深圳大学-竞价公告(CB105902022001158)
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深圳大学-竞价公告(CB105902022001158)
申购单号:CB*
申购主题:宏基因组与代谢组学测序与分析服务
采购单位:深圳大学
报价要求:
发票类型:增值税专用发票
币种:人民币
预算:*.0
签约时间:发布竞价结果后7天内签约合同
送货时间:合同签订后7天内送达
安装要求:免费上门安装（含材料费）
收货地址:广东省/ (略) /南山区/点击查看>>*
付款方式:货到验收合格后付款
备注说明:申购明细：
| 序号 | 采购内容 | 数量 | 预算单价 |
| 1 | 宏基因组与代谢组学测序与分析服务 | 1.0 | *.0 |
| 品牌 | 华大基因 | ||
| 型号 | 无 | ||
| 规格参数 | 一、完成60个人样品的宏基因组信息采集，构建DNBSEQ文库并上机测序， 每个样本的目标采集数据量为10G的clean data，并完成相应的生物信息分析；二、基本分析1.项目概览2.数据过滤3.组装4.基因分析4.1基因Venn图(2-5个样本或组别)4.2基因差异分析（分组≥2，每组样本数≥3）5.基因集功能注释（Eggnog、KEGG、BacMet、CARD、COG、CAZy、Swiss-prot等）6.物种分析6.1 物种柱状图分析6.2 物种丰度热图6.3 样本相似性热图（基于bray/jsd距离）6.4 降维分析6.4.1 NMDS结合Anosim6.4.2 PCA6.4.3 PcoA6.5 物种稀疏曲线分析6.6关键物种挖掘（只支持两个分组）6.7 物种差异分析（Wilcoxon/kruscal，Lefse）（分组≥2，每组样本数≥8）7.功能分析7.1 功能组成分析（高丰度圈图）7.2 功能丰度热图分析降维分析（NMDS结合Anosim，PCA，PcoA）7.3样本相似性热图（基于bray/jsd距离）功能丰度热图分析7.4 降维分析7.4.1 NMDS结合Anosim7.4.2 PCA7.4.3 PcoA7.5功能差异分析（分组≥2，每组样本数≥8）7.5.1 KEGG pathway富集分析7.5.2 其他功能差异盒形图8.多样性分析（分组≥2，每组样本数≥3）8.1基因、物种、功能水平Alpha多样性分析8.2基因、物种、功能水平Beta多样性分析▲三、投标人实验室拥有自主 (略) 50台以上。▲四、标准数据分析结果需上传到可实现数据循环挖掘的交互分析系统中，该系统需包括但不限于以下功能：（1）展现项目所有标准分析内容；（2）图表互动快速分析；（3）具备个性化处理图片功能等。▲五、采用最新KEGG数据库且有正版授权。六、常规代谢组学采用LC-MS/MS方法，完成60个粪便样本的非靶向代谢组学分析，对实验样本内尽可能全面的代谢物进行分析，准确鉴定代谢物，筛选差异代谢物；。1服务要求：1.1采用液相色谱-质谱联用（LC-MS/MS）的方法，比较不同样品中各自的代谢产物以确定其中的差异代谢物（常规代谢组）。1.2采用UPLC- (略) ，质谱仪使用Q Exactive 或者 Q Exactive HF（Thermo Fisher Scientific）平台。1.3用于后续检测的相关试剂盒、试剂需有质量保证并确定是在保质期内检测。2检测质量要求：每样本数据采集时间不得低于15分钟，数据采集模式需正负离子模式同时采集，数据采集时需使用内标及QC样本进行严格质控。3信息分析内容1)数据预处理（滤噪、峰匹配、峰提取）及归一化2)数据质控3)统计分析4)差异离子筛选及鉴定5)差异代谢物分析：差异代谢物聚类分析及差异 (略) 富集分析6)定制化分析 ：可结合我方的需求，协商确定信息分析内容。七、脂质代谢组学采用LC-MS/MS方法，完成60个粪便样本样本的脂质代谢组学分析，对实验样本内尽可能全面的脂质代谢物进行分析，准确鉴定脂质代谢物，筛选差异脂质代谢物；。1.服务要求：1.1 采用液相色谱-质谱联用（LC-MS/MS）的方法，比较不同样品中各自的脂质代谢产物以确定其中的差异脂质代谢物。1.2采用UPLC- (略) ，质谱仪使用Q Exactive 或者 Q Exactive HF（Thermo Fisher Scientific）平台。1.3用于后续检测的相关试剂盒、试剂需有质量保证并确定是在保质期内检测。2检测质量要求：每样本数据采集时间不得低于15分钟，数据采集模式需正负离子模式同时采集，数据采集时需使用内标及QC样本进行严格质控。3信息分析内容：1)数据预处理（滤噪、峰匹配、峰提取）及归一化2)数据质控3)脂质类别的统计和相对定量分析4) 使用 LipidSearch 软件和代谢组学 R 软件包 metaX对数据进行统计分析，进行差异脂质的筛选多变量分析（ PCA, PLS-DA）单变量分析（差异倍数及 T 检验）5)差异脂质分析火山图、聚类热图 、 脂质相关性分析6)定制化分析 ：可结合我方的需求，协商确定信息分析内容。其他说明：采购需求中标注“▲”号条款为重要参数，但不作为无效投标条款。 | ||
