1.完成所提供的2500例cDNA样品的检测,并进行单细胞建采购

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1.完成所提供的2500例cDNA样品的检测,并进行单细胞建采购


2500例cDNA样本建库测序及分析服务项目
(略) 在采购意向: (略) 2022年7至8月政府采购意向
采购单位: (略)
采购项目名称:2500例cDNA样本建库测序及分析服务项目
预算金额: 点击查看>> 00万元(人民币)
采购品目:
C0199其他研究和试验开发服务
采购需求概况:
1. (略) 提供的2500例cDNA样品的检测,并进行单细胞建库、Illumina Novaseq 6000测序。每个样品的cDNA单细胞建库后进行不小于6G的测序数据量(Raw Data)产出,过1滤后获得的有效数据达到Q20 ≥90%,Q30 水平≥85%,利用合格的数据进行分析。2.转录组数据分析:2.1测序数据质控:对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理;2.2参考基因组比对分析:采用 hisat2 软件(或其他等同软件)进行比对分析;2.3定量分析:基因表达定量、基因表达分布、样本间相关性分析、主成分分析(PCA);2.4差异分析:差异基因统计分析、差异基因火山图、差异基因韦恩图、差异基因表达聚类热图;2.5富集分析:GO 功能富集分析、KEGG 功能富集分析、基因集富集分析(GSEA);2.6蛋白互作网络分析;2.7基因共表达网络(WGCNA);2.8结构分析:可变剪接分析(AS)、变异位点分析、新基因预测。3.项目周期要求:自收到单批次测序样本后,23个自然日内完成测序分析工作,做好项目总体进度控制。4.产权要求: (略) 产生的技术成果(测序序列等) (略) 知识产 (略) 有。5..售后技术支持:5.1完成服务后的1年内,继续提供技术支持,并解答实验与分析过程中的技术问题。同时,工作日期间,技术咨询和售后服务响应时间小于24小时。5.2数据储存时间:≥6个自然月,数据储存期间提供数据重新取回的服务,数据存储服务到期后,投 (略) 有产生数据。
预计采购时间:2022-07

2500例cDNA样本建库测序及分析服务项目
(略) 在采购意向: (略) 2022年7至8月政府采购意向
采购单位: (略)
采购项目名称:2500例cDNA样本建库测序及分析服务项目
预算金额: 点击查看>> 00万元(人民币)
采购品目:
C0199其他研究和试验开发服务
采购需求概况:
1. (略) 提供的2500例cDNA样品的检测,并进行单细胞建库、Illumina Novaseq 6000测序。每个样品的cDNA单细胞建库后进行不小于6G的测序数据量(Raw Data)产出,过1滤后获得的有效数据达到Q20 ≥90%,Q30 水平≥85%,利用合格的数据进行分析。2.转录组数据分析:2.1测序数据质控:对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量 reads 的处理;2.2参考基因组比对分析:采用 hisat2 软件(或其他等同软件)进行比对分析;2.3定量分析:基因表达定量、基因表达分布、样本间相关性分析、主成分分析(PCA);2.4差异分析:差异基因统计分析、差异基因火山图、差异基因韦恩图、差异基因表达聚类热图;2.5富集分析:GO 功能富集分析、KEGG 功能富集分析、基因集富集分析(GSEA);2.6蛋白互作网络分析;2.7基因共表达网络(WGCNA);2.8结构分析:可变剪接分析(AS)、变异位点分析、新基因预测。3.项目周期要求:自收到单批次测序样本后,23个自然日内完成测序分析工作,做好项目总体进度控制。4.产权要求: (略) 产生的技术成果(测序序列等) (略) 知识产 (略) 有。5..售后技术支持:5.1完成服务后的1年内,继续提供技术支持,并解答实验与分析过程中的技术问题。同时,工作日期间,技术咨询和售后服务响应时间小于24小时。5.2数据储存时间:≥6个自然月,数据储存期间提供数据重新取回的服务,数据存储服务到期后,投 (略) 有产生数据。
预计采购时间:2022-07
    
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