医工交叉学院采购多组学检测技术服务结果公告
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医工交叉学院采购多组学检测技术服务结果公告
合同包1( (略) 采购多组学检测技术服务):
| 供应商名称 | 供应商地址 | 中标（成交）金额 |
|---|---|---|
| 上海烈冰 (略) | (略) (略) (略) 555号(略)楼7059室 | 6,(略) |
合同包1( (略) 采购多组学检测技术服务):
服务类（上海烈冰 (略) ）
| 品目号 | 品目名称 | 采购标的 | 服务范围 | 服务要求 | 服务时间 | 服务标准 | 金额(元) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1-1 | 技术测试和分析服务 | 单细胞转录组测序 | 完成540个样本的单细胞转录组测序，其中组织样本360个，血液样本180个 | (1) (略) ：10X Genom (略) ，Il (略) (2)样本上机要求：a：细胞悬液合格标准：细胞活性大于90%，结团率小于5% ，单样本细胞总量大于(略)。b细胞核悬液合格标准：结团率小于5%，单样本细胞核总量大于(略)。(3)服务内容及数据量要求：对合格样本进行基于10X Genomics微流控原理的单细胞（核）捕获和转录组文库构建，并用Illumina测序仪采用双端150bp的方式完成测序，单细胞转录组数据量不少于150Gb。单个样本细胞数量满足(略)以上，基因中位数大于1500。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) (略) 在线分析、查阅结果的方式：(4) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | 3,(略) |
| 1-2 | 技术测试和分析服务 | 全基因组测序 | 完成300个样本的全基因组测序，其中组织样本200个，血液样本100个 | (1) (略) ：Il (略) (2)样本上机要求：收集组织、血液样本，从样本中提取纯DNA。DNA总量不低于 1ug，OD260/OD280 的比值应在 1.8-2.0 之间。(3)服务内容及数据量要求a．测序策略及深度:PE150，30×～50×覆盖深度,单样本数据量不少于120Gb。b．数据要求:Q30>85%，碱基类型分布均匀，因测序机构定量不准或其他非采购方自身样本原因引起的数据量不足，免费补测。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-3 | 技术测试和分析服务 | Bulk转录组测序 | 完成450个样本的Bulk转录组测序，其中组织样本300个，血液样本150个 | (1) (略) ：Il (略) (2)样本上机要求：收集组织、血液样本，从样本中提取总RNA，总RNA总量大于2ug，RIN值大于7。(3)服务内容及数据量要求：a．核酸提取的技术方案和要求，RNA 提取：核酸提取后应进行质量测定。核酸质量控制要求：核酸提取物OD260/OD280在1.7～1.9之间，OD260/OD230大于2。无蛋白质污染。保持核酸的完整性。b．测序及测序数据分析。利用高通量测序仪对构建的文库开展测序实验，采用测序读长为150bp的双端测序模式。数据量：高质量测序数据（Q20）≥6Gb。准确度：Q30 比例＞85%。去接头后连续为N的读序不纳入分析。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) (略) 在线分析、查阅结果的方式：(4) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-4 | 技术测试和分析服务 | TCR免疫组库测序 | 完成300个组织样本的TCR免疫组库测序 | (1) (略) ：Il (略) (2)样本上机要求：收集组织样本，从样本中提取总RNA，总RNA总量大于2ug，RIN值大于7。(3)服务内容及数据量要求a、核酸提取的技术方案和要求，RNA 提取：核酸提取操作需符合试剂盒说明书的要求，提取后应进行质量测定。b、采用5’RACE法合成含有mRNA完整5’的cDNA，覆盖到完整的V基因，保留完整的TCR和 (略) 域，RACE扩增产物用于双端150bp测序，测序数据量不低于10Gb。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-5 | 技术测试和分析服务 | 血浆蛋白质组检测 | 完成150个血液样本的血浆蛋白质组检测 | (1) (略) ：研究采用Orbitrap Astral超高分辨质谱仪进行蛋白的检测(2)样本上机要求：从血液中分离高质量的血浆样本，从血浆中提取总蛋白。总蛋白质检合格标准：使用SDS-PAGE考染，蛋白条带清晰，蛋白条带分布正常，蛋白无降解，各泳道电泳行为差异不明显，且存在明显的高丰度蛋白，使用BCA 试剂盒测定蛋白浓度，蛋白总量至少大于50ug。