| 质保及售后服务 | 按行业标准提供服务 | ||
申购单号:CB*
申购主题:宏基因组与代谢组学测序与分析服务
采购单位:深圳大学
报价要求:
发票类型:增值税专用发票
币种:人民币
预算:*.0
签约时间:发布竞价结果后7天内签约合同
送货时间:合同签订后7天内送达
安装要求:免费上门安装（含材料费）
收货地址:广东省/ (略) /南山区/点击查看>>*
付款方式:货到验收合格后付款
备注说明:申购明细：
| 序号 | 采购内容 | 数量 | 预算单价 |
| 1 | 宏基因组与代谢组学测序与分析服务 | 1.0 | *.0 |
| 品牌 | 华大基因 | ||
| 型号 | 无 | ||
| 规格参数 | 一、完成60个人样品的宏基因组信息采集，构建DNBSEQ文库并上机测序， 每个样本的目标采集数据量为10G的clean data，并完成相应的生物信息分析；二、基本分析1.项目概览2.数据过滤3.组装4.基因分析4.1基因Venn图(2-5个样本或组别)4.2基因差异分析（分组≥2，每组样本数≥3）5.基因集功能注释（Eggnog、KEGG、BacMet、CARD、COG、CAZy、Swiss-prot等）6.物种分析6.1 物种柱状图分析6.2 物种丰度热图6.3 样本相似性热图（基于bray/jsd距离）6.4 降维分析6.4.1 NMDS结合Anosim6.4.2 PCA6.4.3 PcoA6.5 物种稀疏曲线分析6.6关键物种挖掘（只支持两个分组）6.7 物种差异分析（Wilcoxon/kruscal，Lefse）（分组≥2，每组样本数≥8）7.功能分析7.1 功能组成分析（高丰度圈图）7.2 功能丰度热图分析降维分析（NMDS结合Anosim，PCA，PcoA）7.3样本相似性热图（基于bray/jsd距离）功能丰度热图分析7.4 降维分析7.4.1 NMDS结合Anosim7.4.2 PCA7.4.3 PcoA7.5功能差异分析（分组≥2，每组样本数≥8）7.5.1 KEGG pathway富集分析7.5.2 其他功能差异盒形图8.多样性分析（分组≥2，每组样本数≥3）8.1基因、物种、功能水平Alpha多样性分析8.2基因、物种、功能水平Beta多样性分析▲三、投标人实验室拥有自主 (略) 50台以上。▲四、标准数据分析结果需上传到可实现数据循环挖掘的交互分析系统中，该系统需包括但不限于以下功能：（1）展现项目所有标准分析内容；（2）图表互动快速分析；（3）具备个性化处理图片功能等。▲五、采用最新KEGG数据库且有正版授权。六、常规代谢组学采用LC-MS/MS方法，完成60个粪便样本的非靶向代谢组学分析，对实验样本内尽可能全面的代谢物进行分析，准确鉴定代谢物，筛选差异代谢物；。1服务要求：1.1采用液相色谱-质谱联用（LC-MS/MS）的方法，比较不同样品中各自的代谢产物以确定其中的差异代谢物（常规代谢组）。1.2采用UPLC- (略) ，质谱仪使用Q Exactive 或者 Q Exactive HF（Thermo Fisher Scientific）平台。1.3用于后续检测的相关试剂盒、试剂需有质量保证并确定是在保质期内检测。2检测质量要求：每样本数据采集时间不得低于15分钟，数据采集模式需正负离子模式同时采集，数据采集时需使用内标及QC样本进行严格质控。3信息分析内容1)数据预处理（滤噪、峰匹配、峰提取）及归一化2)数据质控3)统计分析4)差异离子筛选及鉴定5)差异代谢物分析：差异代谢物聚类分析及差异 (略) 富集分析6)定制化分析 ：可结合我方的需求，协商确定信息分析内容。七、脂质代谢组学采用LC-MS/MS方法，完成60个粪便样本样本的脂质代谢组学分析，对实验样本内尽可能全面的脂质代谢物进行分析，准确鉴定脂质代谢物，筛选差异脂质代谢物；。1.服务要求：1.1 采用液相色谱-质谱联用（LC-MS/MS）的方法，比较不同样品中各自的脂质代谢产物以确定其中的差异脂质代谢物。1.2采用UPLC- (略) ，质谱仪使用Q Exactive 或者 Q Exactive HF（Thermo Fisher Scientific）平台。1.3用于后续检测的相关试剂盒、试剂需有质量保证并确定是在保质期内检测。2检测质量要求：每样本数据采集时间不得低于15分钟，数据采集模式需正负离子模式同时采集，数据采集时需使用内标及QC样本进行严格质控。3信息分析内容：1)数据预处理（滤噪、峰匹配、峰提取）及归一化2)数据质控3)脂质类别的统计和相对定量分析4) 使用 LipidSearch 软件和代谢组学 R 软件包 metaX对数据进行统计分析，进行差异脂质的筛选多变量分析（ PCA, PLS-DA）单变量分析（差异倍数及 T 检验）5)差异脂质分析火山图、聚类热图 、 脂质相关性分析6)定制化分析 ：可结合我方的需求，协商确定信息分析内容。其他说明：采购需求中标注“▲”号条款为重要参数，但不作为无效投标条款。 | ||
| 质保及售后服务 | 按行业标准提供服务 | ||
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