委托第三方开展单细胞测序技术检测项目第一次流标暨第二次采购公告

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委托第三方开展单细胞测序技术检测项目第一次流标暨第二次采购公告

委托第三方开展单细胞测序技术检测项目第一次流标暨第二次采购公告

(2023-JQXWCD-F3027)

2023年5月11日,我部对该项目进行了第一次招标,因有效供应商数量不足三家,该项目流标。现就以下项目进行第二次竞争性谈判,采购资金已全部落实,欢迎符合条件的供应商参加。

一、项目名称:委托第三方开展单细胞测序技术检测项目

二、项目编号:2023-JQXWCD-F3027

三、项目概况:

序号

项目及品种名称

物资质量技术标准或服务内容及标准要求

计量
单位

采购
数量

预算单价(万元)

预算
总金额
(万元)

交货(服务)地点

交货(服务)期限

备注




合计



30

1.9

57






(一)

项目名称











1

单细胞测序

一.技术指标
1.细胞直径:5um≤细胞直径≤30um
2.细胞活性:要求大于80%以上
3.细胞捕获率:大于65%
4.细胞捕获数量:5000-*个细胞
5.多细胞的捕获数:小于0.9%/1000cells
6.测序数据量:一般情况下,推荐每个细胞测50,000-100,000条reads,即得每个细胞测15-30M数据量。测序存在一定饱和性,适当加大测序数据量可提高基因的检出率
7.试剂类型:V3.1试剂
二.分析指标
1.测序饱和度:80%以上
2.Q30:90%以上
3.有效barcode:90%以上
4.Fraction reads:70%以上
5.外显子mapping率:60%以上
6.基因检出数量:1000-3000个之间
三.分析内容
3.1 标准分析
3.1.1.RawData数据质量评估
3.1.2.Cell Ranger表达矩阵统计
3.1.3.细胞过滤质控分析
3.1.4.Cell Ranger降维和聚类分析
3.1.5.差异基因
3.1.6.差异基因富集分析
3.2 高级分析
3.2.1.NovoCM 辅助细胞定义
3.2.2.细胞分群占?统计
3.2.3.差异基因展示
3.2.4.功能富集分析(GO/KEGG/Reactome)
3.2.5.蛋白互作分析
3.2.6.差异基因TF注释
3.3 个性化分析
3.3.1.Scanpy ?级分析
3.3.2.拟时分析(拟时分析/RNA velocyto速率分析/psupertime 有监督伪时间推断)
3.3.3.细胞通讯配受体分析(CellPhoneDB/Celltalker/CSOmap)
3.3.4.SCENIC转录因?调控?络
3.3.5.inferCNV 基因组拷?数推断
3.3.6.SNP突变推断
3.3.7.辅助细胞定义
3.3.8.多组学联合分析(10x单细胞转录和10x空间转录组):使用的软件是Seurat V3/LIGER。
3.3.9.批次整合分析(Seurat V3/Harmony/LIGER)
3.3.10.其它定制化个性分析

30

1.9

57

成都

(略) 30天内交付报告






















1.本项目是否接受联合体谈判:否;

2.项目预算:*;

3.最高限价:*;

四、报价供应商资格条件

(一)具有企(事)业法人资格(有行业特殊情况的银行、保险、电力、电信等法人分支机构,会计师、律师等非法人组织,行业协会等社会团体法人除外);

(二)国有企业;事业单位;军队单位;成立三年以上的非外资(含港澳台)独资或控股企业;

(三)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;

(四)具有履行合同所必需的设施设备、专业技术能力、质量保证体系和固定的生产经营、服务场地;

(五)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;

(六)参加军队采购活动前3年内,在经营活动中没有受到刑事处罚或者责令停产停业、吊销许可证或者执照、较大数额罚款(*元以上)等重大违法记录;

(七)未被中国 (略) (http://**.cn)列入政府采购严重违法失信行为记录名单,未在 (略) (www.http://**)军队采购暂停名单处罚范围内或军队采购失信名单禁入处罚期和处罚范围内,以及未被“信用中国”(http://**.cn)列入严重失信主体名单或国家企业信用信息公示系统(http://**.cn)列入严重违法失信名单(处罚期内)。

(八)投标企业应当具备服务履约的能力。

(九)单位负责人为同一人或存在直接控股或管理关系的不同供应商,不得同时参加同一包的采购活动。生产场经营地址或注册登记地址为同一地址的不同生产型企业,股东和管理人员(法定代表人、董事或监事)之间存在近亲属或相互占股等关联关系的不同非国有销售型企业,也不得同时参加同一包的采购活动。近亲属指夫妻、直系血亲、三代以内旁系血亲或近姻亲关系。

(十)供应商管理信息系统进行注册:参加本单位采购活动的供应商,必须事先通过 (略) ( (略) :http://**)供应商管理信息系统进行注册,实行凡采必入。依托电子招投标系统实施的电子化项目,供应商必须完成注册,方可报名、获取采购文件。线下组织的非电子化项目,供应商可先行获取采购文件,但必须在提交投标(报价)文件截止时间前完成注册,未完成的不得参加采购活动(应急采购项目除外)。提供完成注册相关证明截图。

