福建农林大学320个蝴蝶兰样本重测序和1
福建农林大学320个蝴蝶兰样本重测序和1
合同包 | 品目号 | 品目名称 | 技术和服务要求 | 数量 | 竞价最高限价(单价/元) | 竞价最高限价(总价/元) | 允许进口 |
1 | 1 | * 个蝴蝶兰样本重测序和 * 个蝴蝶兰转录组测序分析服务 | 1、重测序建库测序 构建 * 个 * bp * 代DNA文库;采用MGI * (略) 测序;测序深度为每个样本的数据量为 * G clean data,对 (略) 质控和数据过滤。对原始读长(reads)进行质量控制,在蝴蝶兰的引导下,使用velvet对亲本搜索SNP位点。除去低覆盖度与低质量SNP后,其中能被两个软件同时搜索到的将应用于进 * 步分析。 2、完成 * 个蝴蝶兰转录组mRNA建库测序 完成 * 个蝴蝶兰转录组的样本提取,获得高质量的RNA。构建 * 个 * 代RNA文库库检合格后,利用DNBSEQ平台,对文库上机测序。测序深度为每个样本的数据量为6Gclean data;对 (略) 过滤和质控。 完成 * 个蝴蝶兰转录组信息分析: (1)参考基因组比对 (2)新转录本预测 (3)SNP和INDEL检测 (4)差异剪接基因检测 (5)基因表达量计算(基因比对率及表达数目统计、Reads对转录本的覆盖度及分布、样品间的相关性、PCA分析、样品中基因表达量的分布、样品间及组间的基因表达情况) (6)基因表达量聚类分析 (7)时间序列分析 (8)差异表达基因检测 (9)差异表达基因维恩图分析 ( * )差异表达基因层次聚类分析 ( * )差异表达基因GO功能分析 差异表达基因Pathway功能分析 ( * )差异表达基因TF编码能力预测 ( * )差异表达基因蛋白互作分析 ( * )差异表达基因中的植物抗病基因预测 | 1批 | 否 | ||
商务要求: * 、售后服务:1、投诉和建议响应时间要求: * h内响应投诉或建议, * h内反馈改进方案。 2、数据保存及传输要求:数据保存 * 个月,成交供应商需提供移动硬盘用于数据传输。在项目完成后1年之内,如果项目结果存在疑义或者不完善的(例如数据分析存在差错、数据量不够),项目委托方对成交供应商保留追究责任的权利,并与成交供应商协商解决。 * 、合同签订时间:成交通知书发出之日起 * 天内签订合同。 * 、项目交付时间:合同签订后2个月内完成服务要求,提交成果。 * 、付款方式:项目验收 (略) * 个月后,成交供应商须提供增值税发票,采购人收到发票后无质量问题的情况下在 * 个月内付合同总金额的 * %。(成交供应商须提供全额发票,若采购的产品为国产设备的, * 般纳税人须开具增值税专用发票,小规模纳税人不能开具增值税专用发票的需提供相关证明材料,温馨提醒:专用设备发票报销期限原则上为发票开具之日起至次年3月 * 日止。)。 * 、履约保证金:成交供应商在签订采购合同前 * 日内应向采购人缴纳合同总金额的5%作为履约保证金,该履约保证金于项目验收合格后自动转为质量保证金,质量保证金将在保修期( * 个月)结束后且成交供应商无违约的前提下无息退还。 * 、交付地点: (略) 指定地点。 |
竞价方(全称加盖公章) | |
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1 | 1 | * 个蝴蝶兰样本重测序和 * 个蝴蝶兰转录组测序分析服务 | 1、重测序建库测序 构建 * 个 * bp * 代DNA文库;采用MGI * (略) 测序;测序深度为每个样本的数据量为 * G clean data,对 (略) 质控和数据过滤。对原始读长(reads)进行质量控制,在蝴蝶兰的引导下,使用velvet对亲本搜索SNP位点。除去低覆盖度与低质量SNP后,其中能被两个软件同时搜索到的将应用于进 * 步分析。 2、完成 * 个蝴蝶兰转录组mRNA建库测序 完成 * 个蝴蝶兰转录组的样本提取,获得高质量的RNA。构建 * 个 * 代RNA文库库检合格后,利用DNBSEQ平台,对文库上机测序。测序深度为每个样本的数据量为6Gclean data;对 (略) 过滤和质控。 完成 * 个蝴蝶兰转录组信息分析: (1)参考基因组比对 (2)新转录本预测 (3)SNP和INDEL检测 (4)差异剪接基因检测 (5)基因表达量计算(基因比对率及表达数目统计、Reads对转录本的覆盖度及分布、样品间的相关性、PCA分析、样品中基因表达量的分布、样品间及组间的基因表达情况) (6)基因表达量聚类分析 (7)时间序列分析 (8)差异表达基因检测 (9)差异表达基因维恩图分析 ( * )差异表达基因层次聚类分析 ( * )差异表达基因GO功能分析 差异表达基因Pathway功能分析 ( * )差异表达基因TF编码能力预测 ( * )差异表达基因蛋白互作分析 ( * )差异表达基因中的植物抗病基因预测 | 1批 | 否 | ||
商务要求: * 、售后服务:1、投诉和建议响应时间要求: * h内响应投诉或建议, * h内反馈改进方案。 2、数据保存及传输要求:数据保存 * 个月,成交供应商需提供移动硬盘用于数据传输。在项目完成后1年之内,如果项目结果存在疑义或者不完善的(例如数据分析存在差错、数据量不够),项目委托方对成交供应商保留追究责任的权利,并与成交供应商协商解决。 * 、合同签订时间:成交通知书发出之日起 * 天内签订合同。 * 、项目交付时间:合同签订后2个月内完成服务要求,提交成果。 * 、付款方式:项目验收 (略) * 个月后,成交供应商须提供增值税发票,采购人收到发票后无质量问题的情况下在 * 个月内付合同总金额的 * %。(成交供应商须提供全额发票,若采购的产品为国产设备的, * 般纳税人须开具增值税专用发票,小规模纳税人不能开具增值税专用发票的需提供相关证明材料,温馨提醒:专用设备发票报销期限原则上为发票开具之日起至次年3月 * 日止。)。 * 、履约保证金:成交供应商在签订采购合同前 * 日内应向采购人缴纳合同总金额的5%作为履约保证金,该履约保证金于项目验收合格后自动转为质量保证金,质量保证金将在保修期( * 个月)结束后且成交供应商无违约的前提下无息退还。 * 、交付地点: (略) 指定地点。 |
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