依据医院《项目采购管理办法》相关规定，拟在近期对广西壮族自治区妇幼保健院临床微生物分离株全基因组分子分型及溯源分析检测项目项目进行院内谈判，相关单位如需参加，请见本公告后，填写附件一“产品报名信息表”报名，逾期不受理。具体要求，请查看附件二“采购文件”。
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项目名称

技术参数

临床微生物分离株全基因组分子分型及溯源分析(约50例）

1.1二代高通量并行测序 平台：Illumina 备注：每个样本基因组测序数据量大于等于1 Gbases（测序深度大于100×） 1.2适配二代高通量并行测序的DNA文库构建 备注：需要抽提纯化完毕的合格DNA样本(每个样本DNA总量>1μg) 1.3基于Illumina平台WGS测序数据的微生物（细菌/古菌）基因组Draft拼装 备注：每个样本Reads 碱基少于1.5Gb 1.4微生物（细菌/古菌）菌种鉴定 备注：基于GenBank微生物基因组数据库及平均核苷酸一致性（ANI）技术鉴定已知物种 1.5基于全基因组数据，统计菌株间的SNPs 1.6基于WGS测序数据的微生物同源性分析 本项目相关菌株基因组遗传进化关系分析 结合相关菌株的流行病学数据和遗传数据尝试重构病原传播途径 1.7基于微生物基因组序列数据的MLST分型使用pubmlst.org公布的schema支持新等位基因型识别得到基因分型（ST） 对于pubmlst.org中没有分型方案的物种，基于受测菌株及所属物种模式菌株基因组数据，设计MLST分型方案。将设计的MLST方案与基于核心基因组的MLST分析进行比较，判断所设计MLST分型方案的合理性。

联系人：邓雨霞
联系电话：0771-*******
办公室地点：广西南宁市厢竹大道59号广西壮族自治区妇幼保健院医技综合楼5楼采购办公室。
报名截止日期：2021年7月2日下午5：30

附件：
1.产品报名信息表.xlsx
2.采购文件.docx