上海交通大学高通量基因组测序仪国际招标公告(2)
上海交通大学高通量基因组测序仪国际招标公告(2)
上海机电设备招标有限公司受招标人委托对下列产品及服务进行国际公开竞争性招标,于2014-05-12在公告。本次招标采用传统招标方式,现邀请合格投标人参加投标。
1、招标条件
项目概况:拟采购高通量基因组测序仪
资金到位或资金来源落实情况:已落实
项目已具备招标条件的说明:已具备
2、招标内容
招标项目编号:****-********1223
招标项目名称:上海交通大学高通量基因组测序仪
项目实施地点:中国上海市闵行区
招标产品列表(主要设备):
序号 | 产品名称 | 数量 | 简要技术规格 | 备注 |
1 | 高通量基因组测序仪 | 1 | 一、设备用途1、未知物种全基因组从头测序2、已测序物种的基因组重新测序3、特定目标区域深度测序*4、宏基因组测序(全长16S rRNA测序、宏基因组从头测序)*5、无需拼接的mRNA可变剪切表达测序6、小RNA(miRNA)测序7、染色质免疫共沉淀测序(chip-seq)*8、SNP分型和单倍体分型研究(精度比肩Sanger)*9、全基因组甲基化分析10、CNV的异常检测11、多重PCR扩增片段测序*12、磷酸化修饰、硫修饰、DNA损伤、未知修饰等表观遗传学研究13、蛋白-DNA相互作用研究*14、染色体重排研究(缺失,插入,转位等染色体结构变异)二、工作条件1、电源要求:AC 380V或220V,50Hz, 电源插头符合中国制式,或提供转接插座2、工作温度:15~25℃3、相对湿度:20-80%4、工作条件及安全性要求符合中国及国际有关标准或规定。三、主要配置1、 高通量基因组测序主机a)衍射光学元件b) 光路校准系统c) 光学检测系统d) 空气控制系统e) 温度控制系统f) 湿度控制系统g) 自动移液处理系统h) 一级数据分析服务器 2、数据分析软件包,包括原始数据分析获得序列信息,序列信息解读和注释等软件3、仪器配套试剂包(10runs以上),试剂包可完成基因组DNA测序文库构建、单分子扩增和上机测序4、高通量测序仪外围设备:核酸定量仪四、产品技术规格1、高通量基因组测序主机*1)序列平均读长:5500-8500bp,其中5%读长超过11-18Kb,最长读长超过24-30Kb.*2)数据准确度:>99.999% @ 25-30X 一致性。*3)测序通量:Raw Data 500-800Mb/测序芯片,Filtered Data 250-350Mb/测序芯片.*4)可精确读取≥100bp连续的单个重复碱基.*5)可精确读取≥600bp 100%GC含量区域。*6)可获得DNA聚合酶反应时的动力学信息,直接检测碱基修饰(如4mC,6mA,5mC,5hmC,硫修饰,DNA损伤,未知修饰等)。*7)数据通量灵活性:高度灵活的测序平台,1-16测序芯片/Run。8)数据通量读长扩展性:无需更改仪器硬件,无需额外辅助设备和软件升级,使用与系统匹配的后续高通量测序芯片及配套试剂,即可完成测序数据通量和读长的后续扩展提升。*9)通量/天:3-6G。10)上样量:初始样品量≤10微克。11)上样样品数:单次测序反应可同时检测至少8个独立样品。*12)样品制备:从样品制备到获得序列信息,整个过程最快可在1天内完成,单个测序芯片的测序时间为120-180min。13)测序成本:测序试剂成本低于1美金/Mb。14)测试初步分析结果可以用碱基形式显示,方便数据的比对和分析。15) 输出数据格式和数据兼容性:数据格式和其他二代测序仪兼容。16)系统自配一级服务器,可完成序列读取和比对。17)该仪器国内装机用户≥5个。18)用该仪器发表的SCI文章≥50篇。 19)仪器配备UPS(停电保护):满足断电后仪器正常关机,以便通电后正常运行。20)必需的附件、配件及专用工具等并提供详细清单。21)中标供应商提供详细的仪器操作使用手册;中标供应商提供仪器维护的有关资料;中标供应商提供有关专用附件、备件、专用工具、消耗器件或其他补充器件的详细资料。2、数据分析软件包,包括原始数据分析获得序列信息,序列信息解读和注释等软件1)配置从原始数据获得基因序列所需软件,免费安装并且免费上门基础培训。2) 配置软件套餐,SMRT Pipe,SMRT Portal,SMRT View 等数据分析软件及流程管理软件,可以用于Targeted Sequencing,De Novo Assembly,Base Modification Detection。免费安装并且免费上门基础培训。3、仪器配套试剂包(10runs以上),试剂包可完成基因组DNA测序文库构建、单分子扩增和上机测序4、高通量测序仪前处理所需外围设备:Nanodrop ND-2000型紫外/可见分光光度计1台 |
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