30

非靶向蛋白组（含高丰度蛋白检测）

1. (略) 要求：供应商需要自行准备的仪器至少包括Agilent生物分析仪、PCR仪、Illumina Novaseq X (略) ，DNBSEQ- (略) ，并能同步开展多组学项目。

2.技术要求：

1) DNA质量合格，总量满足要求。建议起始量：0.2μg；最低起始量：0.1μg；

2) 主带清晰。如DNA降解严重但是降解片段集中于1000bp以上（包括本数），经采购人同意可进行风险建库

3) 浓度：> 30 ng/μL

3.数据产出质量和数量要求：

1) 所有样本平均产出≥最终规格

2）数据质量Q20>90%，Q30>85％

3) N50≥1000

4.检测周期：

收到样品后不超过25个自然日

5.结果交付：

1）分析结果包含

1.1 数据质控统计表

1.2 有效数据统计

1.3 Alpha多样性分析，Beta多样性分析，物种注释与优势菌展示，物种差异分析

46

宏基因组建库测序

根据样品进行DNA提取，进行转录组测序和生物信息学分析，Q30 ≥80%。测序数据量（Clean data）：10G，分析内容：样本间基因表达水平的相关性分析、基因差异表达分析、差异表达基因的GO及KEGG富集分析、差异表达基因的蛋 (略) 络分析、差异表达基因中的转录因子鉴定等。包括个性化分析。

30

非靶向蛋白组（含高丰度蛋白检测）

针对样本进行相对定量（常规+全扫描），常规非靶向定量分析使用液质联用（LC-MS/MS)技术，基于鸟枪法（shotgun）的数据采集方式。全扫描定量分析采用DIA（data-independent acquisition）技术(包括预实验评估和自建库)。质谱性能要求如下：仪器参数：全扫描MS：100fg 上柱量利血平的S/N为150：1、SIM：50 fg 上柱量利血平的S/N为150：1，分辨率为240,000 @ m/z 200，扫描速度为40 Hz； (略) （常规）：用软件Mascot2.2和Proteome Discoverer1.4进行查库鉴定及定量分析； (略) （全扫描）：Proteome Discoverer 2.2进行搜库，数据处理采用Spectronaut TM Pulsar；拥有质谱仪，具备自主蛋白提取，质谱测序等实验条件。

46

宏基因组建库测序

根据样品进行DNA提取，进行宏基因组测序和生物信息学分析，Q30 ≥80%。测序数据量（Clean data）：10G，分析内容：样本间基因表达水平的相关性分析、基因差异表达分析、差异表达基因的GO及KEGG富集分析、差异表达基因的蛋 (略) 络分析、差异表达基因中的转录因子鉴定等。包括个性化分析。

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非靶向蛋白组（含高丰度蛋白检测）

1. (略) 要求：供应商需要自行准备的仪器至少包括Agilent生物分析仪、PCR仪、Illumina Novaseq X (略) ，DNBSEQ- (略) ，并能同步开展多组学项目。

2.技术要求：

1) DNA质量合格，总量满足要求。建议起始量：0.2μg；最低起始量：0.1μg；

2) 主带清晰。如DNA降解严重但是降解片段集中于1000bp以上（包括本数），经采购人同意可进行风险建库

3) 浓度：> 30 ng/μL

3.数据产出质量和数量要求：

1) 所有样本平均产出≥最终规格

2）数据质量Q20>90%，Q30>85％

3) N50≥1000

4.检测周期：

收到样品后不超过25个自然日

5.结果交付：

1）分析结果包含

1.1 数据质控统计表

1.2 有效数据统计

1.3 Alpha多样性分析，Beta多样性分析，物种注释与优势菌展示，物种差异分析

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宏基因组建库测序

根据样品进行DNA提取，进行转录组测序和生物信息学分析，Q30 ≥80%。测序数据量（Clean data）：10G，分析内容：样本间基因表达水平的相关性分析、基因差异表达分析、差异表达基因的GO及KEGG富集分析、差异表达基因的蛋 (略) 络分析、差异表达基因中的转录因子鉴定等。包括个性化分析。

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非靶向蛋白组（含高丰度蛋白检测）

针对样本进行相对定量（常规+全扫描），常规非靶向定量分析使用液质联用（LC-MS/MS)技术，基于鸟枪法（shotgun）的数据采集方式。全扫描定量分析采用DIA（data-independent acquisition）技术(包括预实验评估和自建库)。质谱性能要求如下：仪器参数：全扫描MS：100fg 上柱量利血平的S/N为150：1、SIM：50 fg 上柱量利血平的S/N为150：1，分辨率为240,000 @ m/z 200，扫描速度为40 Hz； (略) （常规）：用软件Mascot2.2和Proteome Discoverer1.4进行查库鉴定及定量分析； (略) （全扫描）：Proteome Discoverer 2.2进行搜库，数据处理采用Spectronaut TM Pulsar；拥有质谱仪，具备自主蛋白提取，质谱测序等实验条件。

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宏基因组建库测序

根据样品进行DNA提取，进行宏基因组测序和生物信息学分析，Q30 ≥80%。测序数据量（Clean data）：10G，分析内容：样本间基因表达水平的相关性分析、基因差异表达分析、差异表达基因的GO及KEGG富集分析、差异表达基因的蛋 (略) 络分析、差异表达基因中的转录因子鉴定等。包括个性化分析。