(3)服务内容及数据量要求a、 (略) 理：蛋白检测采用纳米磁珠富集方式。b、胰酶酶解：对符合样本上机要求的蛋白进行胰酶酶解。c、质谱方法：采用10X高深度检测方法，使用Orbitrap Astral仪器。d、鉴定深度要求：鉴定总蛋白数不低于6000，能进行定量的蛋白总数不低于4500。e、配置Swiss-ProtReviewed 数据库，数据使用DIA-NN（v 1.8）搜索引擎，使用软件默认参数进行检索。酶切方式设置为Trypsin/P，最大漏切数设置为2。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-6 | 技术测试和分析服务 | 血浆代谢组检测 | 完成150个血液样本的血浆代谢组检测 | (1) (略) ：代谢物使用Waters UPLC超高效液相系统结合Waters ACQUITY UPLC BEH C18 Column（1.7 μm, 2.1 mm×100 mm）进行分离，之后代谢物经由超高效液相系统分离后被注入ESI离子源中进行电离然后进timsTOF Pro质谱进行分析。(2)样本上机要求：取样后对样品状态进行以下评估：a、状态评估：在样本核对时，须评估样本状态是否正常，是否有存在溶血或者沉淀的情况，通过肉眼进行样本颜色的评估，判断样本是否存在溶血情况（正常血清和轻微溶血样本可以正常进行，溶血样本建议剔除）。b、样本量评估：在样本核对的时候须评估样本量是否充足，每个样本量达到 50 μL以上。(3)服务内容及数据量要求a、代谢物中正/负离子鉴定要求：检出总代谢物不低于2500，其中正离子鉴定深度不低于1700，负离子鉴定深度不低于800。b、将质谱检测数据 (略) 理，数据库谱图匹配及软件自动积分及定量计算。c、进行QC正离子BPC重叠图、QC负离子BPC重叠图、组内和组间PCA图进行质控。d、 (略) 理：化合物定量有重复时，提取最高值，代谢物必须要在>=50%的QC样本中有定量值，或者在>=20%的实验样本中有定量值。e、配置 MetaboScape 2022 搜库软件。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-7 | 技术测试和分析服务 | 石蜡空间转录组测序 | 完成80个组织样本的石蜡空间转录组测序 | (1) (略) ：10X Genomics Visium HD(2)样本上机要求a、组织切片厚度5μm，正式实验尽量保证组织切片平整(刀痕，褶皱，破损等会导致脱片或者组织结构变形/缺失)。b、RNA质检:DV200>30%c、HE染色质控:组织形态保存完好。(3)服务内容及数据量要求a、提供组织切片、组织透化及基因表达实验，邻片进行病理要求的HE染色或者免疫荧光染色。b、测序读长PE150，数据量≥150Gb RawData/样本，测序质量：RawData Q30≥80%； | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) (略) 在线分析、查阅结果的方式：(4) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | 1,(略) |
姚进、全丽、刘晓颖、倪靖滨、刘育松（采购人代表）
| 代理服务收费标准 | 无 | ||
|---|---|---|---|
| 合同包号 | 合同包名称 | 代理服务费金额（万元） | 收取对象 |
| 1 | (略) 采购多组学检测技术服务 | 0 | 无 |
自本公告发布之日起1个工作日。
合同包1( (略) 采购多组学检测技术服务):
| 供应商 | 资格性审查 | 符合性审查 | 技术得分 | 商务得分 | 价格得分 | 综合得分 | 评审价格 | 最终报价 | 得分排名 | 推荐排名 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 上海烈冰 (略) | 通过 | 通过 | 52.00 | 32.50 | 9.92 | 94.42 | 5,(略) | 6,(略) | 1 | 1 | |
| 杭州景杰 (略) | 通过 | 通过 | 32.00 | 6.00 | 7.97 | 45.97 | 6,(略) | 6,(略) | 2 | 2 | |
| 江西海普洛斯医 (略) | 通过 | 通过 | 32.00 | 4.00 | 9.81 | 45.81 | 5,(略) | 6,(略) | 3 | 3 | |
| 北京 (略) | 通过 | 通过 | 22.50 | 8.00 | 10.00 | 40.50 | 5,(略) | 6,(略) | 4 | ||
| 广州伟 (略) | 通过 | 通过 | 16.00 | 7.50 | 9.82 | 33.32 | 5,(略) | 6,(略) | 5 |
名称：哈尔滨医科大学
地址：黑龙 (略) (略) (略) 157号
联系方式：(略)
名称： (略)
地址：黑龙 (略) (略) (略) 130-6号
联系方式：0451-(略)
项目联系人：曲梦璇
电话：0451-(略)
(略)
