闽江学院2个水产物种denovo测序及各组学测序分析采购项目
闽江学院2个水产物种denovo测序及各组学测序分析采购项目
福州市政府采购合同
编制说明
1、签订合同应遵守《中华人民共和国政府采购法》、《中华人民共和国民法典》。
2、签订合同时,采购人与中标人应结合招标文件第五章规定填列相应内容。招标文件第五章已有规定的,双方均不得对规定进行变更或调整;招标文件第五章未作规定的,双方可通过友好协商进行约定。
甲方:闽江学院
乙方:北京诺禾致源科技股份有限公司
根据招标编号为[350100]FJZS[GK]*******的闽江学院2个水产物种denovo测序及各组学测序分析采购项目项目(以下简称:“本项目”)的招标结果,乙方为中标人。现经甲乙双方友好协商,就以下事项达成一致并签订本合同:
1、下列合同文件是构成本合同不可分割的部分:
1.1合同条款;
1.2招标文件、乙方的投标文件;
1.3其他文件或材料:□无。□(若有联合协议或分包意向协议)无。
2、合同标的
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品目号 | 品目编号及品目名称 | 采购标的 | 服务范围 | 服务要求 | 服务时间 | 服务标准 | 金额 (元) |
1-1 | C0901 技术测试和分析服务 | 2个水产物种denovo测序及各组学测序分析 | 1. 完成2个水产动物全基因组Denovo测序分析,获得高质量的基因组图谱。2. 完成100个样本的转录组测序工作。3. 完成50个样本宏基因组测序工作。 | 满足采购人技术及服务要求 | 1 | 满足采购人技术及服务要求 | 408000 |
3、合同总金额
3.1合同总金额为人民币大写:肆拾万零捌仟元整(¥408000.0000)。
4、合同标的交付时间、地点和条件
4.1交付时间:2个水产物种Denovo工作90日内完成,转录组和宏基因组工作30日内完成;
4.2交付地点:福建省福州市闽侯县上街镇溪源宫路200号;
4.3交付条件: 满足采购人技术及服务要求 。
5、合同标的应符合招标文件、乙方投标文件的规定或约定,具体如下:
5.1 完成2个水产动物全基因组Denovo测序分析,获得高质量的基因组图谱。 5.2. 完成100个样本的转录组测序工作。 5.3 完成50个样本宏基因组测序工作。
6、验收
6.1验收应按照招标文件、乙方投标文件的规定或约定进行,具体如下:
6.1.1 验收2个水产动物基因组Denovo测序分析结题报告; 6.1.2 验收100个样本的转录组测序结题报告; 6.1.3 验收50个样本宏基因组测序结题报告;。
6.2本项目是否邀请其他投标人参与验收:
不邀请。
7、合同款项的支付应按照招标文件的规定进行,具体如下:
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支付期次 | 支付比例(%) | 支付期次说明 | 预期支付时间 (用于采购贷申贷,为空无法进行申贷) |
1 | 100 | 按合同要求验收合格后,采购人无息支付中标人合同总价款的100%。中标人须在申请付款时出具全额发票。 |
8、履约保证金
有,具体如下:履约保证金百分比:5%。说明:(1)中标供应商与采购人签订合同时,中标供应商须以支票、汇票、本票或者金融机构、担保机构出具的保函等非现金形式向采购人一次性缴纳中标金额5%的履约保证金。 (2)履约保证金用于补偿采购人因中标供应商不能完成其义务而造成的损失。(3)采购人应于项目履约完成后5个工作日内退还履约保证金。(4)履约保证金缴交汇款账户:闽江学院 工行福州大学城支行 140*****296********。
9、合同有效期
自合同签订后2年内。。
10、违约责任
10.1 甲方违约责任: 10.1.1测序与分析工作启动前,如甲方提出终止合同,甲方须在提出终止合同当天向乙方支付合同金额的1‰作为违约金。测序与分析工作启动后,如甲方提出终止合同,则甲方需支付乙方服务已产生的相关费用,乙方有权从甲方已付款项中扣除相关费用,且甲方须在提出终止合同当天向乙方支付合同金额的1‰作为违约金。 10.1.2测序与分析工作启动后,因甲方提供的样本不符合乙方要求(包括但不限于样本制备不符合本合同要求、达不到后续实验要求、样本污染、样本损坏等)导致合同终止时,甲方需支付乙方服务已产生的相关费用,乙方有权从甲方已付款项中扣除相关费用。 10.2 乙方违约责任: 10.2.1如因乙方过错导致项目迟延时,乙方应及时与甲方沟通,协商延期方式和赔偿方式。 10.2.2测序与分析工作启动后,若样本质检合格,实验意外失败(未达到本合同2.2约定的数据量及质量要求),乙方可以为甲方继续进行重复试验,不另计技术服务费用,直到达到本合同2.2约定的数据量及质量要求;若甲方不能继续提供样本,则甲方可以将已付款项转入下一次服务。乙方不承担由此导致的其他责任。 10.2.3除本合同另有约定,如因乙方过错导致其未按照合同约定交付成果时,乙方应向甲方支付合同金额的1‰作为违约金。 。
