上海市临床检验中心2023年05月政府采购意向-高通量基因组测序系统
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上海市临床检验中心2023年05月政府采购意向-高通量基因组测序系统
| 序号 | 采购项目名称 | 采购需求概况 | 预算金额（元） | 预计采购时间（填写到月） | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 高通量基因组测序系统 | 1）临床微生物实验室仍然是感染性疾病诊断、传染病病原学检验的前哨。快速、准确的临床病原学诊断，对传染病的精准防控、特别是突发重特大传染病疫情的预警具有非常重要的意义。可引起感染和传染病的病原微生物种类很多，传统方法具有明显的局限性。分子生物学技术以其灵敏度高、特异性强、快速、高通量等优点，近年得到快速发展。特别是，新冠疫情爆发以来，国内临床实验室分子诊断平台等到快速普及和提升，本市多家医疗机构临床实验室开始逐步将分子诊断技术用于临床微生物检验，微生物高通量测序技术、GeneXpert等检测平台进入临床，作为对传统鉴定方法的有益补充，是未来临床微生物实验室发展的必由之路。 2）调研表明，本市已建立微生物高通量测序技术(mNGS)平台并正常开展临床微生物高通量测序检验的临床实验室和第三方检测机构有近10家，正在构建或通过委托第三方检测机构提供mNGS检测报告的临床实验室有30余家，而更多的临床医疗机构正在筹建临床微生物分子快速诊断平台。与此同时，基层医疗机构临床实验室在感染性疾病（特别是由高致病性病原微生物引起的传染病）准确诊断和疫情上报工作中依然存在一定困难，也 (略) 检验结果互认的一个瓶颈。 (略) 临床检验中心的密切联系和信任，基层实验室迫切希望临床检验中心能够建立传染病快速诊断临床公共技术平台，有助于保障检验质量，提高基层医疗机构诊断水平和节约社会资源，避免重复投资和设备闲置；也有助于提高广大基层实验室应对突发高致病性传染病能力，防止感染性疾病的爆发和流行，对维护上海的繁荣稳定具有重要意义。 3)全国开展微生物高通量测序检验的绝大多数实验室（含第三方）缺乏完整的、独立的生信分析系统及生信分析技术人员，临床样本测序结果的解读，仍然主要依赖于 (略) ，*续有临床医生和实验室检验人员反馈，部分测序结果与临床诊断明显不符合，或与培养结果不符合，甚至出现显微镜镜检检出真菌菌丝或孢子而测序结果未能检出的明显错误，存在明显质控问题；而且，除结核分枝杆菌、新型冠状病毒等部分病原微生物外，多数病原微生物的分子诊断技术为实验室自建方法，尚有待于进一步规范和标准化；目前，在国内仅国家卫健委临床检验中心每年组织开展1次高通量测序的室间质评。 | *.00 | 2023-05 |
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| 序号 | 采购项目名称 | 采购需求概况 | 预算金额（元） | 预计采购时间（填写到月） | 备注 |
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| 1 | 高通量基因组测序系统 | 1）临床微生物实验室仍然是感染性疾病诊断、传染病病原学检验的前哨。快速、准确的临床病原学诊断，对传染病的精准防控、特别是突发重特大传染病疫情的预警具有非常重要的意义。可引起感染和传染病的病原微生物种类很多，传统方法具有明显的局限性。分子生物学技术以其灵敏度高、特异性强、快速、高通量等优点，近年得到快速发展。特别是，新冠疫情爆发以来，国内临床实验室分子诊断平台等到快速普及和提升，本市多家医疗机构临床实验室开始逐步将分子诊断技术用于临床微生物检验，微生物高通量测序技术、GeneXpert等检测平台进入临床，作为对传统鉴定方法的有益补充，是未来临床微生物实验室发展的必由之路。 2）调研表明，本市已建立微生物高通量测序技术(mNGS)平台并正常开展临床微生物高通量测序检验的临床实验室和第三方检测机构有近10家，正在构建或通过委托第三方检测机构提供mNGS检测报告的临床实验室有30余家，而更多的临床医疗机构正在筹建临床微生物分子快速诊断平台。与此同时，基层医疗机构临床实验室在感染性疾病（特别是由高致病性病原微生物引起的传染病）准确诊断和疫情上报工作中依然存在一定困难，也 (略) 检验结果互认的一个瓶颈。 (略) 临床检验中心的密切联系和信任，基层实验室迫切希望临床检验中心能够建立传染病快速诊断临床公共技术平台，有助于保障检验质量，提高基层医疗机构诊断水平和节约社会资源，避免重复投资和设备闲置；也有助于提高广大基层实验室应对突发高致病性传染病能力，防止感染性疾病的爆发和流行，对维护上海的繁荣稳定具有重要意义。 3)全国开展微生物高通量测序检验的绝大多数实验室（含第三方）缺乏完整的、独立的生信分析系统及生信分析技术人员，临床样本测序结果的解读，仍然主要依赖于 (略) ，*续有临床医生和实验室检验人员反馈，部分测序结果与临床诊断明显不符合，或与培养结果不符合，甚至出现显微镜镜检检出真菌菌丝或孢子而测序结果未能检出的明显错误，存在明显质控问题；而且，除结核分枝杆菌、新型冠状病毒等部分病原微生物外，多数病原微生物的分子诊断技术为实验室自建方法，尚有待于进一步规范和标准化；目前，在国内仅国家卫健委临床检验中心每年组织开展1次高通量测序的室间质评。 | *.00 | 2023-05 |
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