项目编号

S2022

需求部门

精准医学中心

项目明细及参数要求

外周血游离DNA染色体不稳定性检测服务

单一来源采购理由：

需与我院Illumina平台设备配套进行检测。

参数要求：

1.检测内容：测定样本血液中全基因组水平的染色体不稳定性（CIN）和肿瘤相关及靶向药物关联的基因拷贝数变异（CNV），包括：拷贝数增加（CNG）和拷贝数缺失（CNR）

2.检测方法：利用外周血分离血浆，基于二代基因测序分析和数据分析流程分析样本全基因组水平的染色体不稳定性及游离DNA中携带的基因拷贝数变异

3.样本类型：外周血-10ml

4.方法学：二代测序（NGS）

5.检测周期： 10自然日

6.产品性能：

a．覆盖度：全基因组

b．测序深度：3-5X

c．CNV检出限：

报告拷贝数增加（CNG）事件的基因拷贝阈值≤2.3拷贝

报告拷贝数缺失（CNR）事件的基因拷贝阈值≥1.7拷贝

d．可以确定CNR的杂合型及纯合型

PAX1基因甲基化检测服务

单一来源采购理由：

需与我院Bio-rad S1000的PCR仪器设备配套进行检测。

需求参数：

1.测定方法：实时荧光定量 PCR

2.检测极限：可检测出 500ngDNA 背景下,含量低至 2%的基因甲基化状态

3.DNA 浓度：>4ng/ul

4.分析系统：双水解探针分析系统

5.检测再现性：≥98.3%

6.内部控制组：第二型胶原蛋白（Col2A）基因

7.检测特异性：≥98%

8.引子序列

（注：M 代表可专一辨认甲 基化基因序列的 MSP 引 子；U 代表可专一辨认非甲 基化基因序列的 MSP 引 子）： M：正股 5′ TATTTTGGGTTTGGGGTCGC 3′

反股 5′ CCCGAAAACCGAAAACCG 3′

U: 正股 5′ GTTTATTTTGGGTTTGGGGTTGTG 3′ 反股 5′ CACCCAAAAACCAAAAACCAC 3′

9.知识产权：PAX1甲基化检测方法取得国家发明专利及获得发明专利授权:专利号及授权公告号

10.主要检测位点：定量测定人类特定基因PAX1基因（Pairedboxgene1）启动子区域CPG岛上cg********、cg********、cg********、cg********、cg********、cg********与cg********等基因位点甲基化程度进行侦测

采购方式

单一来源采购

资格要求

资证材料及入围条件

报名截止时间

2022年 8月 30日

报名方式及要求

网上报名：通过邮件提交营业执照、组织机构代码证、税务登记证或“三证合一”的营业执照
报名邮箱：**********@qq.com
邮件主题：“报名服务项目名称-服务商全称-负责人姓名电话”

书面资料提交方式

现场提交

时间、地点

另行电话或邮件通知

联系方式

电话：023-******** 邮编：******