实体瘤组织全外显子测序分析
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实体瘤组织全外显子测序分析
| 基本信息： | |
| 申购单主题： | 实体瘤组织全外显子测序分析 |
| 申购单类型： | 竞价类 |
| 设备类别： | 基础医学研究服务 |
| 经办人： | 苏俊沛 |
| 经办人联系号码： | * |
| 报价要求： | 报价为包干总价，为报价人完成采购项目全部义务的总价格，包括但不限于购买标的的费用、运输费、保险费、装卸费、配套资料费、安装调试费用、验收时的试剂耗材、强制性第三方监督检验机构的验收检验费、培训费用、税费以及售后服务费用等全部费用。所报价格不得高于最高限价。 |
| 最高总限价： | 36730.00 |
| 使用币种： | 人民币 |
| 小额采购开始时间： | 2023-12-25 18:17 |
| 小额采购结束时间： | 2023-12-27 18:00 我要报价 |
| 申购备注： | |
| 申购设备详情： |
| 设备名称 | 数量 | 单位 | 最高限价 | 品牌 | 型号 | 售后服务 | 技术要求 | 附件 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 实体瘤组织全外显子测序分析 | 20 | 例 | 36730.00 | 无固定品牌 | 无固定型号 | （1）*方在收到*方样品及相关送样单后开始样品检测。 （2） *方在样品检测合格后 15 个工作日内完成全部测序及测序数据的处理工作并向*方提交所有原始测序数据、完整的项目分析结果和完成报告。 （3） 数据交付后，*方根据本项目研究需求提供针对本项目数据的个性化分析服务，直至文章产出。 | 一、 文库构建180-280bp 二、 PE150测序 三、 基本信息分析 1.数据质控：去除接头污染和低质量数据 2.与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度 3. 聚类分析样本间一致性 4. Somatic SNP / InDel / CNV 检测、注释及统计（成对样本） 四、 深入分析 1. MRT 高频突变基因相关性分析（>2对样本） 1.1 高频突变基因协同作用分析 1.2 高频突变基因互斥作用分析 2. 驱动基因预测（>2对样本） 2.1 OncodriveCLUST 2.2 OncodriveFM 2.3 驱动基因整体预测 3.突变位点分布情况分析 4. 高频 CNV 分析 4.1 CNV 分布分析 4.2 高频CNV 分析（>2对样本） 5. ABSOLUTE肿瘤纯度及倍性分析 6. 杂合性缺失（LOH）分析 7. 克隆结构分析 7.1 体细胞突变 CCF 分析 7.2 单样本克隆结构分析（Pyclone） 五、肿瘤进化分析 1. 多样本克隆结构分析 2. 临床数据整合 3. 突变频谱3D展示图 4. Conpair分析样本间一致性和污染程度 | 无 |
| 基本信息： | |
| 申购单主题： | 实体瘤组织全外显子测序分析 |
| 申购单类型： | 竞价类 |
| 设备类别： | 基础医学研究服务 |
| 经办人： | 苏俊沛 |
| 经办人联系号码： | * |
| 报价要求： | 报价为包干总价，为报价人完成采购项目全部义务的总价格，包括但不限于购买标的的费用、运输费、保险费、装卸费、配套资料费、安装调试费用、验收时的试剂耗材、强制性第三方监督检验机构的验收检验费、培训费用、税费以及售后服务费用等全部费用。所报价格不得高于最高限价。 |
| 最高总限价： | 36730.00 |
| 使用币种： | 人民币 |
| 小额采购开始时间： | 2023-12-25 18:17 |
| 小额采购结束时间： | 2023-12-27 18:00 我要报价 |
| 申购备注： | |
| 申购设备详情： |
| 设备名称 | 数量 | 单位 | 最高限价 | 品牌 | 型号 | 售后服务 | 技术要求 | 附件 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 实体瘤组织全外显子测序分析 | 20 | 例 | 36730.00 | 无固定品牌 | 无固定型号 | （1）*方在收到*方样品及相关送样单后开始样品检测。 （2） *方在样品检测合格后 15 个工作日内完成全部测序及测序数据的处理工作并向*方提交所有原始测序数据、完整的项目分析结果和完成报告。 （3） 数据交付后，*方根据本项目研究需求提供针对本项目数据的个性化分析服务，直至文章产出。 | 一、 文库构建180-280bp 二、 PE150测序 三、 基本信息分析 1.数据质控：去除接头污染和低质量数据 2.与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度 3. 聚类分析样本间一致性 4. Somatic SNP / InDel / CNV 检测、注释及统计（成对样本） 四、 深入分析 1. MRT 高频突变基因相关性分析（>2对样本） 1.1 高频突变基因协同作用分析 1.2 高频突变基因互斥作用分析 2. 驱动基因预测（>2对样本） 2.1 OncodriveCLUST 2.2 OncodriveFM 2.3 驱动基因整体预测 3.突变位点分布情况分析 4. 高频 CNV 分析 4.1 CNV 分布分析 4.2 高频CNV 分析（>2对样本） 5. ABSOLUTE肿瘤纯度及倍性分析 6. 杂合性缺失（LOH）分析 7. 克隆结构分析 7.1 体细胞突变 CCF 分析 7.2 单样本克隆结构分析（Pyclone） 五、肿瘤进化分析 1. 多样本克隆结构分析 2. 临床数据整合 3. 突变频谱3D展示图 4. Conpair分析样本间一致性和污染程度 | 无 |
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