泰州丰达农牧科技有限公司-竞价公告(CBFDNM2023000001)
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泰州丰达农牧科技有限公司-竞价公告(CBFDNM2023000001)
申购单号:CBFDNM*
申购主题:泰州鹅分子身份证构建
采购单位:泰州 (略)
报价要求:
发票类型:增值税普通发票
币种:人民币
预算:
签约时间:发布竞价结果后7天内签约合同
送货时间:合同签订后7天内送达
安装要求:免费上门安装（含材料费）
收货地址: (略) /点击查看>>*
付款方式:合同签订后付款
备注说明:申购明细：
| 序号 | 采购内容 | 数量 | 预算单价 |
| 1 | 泰州鹅分子身份证构建 | 1.0 | 批 |
| 品牌 | 无 | ||
| 型号 | 无 | ||
| 规格参数 | 1）全基因组重测序：对100个动物样本进行基因组重测序。 a.要求每个个体测序深度为10×，每个样品产生不低于10.5G数据; b. 测序得到的reads质量Q（-10log10(P)，其中P为Phred质量评分）应大于20；Q（该reads所有碱基质量值的平均值）大于30的部分应占总reads质量85%以上；c.所有的reads的长度应一致，不一致长度的reads占总体reads的占比最大不得超过95%；d.reads中如果含有接头则需要修剪接头，同时对低质量碱基部分也进行修剪，在修剪完成后，reads的长度仍保留其原有长度的80%以上，该reads予以保留；e.样品测序数据中GC含量应在40%-45%范围内；f.测序结果中重复序列reads占比不得超过20%，10次以上重复的序列在所有reads中占比不得超过10%。2）变异检测分析：根据测序数据，对每个样本进行基因组变异信息（SNP、InDel）分析。3）品种特异位点基因挖掘：根据个体基因型数据及表型信息，进行品种特异性位点基因挖掘。结合样本品种信息和基因型数据，进行生物信息学分析，挖掘性状关联位点，测试并优化位点集。4）品种鉴定芯片设计：基于基因组变异信息和功能位点，筛选和优化位点集，设计20K密度品种鉴定芯片。 a.位点数目：不少于2万个SNP位点；b.测序深度：SNP位点平均测序深度≥100X；c.数据质量：位点检出率＞95%（≥5X）、样本检出率＞95%。5）品种鉴定分析：基于芯片数据，搭建品种纯种参考库，对200个待测样本进行品种鉴定分析。对待测样本进行芯片检测、数据质控和血统含量分析（包括数据和可视化结果）。6）售后由专门技术对接，对后期分析作图提供专业化指导和协助。 | ||
| 质保及售后服务 | 服务年限：2年； | ||
申购单号:CBFDNM*
申购主题:泰州鹅分子身份证构建
采购单位:泰州 (略)
报价要求:
发票类型:增值税普通发票
币种:人民币
预算:
签约时间:发布竞价结果后7天内签约合同
送货时间:合同签订后7天内送达
安装要求:免费上门安装（含材料费）
收货地址: (略) /点击查看>>*
付款方式:合同签订后付款
备注说明:申购明细：
| 序号 | 采购内容 | 数量 | 预算单价 |
| 1 | 泰州鹅分子身份证构建 | 1.0 | 批 |
| 品牌 | 无 | ||
| 型号 | 无 | ||
| 规格参数 | 1）全基因组重测序：对100个动物样本进行基因组重测序。 a.要求每个个体测序深度为10×，每个样品产生不低于10.5G数据; b. 测序得到的reads质量Q（-10log10(P)，其中P为Phred质量评分）应大于20；Q（该reads所有碱基质量值的平均值）大于30的部分应占总reads质量85%以上；c.所有的reads的长度应一致，不一致长度的reads占总体reads的占比最大不得超过95%；d.reads中如果含有接头则需要修剪接头，同时对低质量碱基部分也进行修剪，在修剪完成后，reads的长度仍保留其原有长度的80%以上，该reads予以保留；e.样品测序数据中GC含量应在40%-45%范围内；f.测序结果中重复序列reads占比不得超过20%，10次以上重复的序列在所有reads中占比不得超过10%。2）变异检测分析：根据测序数据，对每个样本进行基因组变异信息（SNP、InDel）分析。3）品种特异位点基因挖掘：根据个体基因型数据及表型信息，进行品种特异性位点基因挖掘。结合样本品种信息和基因型数据，进行生物信息学分析，挖掘性状关联位点，测试并优化位点集。4）品种鉴定芯片设计：基于基因组变异信息和功能位点，筛选和优化位点集，设计20K密度品种鉴定芯片。 a.位点数目：不少于2万个SNP位点；b.测序深度：SNP位点平均测序深度≥100X；c.数据质量：位点检出率＞95%（≥5X）、样本检出率＞95%。5）品种鉴定分析：基于芯片数据，搭建品种纯种参考库，对200个待测样本进行品种鉴定分析。对待测样本进行芯片检测、数据质控和血统含量分析（包括数据和可视化结果）。6）售后由专门技术对接，对后期分析作图提供专业化指导和协助。 | ||
| 质保及售后服务 | 服务年限：2年； | ||
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