150个植物样本全基因组重测序项目（BX20210022）采购公告
150个植物样本全基因组重测序项目（BX20210022）采购公告
| 项目名称 | 150个植物样本全基因组重测序项目 | 项目编号 | BX******** |
|---|---|---|---|
| 公告开始日期 | 163*****46000 | 公告截止日期 | 163*****00000 |
| 采购单位 | 西北农林科技大学 | 付款方式 | 1.所有货物验收合格后在10个工作日内付给乙方全额货款。乙方在合同签订前缴纳中标金额的5%作为履约保证金，验收合格后满一年退还。 |
| 联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 中标后在我参与的项目中查看 |
| 签约时间要求 | 成交后10个工作日内 | 到货时间要求 | 无 |
| 预 算 | 217500.0 | ||
| 收货地址 | 无 | ||
| 供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 | ||
| 采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
|---|---|---|---|
| 植物样本全基因组重测序项目 | 150 | 项 | 无 |
| 品牌 | 无 |
|---|---|
| 型号 | 无 |
| 品牌2 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 品牌3 | 无 |
| 型号 | 无 |
| 预算 | 1450.0 |
| 技术参数及配置要求 | 利用Illumina测序平台，开展150例植物样本的全基因组重测序，鉴定基因组范围的变异位点，构建全基因组遗传变异（SNP）图谱，开展生长、抗逆、抗病等性状关联分析。1.DNA提取：根据样品特点优化DNA提取流程，对提取的DNA进行琼脂糖、Nanodrop和Qubit质检。2.建库测序：检验合格的DNA样品通过Covaris破碎机随机打断成长度为350bp的片段，采用NEB 建库试剂盒进行建库，构建好的文库通过Illumina进行测序。单个样品在去除低质量reads后全基因组测序深度不低于30×，且回帖后平均覆盖度不低于30×；单个样品数据量30G，数据偏差小于2%；双端测序读长不小于150 bp×2，测序质量 Q20≥93%，Q30≥90%.3.数据质控：去除带接头、N的比例大于10%、低质量的reads后，得到clean reads，用于后续分析。4.数据分析：用BWA软件比对参考基因组，比对结果经Picard去除重复，进行SNP检测与注释；进行群体分层分析和连锁不平衡分析后，采用GWAS将目标性状表型的多样性与基因（或标记位点）的多态性结合起来进行分析，鉴定出与表型变异密切相关且具有特定功能的基因位点或标记位点，用于定位性状关联区间、功能基因研究、开发性状选育标记等方面的研究。5.整个项目周期不超过40个自然日。 |
| 售后服务 | 1.要求销售人员上门取样；2.DNA质检后及时反馈样品质量；3.测序完成后及时反馈数据质量；4.用硬盘交付数据；5.根据样品实际情况修改分析内容。; |
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