测平台使用Fludigm Biomark HD检测系统，检测范围横跨可以 * 个log值，以便同时兼顾不同丰度的蛋白marker，获得的数据以FTP形式释放，检测服务周期不大于 * 个工作日，需成立专门的项目技术支持小组和重点项目联系人对项目相关技术问题和项目交付后的疑 (略) 和解答服务。4.具体详见本项目采购文件，以采购文件要求为准。 | * | 点击查看>> | 无 |
| 序号 | 采购项目名称 | 采购需求概况 | 预算金额（万元） | 预计采购时间（填写到月） | 备注 |
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| 1 | (略) 全基因组基因芯片购置及检测服务项目 | 标的名称:Illumina基因芯片（GSA）及检测服务标的数量: * 主要功能或目标:Illumina基因芯片（GSA）及检测需满足的要求:1、采购标的名称：Illumina基因芯片（GSA）及检测服务。2、采购标的数量: * 例。3、采购标的需满足的质量、服务、安全、时限等要求：全基因组基因芯片位点采用Tag SNP技术，每张芯片 (略) * 个样本的分型，每个样品有效分型的SNP位点数≥ * 万，且每个位点探针平均检测重数≥ * ，每条探针碱基数≥ * bp；全基因组基因芯片检测时，DNA上样量≤ * ng，全基因 (略) 需具备相同或类似基因芯片的的检测经验，且检测样本≥ * 0例，全基因组基因芯片购置周期不大于 * 个日历日，芯片检测服务周期不大于 * 个工作日，全基因组 (略) 需要基因芯片生产商认证的服务商，全基因组基因芯片检测服务要求可读率（call rate）大于 * %，成功率大于 * %，样本平均SNP可读率（call rate）大于 * %，可重复性（reproducibility）大于 * .5%。4.具体详见本项目采购文件，以采购文件要求为准。 | * .5 | 点击查看>> | 无 |
| 2 | (略) * X人全基因组建库测序分析服务项目 | 标的名称: * X人全基因组建库测序分析服务标的数量: * 主要功能或目标: * X人全基因组建库测序分析需满足的要求:1、采购标的名称： * X人全基因组建库测序分析服务。2、采购标的数量： * 例。3、采购标需满足的质量、服务等要求：使用DNBSEQ国产自主测序平台 (略) 测序，每个样品测序深度 * X，数据目标产出不低于 * GB的raw data。在总数据量达标的情况下，承诺单个样品采集数据量不低于目标数据量的 * %，完成数据过滤。测序策略：PE * 。质量要求：数据质量要求碱基错误率小于0. * 的比例（Q * ）不低于 * %。测序周期不超过2个月。4.采购标需满足的分析要求：（1）去除接头污染和低质量数据（2）数据通过 BWA 与 UCSC hg * (略) 比对（3）进行数据产量统计分析、测序深度分析、覆盖度均 * 性分析（4）SNP 变异信息检测（SAMtools、SOAPsnp、GATK）（5）SNP 的RefGene或ENSEMBL注释（6）SNP 数据库分析（与 dbSNP、千人基因组数据、ESP 外显子组数据库、ENCODE、ClinVar数据库、GWAS数据库、PVFD(BGI，正常人群突变频率数据库)、BGI-GaP（基因型与表型数据库）以及炎黄基因组（仅亚太地区） (略) 数据库注释分析）（7）单样品 SNP 保守性预测、致病性分析（仅针对人类样本，软件：SIFT, PolyPhen2,MutationAssessor,LRT,MutationTaster,FATHMM,RadialSVM, CADD，VEST3，GERP++, phyloP,phastCons,SiPhy）（8）SNP 在各基因功能元件上的分布统计（9）InDel 变异信息检测(SAMtools、GATK)（ * ）InDel 的 RefGene或ENSEMBL注释（ * ）InDel 数据库分析与 dbSNP、千人基因组数据、ESP 外显子组数据库、ENCODE、ClinVar数据库、GWAS数据库、PVFD(BGI，正常人群突变频率数据库)、BGI-GaP（基因型与表型数据库）以及炎黄基因组（仅亚太地区） (略) 数据库注释分析（ * ）InDel 在各基因功能元件上的分布统计（ * ）CNV 变异信息检测(CNVnator)（ * ）CNV的RefGene或ENSEMBL注释。5.具体详见本项目采购文件，以采购文件要求为准。 | * | 点击查看>> | 无 |
| 3 | (略) (略) 蛋白组学检测服务项目 | 标的名称:血浆 Olink Proteomics蛋组学检测项目标的数量: * 主要功能或目标:血浆 Olink Proteomics蛋组学检测需满足的要求:1、采购标的名称：血浆 Olink Proteomics蛋组学检测项目。2、采购标的数量: * 例。3、购标的需满足的质量、服务、安全、时限等要求：检测检测平台使用Fludigm Biomark HD检测系统，检测范围横跨可以 * 个log值，以便同时兼顾不同丰度的蛋白marker，获得的数据以FTP形式释放，检测服务周期不大于 * 个工作日，需成立专门的项目技术支持小组和重点项目联系人对项目相关技术问题和项目交付后的疑 (略) 和解答服务。4.具体详见本项目采购文件，以采购文件要求为准。 | * | 点击查看>> | 无 |
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