云南中医药大学中药学院购置生物样品测序服务项目的比价公告(二次)

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云南中医药大学中药学院购置生物样品测序服务项目的比价公告(二次)



(略) ( * 次)

项目名称: (略) (略) 购置生物样品测序服务( * 次)

采购单位: (略)

项目预算: 点击查看>>

采购内容及要求:

* 、资格要求

1.投标人须在中华人民共和国境内注册,且具备独立法人资格,提供营业执照(复印件加盖公章)。

2.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。

3.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。

* 、采购内容

项目分类

样本数量(例)

真核有参转录组测序

*

DIA定量蛋白质组学

*

非靶代谢组学

*

* 、检测要求

检测要求

蛋白质组学

检测内容

DIA定量蛋白质组学

检测要求

色谱分离后的样品用Q-Exactive HFX质谱仪(Thermo Scientific)进行DIA质谱分析

检测模式

检测模式:正离子, * 级质谱扫描范围: 点击查看>> m/z,质谱分辨率: * , * (@m/z * ),AGC target:3e6,Maximum IT: * ms。MS2采用DIA数据采集模式,设置 * 个DIA采集窗口,质谱分辨率: * , * (@m/z * ),AGC target:3e6,Maximum IT:auto,MS2 Activation Type:HCD,Normalized collision energy: * ,Spectral data type: profile。

数据分析

鉴定与定量结果统计、所有样本PCA分析、组间样本venn分析、差异结果数量统计、火山图分析、聚类分析、亚细胞定位分析、结构域分析、GO功能分析(GO功能注释分类、GO功能富集分析、 topGO有向无环分析)、KEGG通路分析(KEGG通路注释、KEGG通路富集分析、KEGG通路图展示)、 (略) 络及module分析、表型与组学关联分析、质控分析(色谱峰平均数据点、peak capacity分析、内标iRT保留时间分析、QC样本CV分布、QC样本PCA分布、QC样本相关性、样本定量强度分布、组间样本鉴定数量分布)。

代谢组学

检测内容

非靶代谢组学

检测要求

采用AB Triple TOF * (略) 样本 * 级、 * 级质谱图的采集。TOF MS scan m/z range: * - * Da,product ion scan m/z range: * - * Da,TOF MS scan accumulation time 0. * s/spectra, product ion scan accumulation time 0. * s/spectra; * 级质谱采用information dependent acquisition (IDA)获得,并且采用high sensitivity 模式。

数据分析

实验数据质量分析(QC样本总离子流图的比较、总体样本主成分分析)、代谢物鉴定等级、代谢物鉴定数量统计、代谢物化学分类归属统计、单变量统计分析、多维统计分析(主成分分析、偏最小 * 乘判别分析、正交偏最小 * 乘判别分析)、筛选差异代谢物、聚类分析、相关性分析、KEGG通路注释与分析。

数据库

采用本地自建标准品数据库搜库,通过与本地数据库中代谢物的保留时间、分子质量(分子质量误差在< * ppm内)、 * 级碎裂谱图、碰撞 (略) 匹配,对生物样本中 (略) 结构鉴定,并对 (略) 严格的人工 * 次核对、确认。鉴定等级在Level2以上。

转录组学

检测内容

转录组学

检测要求

Illumina测序平台

数据分析

样品间相关性评估、样本间主成分统计图展示、基因表达水平分析、样品基因表达量总体分布、基因差异表达分析、差异基因筛选、差异基因聚类、差异基因GO富集、top GO有向无环图分析、差异基因KEGG富集、KEGG富集散点图、差异基 (略) 络分析、可变剪切事件分类和数量统计、差异可变剪切事件分类和数量统计、新基因挖掘、基因结构优化。

联合分析

投标 (略) 转录组学、蛋白组学和代谢组学之间联合分析的能力。

* 、售后服务

中标人需提供售后服务,数据返回后 (略) 检测及联合分析服务质量的评估, * 旦出现问题,中标人需保证 * 小时内服务响应,并于 * 小 (略) 理办法;上门解答相关问题,讲解结题报告, (略) 思路挖掘; (略) 有数据。数据保存6个月以上

* 、报价材料要求

1.营业执照副本(复印件加盖公章)。

2.法定代表人身份证明书和法定代表人委托书原件(委托代理人投标加盖公章)。

3.报价人公司简介。

4.报价明细表。

5.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。

6.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。

7.报价人公司能够高质量完成该项目的书面综合分析。

* 、报价方式

请具有完成以上服务资质及能力的潜在报价人,将报价材料签字盖章并密封完好,于 * 日9: * - * : * 期间,送至 (略) (略) 办公室( (略) 于疫情防控期间,可提前打电话联 (略) ),过时将不再接收。联系人:杨老师,联系电话: 点击查看>>点击查看>>

* 、比价结果确定

采购人将根据报价人报送的报价文件,根据“质量高服务好、信誉优且价格合理”的原则择优选定 * 家报价人为该项目成交人。

附件:报价明细表.xls

(略)