五、谈判文件申领时间、地点、方式

(一)申领时间:2024年5月16日至5月22日,每工作日上午8:00至11:30,下午15:00至17:30(申领时间不少于5个工作日)

(二)申领地点:电子邮箱。

(三)申领谈判文件时需提供以下材料:

1.营业执照或事业单位法人证书复印件加盖公章(军队单位不需要提供);

2.法定代表人资格证明书原件;

3.法定代表人授权书原件,授权代表身份证和授权代表在报价前4个月内(不含报价当月)连续3个月由报价供应商缴纳社保证明材料的复印件;

4.非外资独资企业或控股企业的书面声明(事业单位、军队单位不需要提供);

5.报价供应商主要股东或出资人信息;

6.未被列入本公告第四条第(七)项明确的违法失信名单的承诺书;

7.报名登记表

(四)申领方式

网上发送。报价供应商采取发送电子邮件方式提交报名材料,邮件主题:项目名称+项目编号+公司名称;邮件内容:列明公司名称、法定代表人或授权代表人姓名及联系方式;邮件附件:需采用A4纸幅面,将报名材料加盖企业鲜章,按顺序制作成1个PDF格式文件,文件名称与主题一致,复印件扫描无效。报名材料审核通过后,采购机构联系人向供应商邮箱发送谈判文件电子版;审核未通过的,采购机构联系人以邮件形式回复审核情况,供应商可在谈判文件申领时间内重新提交材料。采购机构或代理机构邮箱:*@*q.com。

(五)免收标书费。

六、报价开始和截止时间及地点、方式

(一)投标开始时间:2024年5 月30日10时00分。

(二)投标截止时间:2024年5 月30日10时30分。

(三)投标地点: (略) 高新区盛邦街88号“汇锦广场”C座1单元904号。

(四)投标方式:由投标供应商法定代表人或授权代表现场提交投标文件,不接受邮寄等其他方式。

七、开标时间、地点

(一)开标时间:2024年5 月30日10时30分(应当与投标截止时间保持一致)。

(二)开标地点: (略) 高新区盛邦街88号“汇锦广场”C座1单元904号。

八、本采购项目相关信息在《 (略) 》(www.http://**) (略) (略) (http://**)上发布。

九、采购机构联系方式

联系人:*@*q.com

代理机构:刘宇宁、孙丹凤028- *、010-*

十、监督部门联系方式


项目监督人:医院纪委


委托第三方开展单细胞测序技术检测项目第一次流标暨第二次采购公告

(2023-JQXWCD-F3027)

2023年5月11日,我部对该项目进行了第一次招标,因有效供应商数量不足三家,该项目流标。现就以下项目进行第二次竞争性谈判,采购资金已全部落实,欢迎符合条件的供应商参加。

一、项目名称:委托第三方开展单细胞测序技术检测项目

二、项目编号:2023-JQXWCD-F3027

三、项目概况:

序号

项目及品种名称

物资质量技术标准或服务内容及标准要求

计量
单位

采购
数量

预算单价(万元)

预算
总金额
(万元)

交货(服务)地点

交货(服务)期限

备注




合计



30

1.9

57






(一)

项目名称











1

单细胞测序

一.技术指标
1.细胞直径:5um≤细胞直径≤30um
2.细胞活性:要求大于80%以上
3.细胞捕获率:大于65%
4.细胞捕获数量:5000-*个细胞
5.多细胞的捕获数:小于0.9%/1000cells
6.测序数据量:一般情况下,推荐每个细胞测50,000-100,000条reads,即得每个细胞测15-30M数据量。测序存在一定饱和性,适当加大测序数据量可提高基因的检出率
7.试剂类型:V3.1试剂
二.分析指标
1.测序饱和度:80%以上
2.Q30:90%以上
3.有效barcode:90%以上
4.Fraction reads:70%以上
5.外显子mapping率:60%以上
6.基因检出数量:1000-3000个之间
三.分析内容
3.1 标准分析
3.1.1.RawData数据质量评估
3.1.2.Cell Ranger表达矩阵统计
3.1.3.细胞过滤质控分析
3.1.4.Cell Ranger降维和聚类分析
3.1.5.差异基因
3.1.6.差异基因富集分析
3.2 高级分析
3.2.1.NovoCM 辅助细胞定义
3.2.2.细胞分群占?统计
3.2.3.差异基因展示
3.2.4.功能富集分析(GO/KEGG/Reactome)
3.2.5.蛋白互作分析
3.2.6.差异基因TF注释
3.3 个性化分析
3.3.1.Scanpy ?级分析
3.3.2.拟时分析(拟时分析/RNA velocyto速率分析/psupertime 有监督伪时间推断)
3.3.3.细胞通讯配受体分析(CellPhoneDB/Celltalker/CSOmap)
3.3.4.SCENIC转录因?调控?络
3.3.5.inferCNV 基因组拷?数推断
3.3.6.SNP突变推断
3.3.7.辅助细胞定义
3.3.8.多组学联合分析(10x单细胞转录和10x空间转录组):使用的软件是Seurat V3/LIGER。
3.3.9.批次整合分析(Seurat V3/Harmony/LIGER)
3.3.10.其它定制化个性分析

