辅助药物设计平台（GY202209059）废标公告

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辅助药物设计平台（GY202209059）废标公告

项目名称辅助药物设计平台项目编号GY*
公告开始日期*公告截止日期*
采购单位山东大学付款方式电汇，预付90%，货到验收10%
联系人中标后在我参与的项目中查看联系电话中标后在我参与的项目中查看
签约时间要求成交后15个工作日内到货时间要求收到信用证后1个月内
预 算71000.0
收货地址山东大学趵突泉校区模式动物中心210
供应商资质要求

符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购商品采购数量计量单位所属分类
辅助药物设计平台1套其他
品牌Schr？dinger
型号Schr？dinger
品牌2无
型号无
品牌3无
型号无
预算71000.0
技术参数及配置要求1、提供药物靶标结构模建功能，模建时序列比对提供Blast和PSI-Blast两种方法，蛋白家族认证时使用HMMER/Pfam方法。软件在确定模版时可以考虑家族信息。靶标Loop区预测采用从头预测的方法，至少可预测14个氨基酸长度；2、提供以下算法评价靶标蛋白结构的合理区和不合理区：RamachandranPlot；Pehttp://**；StericClashes；BondLenghttp://**；BondAngleDeviations；BackboneDihedrals；SidechainDihedrals；G-factorSummary；AverageB-factors；GammaAtomB-factors；SidechainPlanarity；ImproperTorsions；C-alhttp://**；MissingAtoms；3、动力学功能可以在GPU上运行，并提供随机动力学和分子动力学两种优化方法。软件提供OPLS4力场；4、可以预测药物靶标配体的ADME性质，能够在对接过程中，对整个数据库，或者单个分子计算ADME性质。计算的ADME性质包含反应官能团（引起对接结果的假阳性和生物体内毒性问题）、药物针对中枢神经系统的活性、药物封闭HERG K+通道的IC50值、药物的血脑屏障及血脑屏障模型MDCK细胞的渗透性；药物的皮肤渗透性、可能的代谢反应的数量、药物和人的血清白蛋白的结合能力、口服药物的吸收性、药物从皮肤吸收到血液的最大渗透率等等；5、所有软件功能必须在统一图形操作界面下运行，除靶标活性位点水分子图功能外，其他功能要求提供五年的软件使用权限，并且包含五年的软件升级；6、绘制使蛋白质结合位点溶剂化的水分子的位置和热力学性质，可以对口袋的性质提供丰富的物理见解，并定量描述驱动小分子结合的疏水力。7、软件基本操作界面（用户图形界面）在同一台终端上或不同终端上可以同时打50个界面8、使用期限：5年（其中Water map模块1年9.、提供原厂授权及质保函。
售后服务服务网点:不限;质保期限:1年;响应期限:报修后48小时;

信息来源：http://**
项目名称辅助药物设计平台项目编号GY*
公告开始日期*公告截止日期*
采购单位山东大学付款方式电汇，预付90%，货到验收10%
联系人中标后在我参与的项目中查看联系电话中标后在我参与的项目中查看
签约时间要求成交后15个工作日内到货时间要求收到信用证后1个月内
预 算71000.0
收货地址山东大学趵突泉校区模式动物中心210
供应商资质要求

符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购商品采购数量计量单位所属分类
辅助药物设计平台1套其他
品牌Schr？dinger
型号Schr？dinger
品牌2无
型号无
品牌3无
型号无
预算71000.0
技术参数及配置要求1、提供药物靶标结构模建功能，模建时序列比对提供Blast和PSI-Blast两种方法，蛋白家族认证时使用HMMER/Pfam方法。软件在确定模版时可以考虑家族信息。靶标Loop区预测采用从头预测的方法，至少可预测14个氨基酸长度；2、提供以下算法评价靶标蛋白结构的合理区和不合理区：RamachandranPlot；Pehttp://**；StericClashes；BondLenghttp://**；BondAngleDeviations；BackboneDihedrals；SidechainDihedrals；G-factorSummary；AverageB-factors；GammaAtomB-factors；SidechainPlanarity；ImproperTorsions；C-alhttp://**；MissingAtoms；3、动力学功能可以在GPU上运行，并提供随机动力学和分子动力学两种优化方法。软件提供OPLS4力场；4、可以预测药物靶标配体的ADME性质，能够在对接过程中，对整个数据库，或者单个分子计算ADME性质。计算的ADME性质包含反应官能团（引起对接结果的假阳性和生物体内毒性问题）、药物针对中枢神经系统的活性、药物封闭HERG K+通道的IC50值、药物的血脑屏障及血脑屏障模型MDCK细胞的渗透性；药物的皮肤渗透性、可能的代谢反应的数量、药物和人的血清白蛋白的结合能力、口服药物的吸收性、药物从皮肤吸收到血液的最大渗透率等等；5、所有软件功能必须在统一图形操作界面下运行，除靶标活性位点水分子图功能外，其他功能要求提供五年的软件使用权限，并且包含五年的软件升级；6、绘制使蛋白质结合位点溶剂化的水分子的位置和热力学性质，可以对口袋的性质提供丰富的物理见解，并定量描述驱动小分子结合的疏水力。7、软件基本操作界面（用户图形界面）在同一台终端上或不同终端上可以同时打50个界面8、使用期限：5年（其中Water map模块1年9.、提供原厂授权及质保函。
售后服务服务网点:不限;质保期限:1年;响应期限:报修后48小时;

信息来源：http://**
    
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