教学软件（NJUT2014-RJZB002）招标邀请书


南京工业大学软件招标邀请书

一、招标项目编号： NJUT2014-RJZB002

二、招标项目： 南京工业大学教学科研软件

三、招标内容

（一）软件名称、数量

分子模拟、蛋白结构分析技术平台 1套

（二）技术指标要求

1、可以跨平台支持 Windows、Linux、Mac等主流平台与操作系统。提供可视化客户端，以及3D 显示功能模块，用户可以通过普通显示器或投影仪观察三维立体效果的分子结构和相互作用。

2、分子建模和模拟：支持小分子化合物和生物大分子(核酸、蛋白、多糖、多聚物)建模、分子力学及分子动力学模拟；支持4种以上算法的小分子构象搜索；支持半经验量化计算，并提供到量化计算软件的接口。

3、化学信息学与QSAR：能计算不少于600种化学分子描述符；能够使用“Lipinski Rule of 5”等方法进行类药化合物筛选；支持基于贝叶斯模型二元QSAR建模，以及基于比较力场分析的3D QSAR建模；支持基于描述符、属性值和指纹图谱的分子聚类和多样性分析。

4、提供蛋白质工程应用，包括丙氨酸扫描、二硫键扫描、耐药性突变、定点突变等功能可以预测突变后蛋白结构、蛋白活性、稳定性的变化。以及蛋白质沉聚分析、翻译后修饰位点预测、蛋白结构域相似性搜索。

5、支持蛋白同源建模，特别是复杂蛋白的模建如GPCR/Kinase/Antibody的同源建模以及模建后的模型评价。通过蛋白结构分析，计算蛋白的相关重要属性如等电点、Zeta 电位等信息。

6、可以提供2D“蛋白-配体”的相互作用分析模式图。

7、基于结构的药物设计：能够预测靶点潜在活性位点；能够绘制靶点活性位点的表面及预测口袋内静电密度分布；能够根据活性位点几何和物理化学性质进行药效团建模并进行筛选；支持进行分子对接，并另外提供不少两种主流对接程序接口，以便进行综合评分。

8、基于片段的药物设计：能够在活性位点进行片段对接；能够基于实验或模拟“片段-蛋白”复合物结构，通过骨架跃迁、等电排体转换、片段交换算法等功能进行全新药物设计；

9、支持多种模型（指纹图谱、描述符、QSAR、药效团等）的高通量筛选，可以用于药物分子的虚拟筛选与发现。

10、药效团建模：支持基于配体分子叠合结果的保守药效团分析、基于“配体-蛋白”复合物和基于受体的药效团建模；支持“配体-蛋白”复合物相互作用指纹图谱分析，可以从一批复合物中分析总结得到参与重要相互作用的残基和配体分子特性——即药效团模型。支持强/弱相互作用的确定，注释非标准相互作用（卤键和CH键供体），并且使用相互作用能量对药效团筛选结果进行打分。

11、技术支持要求：

软件使用期限为4年，软件购买安装到位后不少于2次技术培训，在软件服务期内提供不少于每年一次的软件维护，若使用期内软件技术升级，不得收取任何费用。

（三）交货地点：江浦校区生物与制药工程学院指定地点。

（四）付款方式：货到安装完成，用户验收合格后付清全款。

（五）报价方式：本项目所有产品采用总承包方式，包括所投产品、安装调试、服务、运输、税金及其它有关的为完成本项目发生的所有费用，招标文件中另有规定的除外，国产软件以人民币报价，进口软件以美元报价。

四、投标须知

（一）投标人必须是经国家有关部门批准，具有合法经营资质、符合《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定的独立法人。

（二）投标人资格证明材料

1、有效的工商营业执照副本、税务登记证、企业组织机构代码证的复印件；

2、软件企业认定证书、计算机软件著作权登记证书、软件产品登记证书（复印件）；

3、法定代表人的身份证（复印件）；

4、委托代理人的身份证（复印件）；

5、企业法人代表签名并加盖法人公章的委托书原件；

6、企业基本情况（经营规模、经营状况及行业优势）简介。

（三）投标文件的内容构成

1、投标文件目录；

2、投标函；

3、投标人所有资格证明材料；

4、投标报价：投标人应根据招标文件要求及附件中的项目需求，按功能模块进行分项报价（见附件1《配置及分项报价表》）；

5、投标人按照招标文件要求提供交货安装、工期保证等实施方案以及产品售后服务和质量承诺；

6、投标人参照招标邀请书的技术要求对所投项目的功能和技术响应进行准确描述，并附功能及技术要求偏离表（见附件2《技术参数响应及偏离表》）；

7、投标人近年来类似项目业绩情况（详细说明使用单位、联系人、电话）；

8、投标人认为有必要提供的声明及文件材料；

9、投标人的开户名称、开户银行、账号、电话、传真、网站、E-mail联系方式。

（四）投标人必须仔细阅读招标邀请书的所有内容，按照招标书的要求提供投标文件，并保证所提供的全部资料的真实性，以使其投标对投标文件做出实质性的响应，否则其投标将被拒绝。

（五）投标文件的封装：投标人须按照投标文件组成的要求制作标书，投标文件包括正本1份，副本2份，并标明“正本”或“副本”字样，如正本与副本不符，以正本为准。投标文件须装袋密封，封口加盖法人和法人代表公章。外包装上要注明：招标单位名称、招标项目名称、招标项目编号、投标单位名称（盖公章），未按本要求投递的投标文件，招标方有权拒绝。

（六）评标：本次招标由南京工业大学招投标工作小组负责评标，评标依据为招标书和投标书，按标段（分包）进行评审。评标原则为满足招标文件及其附件的实质性要求的合理低价中标。

（七）招标人根据评标小组的评标结果发布预成交公告，无异议，三日后向投标人发出中标通知书，投标人要按照中标通知书中规定的时间、地点与买方签订合同。

（八）中标单位须开具增值税专用发票（美元报价设备除外）。

（九）中标单位在中标后按中标金额的0.8%缴纳招标工本费及专家评审费。

（十）招（投）标文件与供销合同以及补充文件具有同等法律效力。

五、投标文件递交时间和地点

（一）截止时间： 2014年3月13日下午15:30前，逾期招标方将拒绝接收。

（二）地点：南京市浦口区浦珠南路30号，南京工业大学江浦校区行政楼三楼320室。

六、开标时间和地点

（一）时间：2014年3月14日上午9：00

（二）地点：南京市浦口区浦珠南路30号，南京工业大学江浦校区行政楼三楼324室。

七、招标人信息

招标人名称：南京工业大学招投标服务中心

招标人地址：南京市浦口区浦珠南路30号，南京工业大学江浦校区行政楼三楼。

联系人：王洪洲 联系电话：***-********

邮编：211816 邮箱：ztbzhk@njtech.edu.cn