30

1.9

57

成都

(略) 30天内交付报告






















1.本项目是否接受联合体谈判:否;

2.项目预算:*;

3.最高限价:*;

四、报价供应商资格条件

(一)具有企(事)业法人资格(有行业特殊情况的银行、保险、电力、电信等法人分支机构,会计师、律师等非法人组织,行业协会等社会团体法人除外);

(二)国有企业;事业单位;军队单位;成立三年以上的非外资(含港澳台)独资或控股企业;

(三)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度;

(四)具有履行合同所必需的设施设备、专业技术能力、质量保证体系和固定的生产经营、服务场地;

(五)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录;

(六)参加军队采购活动前3年内,在经营活动中没有受到刑事处罚或者责令停产停业、吊销许可证或者执照、较大数额罚款(*元以上)等重大违法记录;

(七)未被中国 (略) (http://**.cn)列入政府采购严重违法失信行为记录名单,未在 (略) (www.http://**)军队采购暂停名单处罚范围内或军队采购失信名单禁入处罚期和处罚范围内,以及未被“信用中国”(http://**.cn)列入严重失信主体名单或国家企业信用信息公示系统(http://**.cn)列入严重违法失信名单(处罚期内)。

(八)投标企业应当具备服务履约的能力。

(九)单位负责人为同一人或存在直接控股或管理关系的不同供应商,不得同时参加同一包的采购活动。生产场经营地址或注册登记地址为同一地址的不同生产型企业,股东和管理人员(法定代表人、董事或监事)之间存在近亲属或相互占股等关联关系的不同非国有销售型企业,也不得同时参加同一包的采购活动。近亲属指夫妻、直系血亲、三代以内旁系血亲或近姻亲关系。

(十)供应商管理信息系统进行注册:参加本单位采购活动的供应商,必须事先通过 (略) ( (略) :http://**)供应商管理信息系统进行注册,实行凡采必入。依托电子招投标系统实施的电子化项目,供应商必须完成注册,方可报名、获取采购文件。线下组织的非电子化项目,供应商可先行获取采购文件,但必须在提交投标(报价)文件截止时间前完成注册,未完成的不得参加采购活动(应急采购项目除外)。提供完成注册相关证明截图。

五、谈判文件申领时间、地点、方式

(一)申领时间:2024年5月16日至5月22日,每工作日上午8:00至11:30,下午15:00至17:30(申领时间不少于5个工作日)

(二)申领地点:电子邮箱。

(三)申领谈判文件时需提供以下材料:

1.营业执照或事业单位法人证书复印件加盖公章(军队单位不需要提供);

2.法定代表人资格证明书原件;

3.法定代表人授权书原件,授权代表身份证和授权代表在报价前4个月内(不含报价当月)连续3个月由报价供应商缴纳社保证明材料的复印件;

4.非外资独资企业或控股企业的书面声明(事业单位、军队单位不需要提供);

5.报价供应商主要股东或出资人信息;

6.未被列入本公告第四条第(七)项明确的违法失信名单的承诺书;

7.报名登记表

(四)申领方式

网上发送。报价供应商采取发送电子邮件方式提交报名材料,邮件主题:项目名称+项目编号+公司名称;邮件内容:列明公司名称、法定代表人或授权代表人姓名及联系方式;邮件附件:需采用A4纸幅面,将报名材料加盖企业鲜章,按顺序制作成1个PDF格式文件,文件名称与主题一致,复印件扫描无效。报名材料审核通过后,采购机构联系人向供应商邮箱发送谈判文件电子版;审核未通过的,采购机构联系人以邮件形式回复审核情况,供应商可在谈判文件申领时间内重新提交材料。采购机构或代理机构邮箱:*@*q.com。

(五)免收标书费。

六、报价开始和截止时间及地点、方式

(一)投标开始时间:2024年5 月30日10时00分。

(二)投标截止时间:2024年5 月30日10时30分。

(三)投标地点: (略) 高新区盛邦街88号“汇锦广场”C座1单元904号。

(四)投标方式:由投标供应商法定代表人或授权代表现场提交投标文件,不接受邮寄等其他方式。

七、开标时间、地点

(一)开标时间:2024年5 月30日10时30分(应当与投标截止时间保持一致)。

(二)开标地点: (略) 高新区盛邦街88号“汇锦广场”C座1单元904号。

八、本采购项目相关信息在《 (略) 》(www.http://**) (略) (略) (http://**)上发布。

九、采购机构联系方式

联系人:*@*q.com

代理机构:刘宇宁、孙丹凤028- *、010-*

十、监督部门联系方式


项目监督人:医院纪委


    
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