基于GPU加速的基因数据分析软件购置采购
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基于GPU加速的基因数据分析软件购置采购
| 项目名称 | 基于GPU加速的基因数据分析软件购置 | 项目编号 | ZBZXJJ* |
|---|---|---|---|
| 公告开始日期 | 2023-11-20 08:41:33 | 公告截止日期 | 2023-11-23 09:00:00 |
| 采购单位 | 四川大学 | 付款方式 | 进口设备： *方与 (略) 签订代理进口委托协议后，将进口项 (略) 指定的银行账户，项目货款仅用于本进口项目的信用证或TT付汇及进口相关费用等。 (略) 收到*方合同货款后，按外贸合同要求及时履行与* (略) 的付款义务。 国产设备：*方应在完成验收并建立固定资产后向*方一次性支付本合同的总款项，*方须向*方出具合法有效完整的完税发票及凭证资料进行支付结算。 |
| 联系人 | 成交后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 成交后在我参与的项目中查看 |
| 签约时间要求 | 到货时间要求 | 成交后3个工作日内 | |
| 预算总价 | ￥ *.00 | ||
| 发票要求 | |||
| 收货地址 | 成都前沿医学中心 | ||
| 供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 | ||
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
|---|---|---|---|
| BaseNumber DNA测序数据分析软件V1.0 | 1 | 套 | 支撑软件 |
| 品牌 | 赛乐基因 |
|---|---|
| 型号 | BaseNumber DNA测序数据分析软件V1.0 |
| 预算单价 | ￥ *.00 |
| 技术参数及配置要求 | 软件须满足以下要求： （1）包含基于GPU加速的全基因组、全外显子、Target panel测序数据的胚系短变异（SNP、INDEL）分析功能。 （2）包含胚系变异的gVCF合并、genotyping的联合变异分析功能。 （3）包含基于GPU加速的全基因组、全外显子、Target panel测序数据的体细胞短变异（SNP、INDEL）分析功能。 （4）包含基于GPU加速的碱基质量校正功能（Base Quality Score Recalibration)。 （5）包含基于GPU加速的BAM文件重比对功能（Realignment)。 （6）包含并行加速的CNV(copy number variation)分析功能。 （7）厂家免费提供分析流程QC指标定制化开发。 （8）在单台GPU服务器上，使用基于GPU加速的基因组数据分析软件完成人类全基因组（30X深度，100G碱基数据）胚系短变异分析（从测序仪下机FASTQ.gz格式文件到VCF格式文件）时间不超过15分钟，且要求以BWA V0.7.17 +GATK V4.1.8流程分析结果为金标准，投标软件分析结果F1 Score不低于99%。 （9）在单台GPU服务器上，使用基于GPU加速的基因组数据分析软件完成人类全外显子（200X深度，10G碱基数据）胚系短变异分析（从测序仪下机FASTQ.gz格式文件到VCF格式文件）时间不超过2分钟，且要求以BWA V0.7.17 +GATK V4.1.8流程分析结果为金标准，投标软件分析结果F1 Score不低于99%。 （10）在单台GPU服务器上，使用基于GPU加速的基因组数据分析软件完成人类全外显子（800X深度，40G碱基数据）体细胞短变异分析（从测序仪下机FASTQ.gz格式文件到VCF格式文件）时间不超过10分钟。 （11）软件在单台GPU服务器上一年可以完成4P碱基测序数据的胚系短变异分析。 （12）软件在单台GPU服务器上，可以在55分钟内完成一组家系样本（3个人类全基因组30X数据）的联合变异分析（从测序仪下机FASTQ.gz格式文件到合并后的VCF格式文件）。 （13）适配GPU型号 RTX 3090，A100等。 （14）可同时支持不少于2块GPU。 |
| 售后服务 | 服务年限:36月;电话支持:7x24小时;质保期:三年;在保修期内，中标公司需在用户指定现场提供共计不少于12个人月的驻场服务。; |
四川大学