11、知识产权
11.1乙方提供的采购标的应符合国家知识产权法律、法规的规定且非假冒伪劣品;乙方还应保证甲方不受到第三方关于侵犯知识产权及专利权、商标权或工业设计权等知识产权方面的指控,任何第三方如果提出此方面指控均与甲方无关,乙方应与第三方交涉,并承担可能发生的一切法律责任、费用和后果;若甲方因此而遭致损失,则乙方应赔偿该损失。
11.2若乙方提供的采购标的不符合国家知识产权法律、法规的规定或被有关主管机关认定为假冒伪劣品,则乙方中标资格将被取消;甲方还将按照有关法律、法规和规章的规定进行处理,具体如下:无。
12、解决争议的方法
12.1甲、乙双方协商解决。
12.2若协商解决不成,则通过下列途径之一解决:
13、不可抗力
13.1因不可抗力造成违约的,遭受不可抗力一方应及时向对方通报不能履行或不能完全履行的理由,并在随后取得有关主管机关证明后的15日内向另一方提供不可抗力发生及持续期间的充分证据。基于以上行为,允许遭受不可抗力一方延期履行、部分履行或不履行合同,并根据情况可部分或全部免于承担违约责任。
13.2本合同中的不可抗力指不能预见、不能避免、不能克服的客观情况,包括但不限于:自然灾害如地震、台风、洪水、火灾及政府行为、法律规定或其适用的变化或其他任何无法预见、避免或控制的事件。
14、合同条款
14.1.Denovo技术要求 14.1.1 二代测序 对2个基因组物种,分别构建350bp文库,双端二代测序,整体测序深度不低于100X,每个物种测序数据量不低于150G,Q30在85%以上。 14.1.2 三代测序 对2个基因组物种,通过PacBio构建大片段文库,测序深度不低于100X,每个物种测序数据量不低于150G,要求原始数据RQ值高于0.75。 14.1.3 光学图谱 对2个基因组物种,构建BioNano光学图谱,测序深度不低于100X,每个物种测序数据量不低于150G,利用光学图谱进行辅助组装。 14.1.4 Hi-C: 根据要求选择四碱基或者六碱基酶构建HI-C文库,测序深度各不低于100X,每个物种测序数据量不低于150G,Q30在85%以上,将测序完的数据进行过滤,ValidRate在70%以上,然后与草图基因组比对、并进行聚类、排序和定向,锚定至染色体。 14.1.5 Denovo生物信息分析 14.1.5.1基因组survey分析:包括数据质控,k-mer分析,survey基因组组装,预估基因组大小,GC含量,杂合率和重复序列。 14.1.5.2基因组组装:包括测序数据质控,contig组装,Scaffold组装,gap填充。 14.1.5.3基因组组装评估:包括序列一致性评估:GC-depth分布分析、GC含量分析、测序深度分析、基因区覆盖度评估、基因组SNP统计。序列完整性评估:至少要进行RNA序列评估、CEGMA评估、BUSCO评估。 14.1.5.4基因组注释:重复序列注释,基因结构注释,基因功能注释,非编码RNA注释。 14.1.5.5基因组分析:基因家族聚类分析,系统进化分析,物种分歧时间估算,基因家族扩增和收缩分析,正选择分析,全基因组复制分析,基因共线性分析。 14.2.转录组技术要求 提取100个组织样本RNA核酸,进行链特异转录组文库构建,每个样本8G数据,并开展有参转录组所有分析内容以及与denovo需要的相关所有注释工作及分析。 14.3.宏基因组技术要求 提取50个环境样本DNA,进行宏基因组文库构建,每个样本20G数据,开展宏基因组所有分析。
15、其他约定
15.1合同文件与本合同具有同等法律效力。
15.2本合同未尽事宜,双方可另行补充。
15.3本合同自签订之日起生效。
15.4本合同纸质文件一式 陆 份。合同电子文本通过政府采购网上公开信息系统自动备案。合同纸质文本需与备案电子文本一致,以备案电子文本为准,具有同等效力。
15.5其他:□无。□ 无。
甲方: | 闽江学院 | 乙方: | 北京诺禾致源科技股份有限公司 |
住所: | 福州市闽侯县上街镇溪源宫路200号 | 住所: | 北京市朝阳区酒仙桥北路甲10号院301号楼101 |
单位负责人: | 单位负责人: | 李瑞强 | |
委托代理人: | 委托代理人: | 吴晓勇 | |
联系方法: | ****-******** | 联系方法: | 173*****993 |
开户银行: | 工行福州大学城支行 | 开户银行: | 北京银行西三旗支行 |
账号: | 140*****296******** | 账号: | *********************** |
签订地点: 福州
签订日期:2021年02月09日
招标
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