300例人全基因组高通量测序服务-采购公告

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300例人全基因组高通量测序服务-采购公告

商品信息:3 300例人全基因组高通量测序服务-采购项目技术指标及配置需求表(定稿).docx

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商品信息:2 300例人全基因组高通量测序服务-经济要求(定稿).docx

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品牌:

货号/型号:

商品信息:300例人全基因组高通量测序服务

商品参数:(一) (略) 要求★1、投标人应提供具体测序方案和流程,对本项目的检测服务必须采用投标方设备完成,不可外包2*、投标人应具备固定的测序团队(≥5人)执行测序服务,并保证 (略) 相匹配的试剂储备,支持整个项目完成(需提供项目团队人员工作证件);3*、投标人需具备完整的实验室管理体系(二)测序技术性能指标1、支持*方提供全血或DNA。全血提供量200μl~1ml,DNA提供量300ng~1μg,浓度 ≥ 20 ng / ul,OD260 / 280= 1.8~2.2。2、接受检测合格样本量:接受并检测*方提供的不少于300例样本的质控和测序分析报告。3、投标人可在 2 小时内上门交接样本,提供免费冷链运输(保证样本运输过程中质量不受影响);4、单个样本原始数据产出要求: Raw Data≥90G,Q30≥85%,Duplication rate<10%,单样本平均测序深度≥30x,10×Reads 覆盖率≥90%,测序数据GC 含量 40-45%。5、建库质量要求5.1* 核酸起始量要求:能够在核酸起始量≤300ng的情况下,完成样本质检以及建库;5.2 插入片段检测单峰,分布均匀,且呈标准正态分布;5.3 测序序列通过比对检查,微生物、载体、叶绿体和线粒体等非测序目标 DNA 污染序列比例<10%;5.4 测序文库浓度≥2nM,体积≥20ul。6、数据分析6.1 原始数据质控评估,去除接头污染和低质量数据的过滤及统计,基因组比对,覆盖度、测序深度分析报告;6.2* Germline SNV/InDel/CNV/SV 检测,并保存用于 call variants 的 bam 文件,gvcf 文件,提供完整的分析报告;6.3提供GWAS分析和数据运算服务以及完整的分析方案;(三)检测周期及数据传输、数据存储和交付1*、一次性完成1000例及以上核酸样本的全基因组高通量测序以及分析,并能够在45个自然日内完成数据/报告交付;2*、应保证已交付数据存储时长≥1年。供*方综合评估(投标人须提供书面的数据存储条件和时长的承诺,并盖章);3、原始数据传输需安全合理,通过硬盘(投标方提供)交付数据)。

规格:300例人全基因组高通量测序

计量单位:次

项目类型:技术服务

商品信息:300例人全基因组高通量测序服务

项目编号:*

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商品参数:(一) (略) 要求★1、投标人应提供具体测序方案和流程,对本项目的检测服务必须采用投标方设备完成,不可外包2*、投标人应具备固定的测序团队(≥5人)执行测序服务,并保证 (略) 相匹配的试剂储备,支持整个项目完成(需提供项目团队人员工作证件);3*、投标人需具备完整的实验室管理体系(二)测序技术性能指标1、支持*方提供全血或DNA。全血提供量200μl~1ml,DNA提供量300ng~1μg,浓度 ≥ 20 ng / ul,OD260 / 280= 1.8~2.2。2、接受检测合格样本量:接受并检测*方提供的不少于300例样本的质控和测序分析报告。3、投标人可在 2 小时内上门交接样本,提供免费冷链运输(保证样本运输过程中质量不受影响);4、单个样本原始数据产出要求: Raw Data≥90G,Q30≥85%,Duplication rate<10%,单样本平均测序深度≥30x,10×Reads 覆盖率≥90%,测序数据GC 含量 40-45%。5、建库质量要求5.1* 核酸起始量要求:能够在核酸起始量≤300ng的情况下,完成样本质检以及建库;5.2 插入片段检测单峰,分布均匀,且呈标准正态分布;5.3 测序序列通过比对检查,微生物、载体、叶绿体和线粒体等非测序目标 DNA 污染序列比例<10%;5.4 测序文库浓度≥2nM,体积≥20ul。6、数据分析6.1 原始数据质控评估,去除接头污染和低质量数据的过滤及统计,基因组比对,覆盖度、测序深度分析报告;6.2* Germline SNV/InDel/CNV/SV 检测,并保存用于 call variants 的 bam 文件,gvcf 文件,提供完整的分析报告;6.3提供GWAS分析和数据运算服务以及完整的分析方案;(三)检测周期及数据传输、数据存储和交付1*、一次性完成1000例及以上核酸样本的全基因组高通量测序以及分析,并能够在45个自然日内完成数据/报告交付;2*、应保证已交付数据存储时长≥1年。供*方综合评估(投标人须提供书面的数据存储条件和时长的承诺,并盖章);3、原始数据传输需安全合理,通过硬盘(投标方提供)交付数据)。

规格:300例人全基因组高通量测序

计量单位:次

项目类型:技术服务

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