生命科学学院等1项
生命科学学院等1项
为便于供应商及时了解政府采购信息，根据《财政部关于开展政府采购意向公开工作的通知》（财库〔2020〕10号）等有关规定，现将生命科学学院等1项政府采购意向公开如下：
| 序号 | 意向编号 | 采购项目名称 | 采购需求概况 | 预算金额(万元) | 预计采购日期 | 备注 |
| 1 | CGYX********0 | 生命科学学院 | 完成1个鸟类动物全基因组Denovo测序分析：构建350bp文库，利用Illumina进行双端二代测序，测序深度不低于100X，测序数据量不低于200G，Q30在85%以上。构建20k大片段文库，通过PacBioSequel IIe进行CCS模式测序，hifi数据测序深度不低于30X，测序数据量不低于60G数据。构建BioNano光学图谱，测序深度不低于100X，测序数据量不低于200G，利用光学图谱进行辅助组装。选择四碱基或者六碱基酶构建Hi-C文库，测序深度不低于100X，测序数据量不低于200G，Q30在85%以上，将测序完的数据进行过滤，ValidRate在70%以上，然后与草图基因组比对、并进行聚类、排序和定向，锚定至染色体。基因组组装：要求达到如下指标：连续片段Contig N50长度大于1 Mb；Scaffold N50长度达到20 Mb以上；基因组覆盖率大于95%，基因区覆盖率大于98%，组装的基因组序列单碱基错误率小于0.01%。RNA-seq用于基因组辅助注释：60例样本，构建RNA文库，采用Illumina平台进行PE150测序，部分样本用于辅助基因组注释，数据量不低于6G/样本；数据质量Q30在85%以上。群体重测序及分析：100例群体样本，构建小片段文库，个体测序深度10X，即单个个体数据量不小于20G，并进行群体分析，以及全基因组关联分析。全基因组甲基化测序分析：共21例样本，构建WGBS文库，测序深度30X，即单个个体数据量不小于60G，并进行甲基化分析，及后续的个性化分析。生物信息分析：基因组数据质控，k-mer分析，survey基因组组装，预估基因组大小，GC含量，杂合率和重复序列，基因组组装评估，注释（重复序列、基因结构、基因功能、非编码RNA注释），基因家族聚类分析，系统进化分析，物种分歧时间估算，基因家族扩增和收缩分析，正选择分析，基因共线性分析，转录组分析，全基因组关联分析，全基因组甲基化测序分析。 | 35 | 2021年10月 | 中标方应全力配合甲方开展个性化分析工作，及数据深入挖掘工作，上门解答客户相关问题。并负责方法，附录，及文章所需的图表及图表解释工作，文章框架需由双方共同搭建，双方共同完成个性化分析、文章撰写、投稿、及审稿修改等工作至文章发表。数据保存3个月，中标公司需提供移动硬盘用于数据传输。在项目完成后5年之内，如果项目结果存在疑义或者不完善的（例如数据分析存在差错、数据量不够），项目委托方对中标公司保留追究责任的权利，并与中标公司协商解决。该项目中的数据及分析结果全部归本单位所有；中标公司需对项目中涉及的实验材料和资料负有保密责任，未经对方允许，不得向第三方转让和泄露本项目的实验材料和资料。投标人拥有智能化交付系统，并搭载自动化样本库，以确保项目能高效准确智能化的开展，需提供公共网站对智能化交付系统及自动化样本库的宣传网址、内容介绍及宣传片截图，并加盖单位公章。 |
本次公开的采购意向是本单位政府采购工作的初步安排，具体采购项目情况以相关采购公告和采购文件为准。
郑州大学招投标办公室
2021年09月09日
标签: 生命科学学院
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