2023-11-20 08:41:33
| 项目名称 | 基于GPU加速的基因数据分析软件购置 | 项目编号 | ZBZXJJ* |
|---|---|---|---|
| 公告开始日期 | 2023-11-20 08:41:33 | 公告截止日期 | 2023-11-23 09:00:00 |
| 采购单位 | 四川大学 | 付款方式 | 进口设备： *方与 (略) 签订代理进口委托协议后，将进口项 (略) 指定的银行账户，项目货款仅用于本进口项目的信用证或TT付汇及进口相关费用等。 (略) 收到*方合同货款后，按外贸合同要求及时履行与* (略) 的付款义务。 国产设备：*方应在完成验收并建立固定资产后向*方一次性支付本合同的总款项，*方须向*方出具合法有效完整的完税发票及凭证资料进行支付结算。 |
| 联系人 | 成交后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 成交后在我参与的项目中查看 |
| 签约时间要求 | 到货时间要求 | 成交后3个工作日内 | |
| 预算总价 | ￥ *.00 | ||
| 发票要求 | |||
| 收货地址 | 成都前沿医学中心 | ||
| 供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 | ||
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
|---|---|---|---|
| BaseNumber DNA测序数据分析软件V1.0 | 1 | 套 | 支撑软件 |
| 品牌 | 赛乐基因 |
|---|---|
| 型号 | BaseNumber DNA测序数据分析软件V1.0 |
| 预算单价 | ￥ *.00 |
| 技术参数及配置要求 | 软件须满足以下要求： （1）包含基于GPU加速的全基因组、全外显子、Target panel测序数据的胚系短变异（SNP、INDEL）分析功能。 （2）包含胚系变异的gVCF合并、genotyping的联合变异分析功能。 （3）包含基于GPU加速的全基因组、全外显子、Target panel测序数据的体细胞短变异（SNP、INDEL）分析功能。 （4）包含基于GPU加速的碱基质量校正功能（Base Quality Score Recalibration)。 （5）包含基于GPU加速的BAM文件重比对功能（Realignment)。 （6）包含并行加速的CNV(copy number variation)分析功能。 （7）厂家免费提供分析流程QC指标定制化开发。 （8）在单台GPU服务器上，使用基于GPU加速的基因组数据分析软件完成人类全基因组（30X深度，100G碱基数据）胚系短变异分析（从测序仪下机FASTQ.gz格式文件到VCF格式文件）时间不超过15分钟，且要求以BWA V0.7.17 +GATK V4.1.8流程分析结果为金标准，投标软件分析结果F1 Score不低于99%。 （9）在单台GPU服务器上，使用基于GPU加速的基因组数据分析软件完成人类全外显子（200X深度，10G碱基数据）胚系短变异分析（从测序仪下机FASTQ.gz格式文件到VCF格式文件）时间不超过2分钟，且要求以BWA V0.7.17 +GATK V4.1.8流程分析结果为金标准，投标软件分析结果F1 Score不低于99%。 （10）在单台GPU服务器上，使用基于GPU加速的基因组数据分析软件完成人类全外显子（800X深度，40G碱基数据）体细胞短变异分析（从测序仪下机FASTQ.gz格式文件到VCF格式文件）时间不超过10分钟。 （11）软件在单台GPU服务器上一年可以完成4P碱基测序数据的胚系短变异分析。 （12）软件在单台GPU服务器上，可以在55分钟内完成一组家系样本（3个人类全基因组30X数据）的联合变异分析（从测序仪下机FASTQ.gz格式文件到合并后的VCF格式文件）。 （13）适配GPU型号 RTX 3090，A100等。 （14）可同时支持不少于2块GPU。 |
| 售后服务 | 服务年限:36月;电话支持:7x24小时;质保期:三年;在保修期内，中标公司需在用户指定现场提供共计不少于12个人月的驻场服务。; |
四川大学
2023-11-20 08:41:33
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