* 日



(略) ( * 次)

项目名称: (略) (略) 购置生物样品测序服务( * 次)

采购单位: (略)

项目预算: 点击查看>>

采购内容及要求:

* 、资格要求

1.投标人须在中华人民共和国境内注册,且具备独立法人资格,提供营业执照(复印件加盖公章)。

2.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。

3.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。

* 、采购内容

项目分类

样本数量(例)

真核有参转录组测序

*

DIA定量蛋白质组学

*

非靶代谢组学

*

* 、检测要求

检测要求

蛋白质组学

检测内容

DIA定量蛋白质组学

检测要求

色谱分离后的样品用Q-Exactive HFX质谱仪(Thermo Scientific)进行DIA质谱分析

检测模式

检测模式:正离子, * 级质谱扫描范围: 点击查看>> m/z,质谱分辨率: * , * (@m/z * ),AGC target:3e6,Maximum IT: * ms。MS2采用DIA数据采集模式,设置 * 个DIA采集窗口,质谱分辨率: * , * (@m/z * ),AGC target:3e6,Maximum IT:auto,MS2 Activation Type:HCD,Normalized collision energy: * ,Spectral data type: profile。

数据分析

鉴定与定量结果统计、所有样本PCA分析、组间样本venn分析、差异结果数量统计、火山图分析、聚类分析、亚细胞定位分析、结构域分析、GO功能分析(GO功能注释分类、GO功能富集分析、 topGO有向无环分析)、KEGG通路分析(KEGG通路注释、KEGG通路富集分析、KEGG通路图展示)、 (略) 络及module分析、表型与组学关联分析、质控分析(色谱峰平均数据点、peak capacity分析、内标iRT保留时间分析、QC样本CV分布、QC样本PCA分布、QC样本相关性、样本定量强度分布、组间样本鉴定数量分布)。

代谢组学

检测内容

非靶代谢组学

检测要求

采用AB Triple TOF * (略) 样本 * 级、 * 级质谱图的采集。TOF MS scan m/z range: * - * Da,product ion scan m/z range: * - * Da,TOF MS scan accumulation time 0. * s/spectra, product ion scan accumulation time 0. * s/spectra; * 级质谱采用information dependent acquisition (IDA)获得,并且采用high sensitivity 模式。

数据分析

实验数据质量分析(QC样本总离子流图的比较、总体样本主成分分析)、代谢物鉴定等级、代谢物鉴定数量统计、代谢物化学分类归属统计、单变量统计分析、多维统计分析(主成分分析、偏最小 * 乘判别分析、正交偏最小 * 乘判别分析)、筛选差异代谢物、聚类分析、相关性分析、KEGG通路注释与分析。

数据库

采用本地自建标准品数据库搜库,通过与本地数据库中代谢物的保留时间、分子质量(分子质量误差在< * ppm内)、 * 级碎裂谱图、碰撞 (略) 匹配,对生物样本中 (略) 结构鉴定,并对 (略) 严格的人工 * 次核对、确认。鉴定等级在Level2以上。

转录组学

检测内容

转录组学

检测要求

Illumina测序平台

数据分析

样品间相关性评估、样本间主成分统计图展示、基因表达水平分析、样品基因表达量总体分布、基因差异表达分析、差异基因筛选、差异基因聚类、差异基因GO富集、top GO有向无环图分析、差异基因KEGG富集、KEGG富集散点图、差异基 (略) 络分析、可变剪切事件分类和数量统计、差异可变剪切事件分类和数量统计、新基因挖掘、基因结构优化。

联合分析

投标 (略) 转录组学、蛋白组学和代谢组学之间联合分析的能力。

* 、售后服务

中标人需提供售后服务,数据返回后 (略) 检测及联合分析服务质量的评估, * 旦出现问题,中标人需保证 * 小时内服务响应,并于 * 小 (略) 理办法;上门解答相关问题,讲解结题报告, (略) 思路挖掘; (略) 有数据。数据保存6个月以上

* 、报价材料要求

1.营业执照副本(复印件加盖公章)。

2.法定代表人身份证明书和法定代表人委托书原件(委托代理人投标加盖公章)。

3.报价人公司简介。

4.报价明细表。

5.参加本次政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。

6.具有实施本项目须具备的专业技术和设备设施条件的书面声明。

7.报价人公司能够高质量完成该项目的书面综合分析。

* 、报价方式

请具有完成以上服务资质及能力的潜在报价人,将报价材料签字盖章并密封完好,于 * 日9: * - * : * 期间,送至 (略) (略) 办公室( (略) 于疫情防控期间,可提前打电话联 (略) ),过时将不再接收。联系人:杨老师,联系电话: 点击查看>>点击查看>>

* 、比价结果确定

采购人将根据报价人报送的报价文件,根据“质量高服务好、信誉优且价格合理”的原则择优选定 * 家报价人为该项目成交人。

附件:报价明细表.xls

(略)

* 日

    
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