18个miRNA高通量及8个真核转录组测序分析服务成交结果公告
18个miRNA高通量及8个真核转录组测序分析服务成交结果公告
项目名称 | 18个miRNA高通量及8个真核转录组测序分析服务 | 项目编号 | EJWJ# |
---|---|---|---|
公告开始日期 | # | 公告截止日期 | # |
采购单位 | 福建农林大学 | 付款方式 | 货到验收付款 |
联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 中标后在我参与的项目中查看 |
签约时间要求 | 成交后5日内 | 到货时间要求 | 无 |
预 算 | #.0 | ||
收货地址 | 无 | ||
供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 |
采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
---|---|---|---|
18个miRNA高通量测序分析服务 | 18 | 个 | 其他自然科学研究和试验开发服务 |
品牌 | 无 |
---|---|
型号 | 无 |
品牌2 | 无 |
型号 | 无 |
品牌3 | 无 |
型号 | 无 |
预算 | 1100.0 |
技术参数及配置要求 | 1、miRNA测序总样品量:18个 2、#方提供合格的组织或者total RNA样品(以下简称“受测样品”),#方协助#方进行提取检测,质检合格后对受测样品进行小RNA文库构建,通过 (略) 进行测序,其中每个样本不少于10M reads,下机后对数据进行质控并分析。 分析内容如下: 1) 数据过滤:对原始数据进行去除低质量、去除 (略) 理得到备用的序列; 2) 长度分布统计:统计小RNA的长度分布; 3) 基因组比对:将clean reads定位到参考基因组序列上面(需要基因组参考序列); 4) 已知miRNA鉴定:与miRBase 21中指定范围的miRNA比对; 5) 非编码RNA比对:与Rfam 12.0中的序列进行比对,鉴定各类非编码RNA; 6) 与Rep (略) 域进行比对,得到Repeat的注释信息; 7) 与exon/int (略) 域进行比对,得到exon/intron的注释信息; 8) novel miRNA预测:对未注释的序列进行novel miRNA预测; 9) miRNA结构水平分析:碱基偏好性分析; 10)miRNA家族分析(仅分析miRBase中有收录的物种); 11) miRNA表达量水平分析:表达量统计、差异分析和聚类分析; 12) miRNA功能分析:miRNA靶基因预测和靶基因的功能注释分析; 3、项目周期:7天 |
售后服务 | 无 |
采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
---|---|---|---|
8个真核转录组测序分析服务 | 8 | 个 | 其他自然科学研究和试验开发服务 |
品牌 | 无 |
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型号 | 无 |
品牌2 | 无 |
型号 | 无 |
品牌3 | 无 |
型号 | 无 |
预算 | 350.0 |
技术参数及配置要求 | 1、基于 (略) ,完成8个样品转录组提取、测序以及数据分析,平均每个样品产生6G clean data,保证Q30达到85%。 2、数据分析主要包括以下内容: 测序数据及其质量控制, 转录组数据与参考基因组序列比对, 转录组文库质量评估,SNP/InDel分析,可变剪接事件预测, 基因结构优化分析,新基因分析,基因表达量分析,差异表达分析, 差异表达基因功能注释和富集分析,转录因子分析。 3、项目周期:7天 售后服务 1 数据分析主要包括以下内容:测序数据及其质量控制, 转录组数据与参考基因组序列比对, 转录组文库质量评估,SNP/InDel分析,可变剪接事件预测, 基因结构优化分析,新基因分析,基因表达量分析,差异表达分析, 差异表达基因功能注释和富集分析,转录因子分析。 2、项目周期:7天 |
售后服务 | 无 |
项目名称 | 18个miRNA高通量及8个真核转录组测序分析服务 | 项目编号 | EJWJ# |
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公告开始日期 | # | 公告截止日期 | # |
采购单位 | 福建农林大学 | 付款方式 | 货到验收付款 |
联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 中标后在我参与的项目中查看 |
签约时间要求 | 成交后5日内 | 到货时间要求 | 无 |
预 算 | #.0 | ||
收货地址 | 无 | ||
供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 |
采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
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18个miRNA高通量测序分析服务 | 18 | 个 | 其他自然科学研究和试验开发服务 |
品牌 | 无 |
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型号 | 无 |
品牌2 | 无 |
型号 | 无 |
品牌3 | 无 |
型号 | 无 |
预算 | 1100.0 |
技术参数及配置要求 | 1、miRNA测序总样品量:18个 2、#方提供合格的组织或者total RNA样品(以下简称“受测样品”),#方协助#方进行提取检测,质检合格后对受测样品进行小RNA文库构建,通过 (略) 进行测序,其中每个样本不少于10M reads,下机后对数据进行质控并分析。 分析内容如下: 1) 数据过滤:对原始数据进行去除低质量、去除 (略) 理得到备用的序列; 2) 长度分布统计:统计小RNA的长度分布; 3) 基因组比对:将clean reads定位到参考基因组序列上面(需要基因组参考序列); 4) 已知miRNA鉴定:与miRBase 21中指定范围的miRNA比对; 5) 非编码RNA比对:与Rfam 12.0中的序列进行比对,鉴定各类非编码RNA; 6) 与Rep (略) 域进行比对,得到Repeat的注释信息; 7) 与exon/int (略) 域进行比对,得到exon/intron的注释信息; 8) novel miRNA预测:对未注释的序列进行novel miRNA预测; 9) miRNA结构水平分析:碱基偏好性分析; 10)miRNA家族分析(仅分析miRBase中有收录的物种); 11) miRNA表达量水平分析:表达量统计、差异分析和聚类分析; 12) miRNA功能分析:miRNA靶基因预测和靶基因的功能注释分析; 3、项目周期:7天 |
售后服务 | 无 |
采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
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8个真核转录组测序分析服务 | 8 | 个 | 其他自然科学研究和试验开发服务 |
品牌 | 无 |
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型号 | 无 |
品牌2 | 无 |
型号 | 无 |
品牌3 | 无 |
型号 | 无 |
预算 | 350.0 |
技术参数及配置要求 | 1、基于 (略) ,完成8个样品转录组提取、测序以及数据分析,平均每个样品产生6G clean data,保证Q30达到85%。 2、数据分析主要包括以下内容: 测序数据及其质量控制, 转录组数据与参考基因组序列比对, 转录组文库质量评估,SNP/InDel分析,可变剪接事件预测, 基因结构优化分析,新基因分析,基因表达量分析,差异表达分析, 差异表达基因功能注释和富集分析,转录因子分析。 3、项目周期:7天 售后服务 1 数据分析主要包括以下内容:测序数据及其质量控制, 转录组数据与参考基因组序列比对, 转录组文库质量评估,SNP/InDel分析,可变剪接事件预测, 基因结构优化分析,新基因分析,基因表达量分析,差异表达分析, 差异表达基因功能注释和富集分析,转录因子分析。 2、项目周期:7天 |
售后服务 | 无 |
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