安徽医科大学2022年3月至4月政府采购意向-8674207
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安徽医科大学2022年3月至4月政府采购意向-8674207
| 序号 | 采购项目名称 | 采购需求概况 | 预算金额（元） | 预计采购时间（填写到月） | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | (略) 80例空间转录组和单细胞RNA-seq测序分析服务项目 | 1、采购标的名称： (略) 80例空间转录组和单细胞RNA-seq测序分析服务。2、采购标的数量：80例。3、购标需满足的质量、服务等要求：使用国产自主测序平台DNBS (略) 测序，空间转录组，完成每个样品的切片制备，优化及文库构建，每个样本产生1条lane的raw data，并完成相应的分析。单细胞RNA-seq每个样品按照分离得到 (略) 文库构建，每个样本产生2条lane的raw data，并完成相应的分析，测序周期不超过3个月。4、购标需满足的分析要求：1）空间转录组测序分析：①测序结果统计②比对结果统计③定量分析④质控（细胞周期因素去除，双胞去除等）⑤spot聚类分析⑥样本间差异基因鉴定⑦spot类别鉴定⑧sopt点位置信息分析⑨差异表达基因GO功能分析⑩差异表达基因Pathway功能分析?差异表达基因TF编码能力预测?差异表达基因蛋白互作分析? (略) 络分析?Reactome富集?GSEA 富集?RNA速率?细胞通讯iTALK?细胞通讯cellphoneDB?细胞轨迹分析?CNV分析。2）单细胞RNA-seq 测序分析：标准分析内容：①测序结果统计②比对结果统计③定量分析④质控（细胞周期因素去除，双胞去除等）⑤细胞聚类分析⑥样本间差异基因鉴定⑦细胞类别鉴定⑧Marker 基因/差异表达基因GO功能分析⑨Marker 基因/差异基因 KEGG Pathway富集⑩细胞通讯分析?细胞轨迹分析3）高级分析内容：①RNA速率②细胞类群自定义聚类③细胞类群注释多种数据库自定义选择④基因功能富集分析-GSEA和Reactome⑤细胞类型与细胞轨迹分析动态交互式分析⑥样本间/细胞类群间差异基因不同维度分析。具体内容详见本项目采购文件采购需求，并以文件需求为准。 | 点击查看>> | * 年03月 |
| 序号 | 采购项目名称 | 采购需求概况 | 预算金额（元） | 预计采购时间（填写到月） | 备注 |
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| 1 | (略) 80例空间转录组和单细胞RNA-seq测序分析服务项目 | 1、采购标的名称： (略) 80例空间转录组和单细胞RNA-seq测序分析服务。2、采购标的数量：80例。3、购标需满足的质量、服务等要求：使用国产自主测序平台DNBS (略) 测序，空间转录组，完成每个样品的切片制备，优化及文库构建，每个样本产生1条lane的raw data，并完成相应的分析。单细胞RNA-seq每个样品按照分离得到 (略) 文库构建，每个样本产生2条lane的raw data，并完成相应的分析，测序周期不超过3个月。4、购标需满足的分析要求：1）空间转录组测序分析：①测序结果统计②比对结果统计③定量分析④质控（细胞周期因素去除，双胞去除等）⑤spot聚类分析⑥样本间差异基因鉴定⑦spot类别鉴定⑧sopt点位置信息分析⑨差异表达基因GO功能分析⑩差异表达基因Pathway功能分析?差异表达基因TF编码能力预测?差异表达基因蛋白互作分析? (略) 络分析?Reactome富集?GSEA 富集?RNA速率?细胞通讯iTALK?细胞通讯cellphoneDB?细胞轨迹分析?CNV分析。2）单细胞RNA-seq 测序分析：标准分析内容：①测序结果统计②比对结果统计③定量分析④质控（细胞周期因素去除，双胞去除等）⑤细胞聚类分析⑥样本间差异基因鉴定⑦细胞类别鉴定⑧Marker 基因/差异表达基因GO功能分析⑨Marker 基因/差异基因 KEGG Pathway富集⑩细胞通讯分析?细胞轨迹分析3）高级分析内容：①RNA速率②细胞类群自定义聚类③细胞类群注释多种数据库自定义选择④基因功能富集分析-GSEA和Reactome⑤细胞类型与细胞轨迹分析动态交互式分析⑥样本间/细胞类群间差异基因不同维度分析。具体内容详见本项目采购文件采购需求，并以文件需求为准。 | 点击查看>> | * 年03月 |
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