深圳大学-竞价公告(CB105902022000749)
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深圳大学-竞价公告(CB105902022000749)
(略) :CB 点击查看>>
申购主题:结核分枝杆菌全基因组测序项目
采购单位: (略)
报价要求:
发票类型:增值税专用发票
币种:人民币
预算: 点击查看>> .0
签约时间:发布竞价结果后7天内签约合同
送货时间:合同签订后7天内送达
安装要求:免费上门安装（含材料费）
收货地址:广东省/深圳市/南山区/点击查看>>*
付款方式:货到验收合格后付款
备注说明:进行结核分枝杆菌全基因组测序，研究内容包括 点击查看>> 方对 点击查看>> 方提供的710份样品采 (略) 线对样品进行全基因组测序；菌落分散；结核分枝杆菌基因组提取，二代测序建库以及测序。实 (略) 结束后， 点击查看>> 方向 点击查看>> 方提供的完整规范的结果报告，内容包括：实验流程，实验过程中用到的仪器、试剂、 (略) 商，原始数据质量控制。申购明细：
| 序号 | 采购内容 | 数量 | 预算单价 |
| 1 | 结核分枝杆菌全基因组测序项目 | 1.0 | |
| 品牌 | 技术服务 | ||
| 型号 | 技术服务 | ||
| 规格参数 | 进行结核分枝杆菌全基因组测序，研究内容包括 点击查看>> 方对 点击查看>> 方提供的710份样品采 (略) 线对样品进行全基因组测序；菌落分散；结核分枝杆菌基因组提取，二代测序建库以及测序。实 (略) 结束后， 点击查看>> 方向 点击查看>> 方提供的完整规范的结果报告，内容包括：实验流程，实验过程中用到的仪器、试剂、 (略) 商，原始数据质量控制。1.结核分枝杆菌基因组DNA提取及样本浓度检测：利用细菌分散仪和提取试剂进行结核分枝杆菌基因组提取，并在荧光浓度定量仪上，对基因组DNA样本浓度进行检测，获取合格样本浓度的DNA标本。2.测序文库构建（用于新一代测序平台）：要求文库插入片段大小 300 bp，并连接用于样本区分的barcode接头序列。3.测序文库 (略) 理和测序：测序读长双端150 bp（PE150）, 过滤后单样本高质量数据量（>Q30）平均450 Mb以上， 原始数据平均500 Mb以上。4.数据基因组组装和质量评估：完成全基因组拼接，全基因组覆盖度 95%以上，基因组平均覆盖深度100x以上。5.根据现有的结核菌耐药突变数据库鉴定各菌株相关的耐药突变（包括4个一线药物、10个二线药物），对于4个一线药物同时完成敏感性和耐药性分析。6、 (略) 有样本的成簇分析，计算菌株间的遗传距离，构建系统发育树，进行个性化群体进化分析、进化选择压力分析和群体地理传播途径预测。 | ||
| 质保及售后服务 | 1、进行结核分枝杆菌全基因组测序，研究内容包括 点击查看>> 方对 点击查看>> 方提供的710份样品采 (略) 线对样品进行全基因组测序；菌落分散；结核分枝杆菌基因组提取，二代测序建库以及测序。实 (略) 结束后， 点击查看>> 方向 点击查看>> 方提供的完整规范的结果报告，内容包括：实验流程，实验过程中用到的仪器、试剂、 (略) 商，原始数据质量控制。2、按行业标准提供服务 | ||
(略) :CB 点击查看>>
申购主题:结核分枝杆菌全基因组测序项目
采购单位: (略)
报价要求:
发票类型:增值税专用发票
币种:人民币
预算: 点击查看>> .0
签约时间:发布竞价结果后7天内签约合同
送货时间:合同签订后7天内送达
安装要求:免费上门安装（含材料费）
收货地址:广东省/深圳市/南山区/点击查看>>*
付款方式:货到验收合格后付款
备注说明:进行结核分枝杆菌全基因组测序，研究内容包括 点击查看>> 方对 点击查看>> 方提供的710份样品采 (略) 线对样品进行全基因组测序；菌落分散；结核分枝杆菌基因组提取，二代测序建库以及测序。实 (略) 结束后， 点击查看>> 方向 点击查看>> 方提供的完整规范的结果报告，内容包括：实验流程，实验过程中用到的仪器、试剂、 (略) 商，原始数据质量控制。申购明细：
| 序号 | 采购内容 | 数量 | 预算单价 |
| 1 | 结核分枝杆菌全基因组测序项目 | 1.0 | |
| 品牌 | 技术服务 | ||
| 型号 | 技术服务 | ||
| 规格参数 | 进行结核分枝杆菌全基因组测序，研究内容包括 点击查看>> 方对 点击查看>> 方提供的710份样品采 (略) 线对样品进行全基因组测序；菌落分散；结核分枝杆菌基因组提取，二代测序建库以及测序。实 (略) 结束后， 点击查看>> 方向 点击查看>> 方提供的完整规范的结果报告，内容包括：实验流程，实验过程中用到的仪器、试剂、 (略) 商，原始数据质量控制。1.结核分枝杆菌基因组DNA提取及样本浓度检测：利用细菌分散仪和提取试剂进行结核分枝杆菌基因组提取，并在荧光浓度定量仪上，对基因组DNA样本浓度进行检测，获取合格样本浓度的DNA标本。2.测序文库构建（用于新一代测序平台）：要求文库插入片段大小 300 bp，并连接用于样本区分的barcode接头序列。3.测序文库 (略) 理和测序：测序读长双端150 bp（PE150）, 过滤后单样本高质量数据量（>Q30）平均450 Mb以上， 原始数据平均500 Mb以上。4.数据基因组组装和质量评估：完成全基因组拼接，全基因组覆盖度 95%以上，基因组平均覆盖深度100x以上。5.根据现有的结核菌耐药突变数据库鉴定各菌株相关的耐药突变（包括4个一线药物、10个二线药物），对于4个一线药物同时完成敏感性和耐药性分析。6、 (略) 有样本的成簇分析，计算菌株间的遗传距离，构建系统发育树，进行个性化群体进化分析、进化选择压力分析和群体地理传播途径预测。 | ||
| 质保及售后服务 | 1、进行结核分枝杆菌全基因组测序，研究内容包括 点击查看>> 方对 点击查看>> 方提供的710份样品采 (略) 线对样品进行全基因组测序；菌落分散；结核分枝杆菌基因组提取，二代测序建库以及测序。实 (略) 结束后， 点击查看>> 方向 点击查看>> 方提供的完整规范的结果报告，内容包括：实验流程，实验过程中用到的仪器、试剂、 (略) 商，原始数据质量控制。2、按行业标准提供服务 | ||
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