2025年02月12日
合同包1( (略) 采购多组学检测技术服务):
| 供应商名称 | 供应商地址 | 中标（成交）金额 |
|---|---|---|
| 上海烈冰 (略) | (略) (略) (略) 555号(略)楼7059室 | 6,(略) |
合同包1( (略) 采购多组学检测技术服务):
服务类（上海烈冰 (略) ）
| 品目号 | 品目名称 | 采购标的 | 服务范围 | 服务要求 | 服务时间 | 服务标准 | 金额(元) |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1-1 | 技术测试和分析服务 | 单细胞转录组测序 | 完成540个样本的单细胞转录组测序，其中组织样本360个，血液样本180个 | (1) (略) ：10X Genom (略) ，Il (略) (2)样本上机要求：a：细胞悬液合格标准：细胞活性大于90%，结团率小于5% ，单样本细胞总量大于(略)。b细胞核悬液合格标准：结团率小于5%，单样本细胞核总量大于(略)。(3)服务内容及数据量要求：对合格样本进行基于10X Genomics微流控原理的单细胞（核）捕获和转录组文库构建，并用Illumina测序仪采用双端150bp的方式完成测序，单细胞转录组数据量不少于150Gb。单个样本细胞数量满足(略)以上，基因中位数大于1500。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) (略) 在线分析、查阅结果的方式：(4) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | 3,(略) |
| 1-2 | 技术测试和分析服务 | 全基因组测序 | 完成300个样本的全基因组测序，其中组织样本200个，血液样本100个 | (1) (略) ：Il (略) (2)样本上机要求：收集组织、血液样本，从样本中提取纯DNA。DNA总量不低于 1ug，OD260/OD280 的比值应在 1.8-2.0 之间。(3)服务内容及数据量要求a．测序策略及深度:PE150，30×～50×覆盖深度,单样本数据量不少于120Gb。b．数据要求:Q30>85%，碱基类型分布均匀，因测序机构定量不准或其他非采购方自身样本原因引起的数据量不足，免费补测。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-3 | 技术测试和分析服务 | Bulk转录组测序 | 完成450个样本的Bulk转录组测序，其中组织样本300个，血液样本150个 | (1) (略) ：Il (略) (2)样本上机要求：收集组织、血液样本，从样本中提取总RNA，总RNA总量大于2ug，RIN值大于7。(3)服务内容及数据量要求：a．核酸提取的技术方案和要求，RNA 提取：核酸提取后应进行质量测定。核酸质量控制要求：核酸提取物OD260/OD280在1.7～1.9之间，OD260/OD230大于2。无蛋白质污染。保持核酸的完整性。b．测序及测序数据分析。利用高通量测序仪对构建的文库开展测序实验，采用测序读长为150bp的双端测序模式。数据量：高质量测序数据（Q20）≥6Gb。准确度：Q30 比例＞85%。去接头后连续为N的读序不纳入分析。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) (略) 在线分析、查阅结果的方式：(4) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-4 | 技术测试和分析服务 | TCR免疫组库测序 | 完成300个组织样本的TCR免疫组库测序 | (1) (略) ：Il (略) (2)样本上机要求：收集组织样本，从样本中提取总RNA，总RNA总量大于2ug，RIN值大于7。(3)服务内容及数据量要求a、核酸提取的技术方案和要求，RNA 提取：核酸提取操作需符合试剂盒说明书的要求，提取后应进行质量测定。b、采用5’RACE法合成含有mRNA完整5’的cDNA，覆盖到完整的V基因，保留完整的TCR和 (略) 域，RACE扩增产物用于双端150bp测序，测序数据量不低于10Gb。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-5 | 技术测试和分析服务 | 血浆蛋白质组检测 | 完成150个血液样本的血浆蛋白质组检测 | (1) (略) ：研究采用Orbitrap Astral超高分辨质谱仪进行蛋白的检测(2)样本上机要求：从血液中分离高质量的血浆样本，从血浆中提取总蛋白。总蛋白质检合格标准：使用SDS-PAGE考染，蛋白条带清晰，蛋白条带分布正常，蛋白无降解，各泳道电泳行为差异不明显，且存在明显的高丰度蛋白，使用BCA 试剂盒测定蛋白浓度，蛋白总量至少大于50ug。(3)服务内容及数据量要求a、 (略) 理：蛋白检测采用纳米磁珠富集方式。b、胰酶酶解：对符合样本上机要求的蛋白进行胰酶酶解。c、质谱方法：采用10X高深度检测方法，使用Orbitrap Astral仪器。