序号

采购项目名称

采购需求概况

预算金额

（万元）

预计采购时间

（填写到月）

备注

1

(略) (略) ( (略) )妇产科转录组测序分析业务委托

采购内容:380个人的有参二代转录组数据采集和分析技术开发；采购数量:1项；主要功能或目标:构建二代转录组文库，采用MGI2000平台测序，每个样本测序数据量10G，并进行数据质控，对质控合格的数据进行生物信息学分析；需满足的要求:标准分析1.原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理
2.测序数据产量统计及质量评估
3.比对分析
3.1与参考基因组比对分析
3.2与参考转录本比对分析
3.3样本均一性分析
4.表达水平分析
4.1基因和isoform表达定量分析
4.2基因和isoformPCA分析（限两组或以上样本）
5、表达定量整体质量评估
5.1样本饱和度分析
5.2同组样本间基因和isoform venn图（两个或以上样本）
6、差异表达分析
6.1差异基因和isoform聚类分析（两个或以上样本）
6.2差异表达功能注释及GO、KEGG富集分析（两个或以样本）
6.3差异转录因子分析
7、新转录本预测与注释
高级分析8、lncRNA鉴定
9、蛋白互作分析
10、gemline突变检测
11、可变剪切分析
12、差异可变剪切分析
13、融合基因分析
个性化分析14、WGCNA分析
点击查看>> 模块构建
点击查看>> 模块分析
点击查看>> 模块基因表达模式
点击查看>> 各模块基因GO富集Fenix
点击查看>> 各模块基因KEGG富集分析
15、GSEA富集分析。

19

2022-09

无

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采购项目名称

采购需求概况

预算金额

（万元）

预计采购时间

（填写到月）

备注

1

(略) (略) ( (略) )妇产科转录组测序分析业务委托

采购内容:380个人的有参二代转录组数据采集和分析技术开发；采购数量:1项；主要功能或目标:构建二代转录组文库，采用MGI2000平台测序，每个样本测序数据量10G，并进行数据质控，对质控合格的数据进行生物信息学分析；需满足的要求:标准分析1.原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理
2.测序数据产量统计及质量评估
3.比对分析
3.1与参考基因组比对分析
3.2与参考转录本比对分析
3.3样本均一性分析
4.表达水平分析
4.1基因和isoform表达定量分析
4.2基因和isoformPCA分析（限两组或以上样本）
5、表达定量整体质量评估
5.1样本饱和度分析
5.2同组样本间基因和isoform venn图（两个或以上样本）
6、差异表达分析
6.1差异基因和isoform聚类分析（两个或以上样本）
6.2差异表达功能注释及GO、KEGG富集分析（两个或以样本）
6.3差异转录因子分析
7、新转录本预测与注释
高级分析8、lncRNA鉴定
9、蛋白互作分析
10、gemline突变检测
11、可变剪切分析
12、差异可变剪切分析
13、融合基因分析
个性化分析14、WGCNA分析
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15、GSEA富集分析。

19

2022-09

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