[B2021122006]2个十字花科植物基因组近完成图组装与注释网上竞价公告

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采购项目信息

剩余时间：
项目名称2个十字花科植物基因组近完成图组装与注释项目编号B 点击查看>>
开始时间 点击查看>> * : * : * 截止时间 点击查看>> * : * : *
供应商资格要求 参照《中华人民共和国政府采购法》第 * 十 * 条规定的资格条件。

采购货物信息列表

序号货物（服务）名称数量计量单位
1 2个十字花科植物基因组近完成图组装与注释 * Gb
技术参数 目标： * 方提供符合如 (略) 列举的要求的基因组DNA样品， * (略) 提供的受测样品的检测，并通过建库、Nanopore +Hi-C测序达到染色体级别的组装结果。 1.基因组survey： * 方提供符合要求的 * 个组织样品， * (略) 提供的组织的提取与检测，每个样品，以基因组 * Mb为参考，测序深度 * ×，测序 * Gb，（不低于 * Gb），共 * 个样品，共 * G， * %以上碱基质量值在Q * 以上，完成基因组Survey测序分析。做完survey以后，选取2个样品做基因组近完成图。2.基因组测序： * 方提供符合要求的2个组织样品， * (略) 提供的基因组DNA样品的提取、检测，并通过建库、Nanopore Ultra long测序。根据基因组情况：基因组以大小 * Mb为参考，每个样品测 * X的Nanopore Ultra long测序，每个样品不低于 * G，reads N * ＞ * kb，共测序约8个Flowcell，，利用合 (略) 组装。 * 方提供符合要求的2个组织样品， * (略) 提供的基因组DNA样品的提取、检测，并通过建库、Pacbio HiFi测序。基因组以大小 * Mb为参考，每个样品测 * X左右，每个样品数据量约 * Gb，2个样品共 * G数据，利用下机数据，进行组装。 3.Hi-C： * 方提供2个样品的组织， * 方完成该样品的建库和测序，每个样品需构建1个文库，基因组大小按 * M为参考，测序数据不低于 * X，约 * G，共月 * G，利用测序的数据， * 方完成相应的基因组辅助组装信息分析，最终基因组版本达到染色体水平。 4.组装效果: BUSCO评估 * %以上，基因组覆盖度 * %，1-2条染色体达到端粒到端粒组装，全部contig数 * 个以内（杂合度不高于0.8%） 5.后期补洞： 根据组装的结果，确定后续补洞的方案，具体补洞的费用和方案需根据组装的最终结果，双方 (略) 协商再定。
相关材料

(略) 采购与 (略)

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技术参数 目标： * 方提供符合如 (略) 列举的要求的基因组DNA样品， * (略) 提供的受测样品的检测，并通过建库、Nanopore +Hi-C测序达到染色体级别的组装结果。 1.基因组survey： * 方提供符合要求的 * 个组织样品， * (略) 提供的组织的提取与检测，每个样品，以基因组 * Mb为参考，测序深度 * ×，测序 * Gb，（不低于 * Gb），共 * 个样品，共 * G， * %以上碱基质量值在Q * 以上，完成基因组Survey测序分析。做完survey以后，选取2个样品做基因组近完成图。2.基因组测序： * 方提供符合要求的2个组织样品， * (略) 提供的基因组DNA样品的提取、检测，并通过建库、Nanopore Ultra long测序。根据基因组情况：基因组以大小 * Mb为参考，每个样品测 * X的Nanopore Ultra long测序，每个样品不低于 * G，reads N * ＞ * kb，共测序约8个Flowcell，，利用合 (略) 组装。 * 方提供符合要求的2个组织样品， * (略) 提供的基因组DNA样品的提取、检测，并通过建库、Pacbio HiFi测序。基因组以大小 * Mb为参考，每个样品测 * X左右，每个样品数据量约 * Gb，2个样品共 * G数据，利用下机数据，进行组装。 3.Hi-C： * 方提供2个样品的组织， * 方完成该样品的建库和测序，每个样品需构建1个文库，基因组大小按 * M为参考，测序数据不低于 * X，约 * G，共月 * G，利用测序的数据， * 方完成相应的基因组辅助组装信息分析，最终基因组版本达到染色体水平。 4.组装效果: BUSCO评估 * %以上，基因组覆盖度 * %，1-2条染色体达到端粒到端粒组装，全部contig数 * 个以内（杂合度不高于0.8%） 5.后期补洞： 根据组装的结果，确定后续补洞的方案，具体补洞的费用和方案需根据组装的最终结果，双方 (略) 协商再定。
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