d、鉴定深度要求：鉴定总蛋白数不低于6000，能进行定量的蛋白总数不低于4500。e、配置Swiss-ProtReviewed 数据库，数据使用DIA-NN（v 1.8）搜索引擎，使用软件默认参数进行检索。酶切方式设置为Trypsin/P，最大漏切数设置为2。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-6 | 技术测试和分析服务 | 血浆代谢组检测 | 完成150个血液样本的血浆代谢组检测 | (1) (略) ：代谢物使用Waters UPLC超高效液相系统结合Waters ACQUITY UPLC BEH C18 Column（1.7 μm, 2.1 mm×100 mm）进行分离，之后代谢物经由超高效液相系统分离后被注入ESI离子源中进行电离然后进timsTOF Pro质谱进行分析。(2)样本上机要求：取样后对样品状态进行以下评估：a、状态评估：在样本核对时，须评估样本状态是否正常，是否有存在溶血或者沉淀的情况，通过肉眼进行样本颜色的评估，判断样本是否存在溶血情况（正常血清和轻微溶血样本可以正常进行，溶血样本建议剔除）。b、样本量评估：在样本核对的时候须评估样本量是否充足，每个样本量达到 50 μL以上。(3)服务内容及数据量要求a、代谢物中正/负离子鉴定要求：检出总代谢物不低于2500，其中正离子鉴定深度不低于1700，负离子鉴定深度不低于800。b、将质谱检测数据 (略) 理，数据库谱图匹配及软件自动积分及定量计算。c、进行QC正离子BPC重叠图、QC负离子BPC重叠图、组内和组间PCA图进行质控。d、 (略) 理：化合物定量有重复时，提取最高值，代谢物必须要在>=50%的QC样本中有定量值，或者在>=20%的实验样本中有定量值。e、配置 MetaboScape 2022 搜库软件。 | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | (略) |
| 1-7 | 技术测试和分析服务 | 石蜡空间转录组测序 | 完成80个组织样本的石蜡空间转录组测序 | (1) (略) ：10X Genomics Visium HD(2)样本上机要求a、组织切片厚度5μm，正式实验尽量保证组织切片平整(刀痕，褶皱，破损等会导致脱片或者组织结构变形/缺失)。b、RNA质检:DV200>30%c、HE染色质控:组织形态保存完好。(3)服务内容及数据量要求a、提供组织切片、组织透化及基因表达实验，邻片进行病理要求的HE染色或者免疫荧光染色。b、测序读长PE150，数据量≥150Gb RawData/样本，测序质量：RawData Q30≥80%； | 自合同签订之日起1年 | (1)反馈质检报告和实验报告，提供实验操作步骤，并说明所用主要仪器、试剂或试剂盒。(2)提供原始数据，提供测序数据质控和生信分析结果报告。(3) (略) 在线分析、查阅结果的方式：(4) 数据保留时间：原始测序数据、分析结果等数据保留10年。 | 1,(略) |
姚进、全丽、刘晓颖、倪靖滨、刘育松（采购人代表）
| 代理服务收费标准 | 无 | ||
|---|---|---|---|
| 合同包号 | 合同包名称 | 代理服务费金额（万元） | 收取对象 |
| 1 | (略) 采购多组学检测技术服务 | 0 | 无 |
自本公告发布之日起1个工作日。
合同包1( (略) 采购多组学检测技术服务):
| 供应商 | 资格性审查 | 符合性审查 | 技术得分 | 商务得分 | 价格得分 | 综合得分 | 评审价格 | 最终报价 | 得分排名 | 推荐排名 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 上海烈冰 (略) | 通过 | 通过 | 52.00 | 32.50 | 9.92 | 94.42 | 5,(略) | 6,(略) | 1 | 1 | |
| 杭州景杰 (略) | 通过 | 通过 | 32.00 | 6.00 | 7.97 | 45.97 | 6,(略) | 6,(略) | 2 | 2 | |
| 江西海普洛斯医 (略) | 通过 | 通过 | 32.00 | 4.00 | 9.81 | 45.81 | 5,(略) | 6,(略) | 3 | 3 | |
| 北京 (略) | 通过 | 通过 | 22.50 | 8.00 | 10.00 | 40.50 | 5,(略) | 6,(略) | 4 | ||
| 广州伟 (略) | 通过 | 通过 | 16.00 | 7.50 | 9.82 | 33.32 | 5,(略) | 6,(略) | 5 |
名称：哈尔滨医科大学
地址：黑龙 (略) (略) (略) 157号
联系方式：(略)
名称： (略)
地址：黑龙 (略) (略) (略) 130-6号
联系方式：0451-(略)
项目联系人：曲梦璇
电话：0451-(略)
(略)
2025年02月12日
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