关于创新港台式高通量测序仪用耗材及试剂项目院级磋商公告
关于创新港台式高通量测序仪用耗材及试剂项目院级磋商公告
我院拟对下列项目组织院级磋商 ，欢迎具有合格资质的供应商参与，具体要求及说明如下。
一．项目内容：
项目编号及名称：2022YH67创新港台式高通量测序仪用耗材及试剂
项目基本概况：MEDX研究院-数字医学研究所购置的高端台式高通量测序仪用相关试剂及耗材（见目录）
二、资格要求：(以下内容资料发送至报名邮箱)
①供应商有效的营业执照（复印件盖公章）
②供应商法定代表人（或其他组织等负责人）对本项目授权书（复印件盖公章）
③制造厂商产品授权书（符合2票制），授权时间为3年（授权以公告后至开标月份为起始时间或年度授权）（复印件盖公章、原件限代理商投标时提供）
④填写报名磋商信息表（Word/Excel可复制版见附表 ）
三、报名时间及获取文件：
2022年11月26日至2022年11月30日（3个工作日）
报名截止后磋商文件发送至供应商提供的电子邮箱.
四、磋商时间：
2022年12月15日上午9点（响应文件递交截止时间），（请及时关注报名预留邮箱，并保持电话通畅）
五、磋商地点：西安市小寨西路196号(西安交通大学第一附属医院行政院区招采办会议室）
六． 联系科室及电话：
1．联系科室：招标采供第4办公室
2．联系人：徐老师
3．联系电话：029--********
4．报名邮箱：*********@qq.com
5.联系地址：西安市小寨西路196号
招标采供办公室
2022年11月25日
附表：报名信息一览表格式
序号 | 标段 | 采购产品名称 | 注册证名称及注册证号 | 供应商名称 | 制造商名称 | 联系人 | 联系电话 | QQ邮箱 |
1 | ||||||||
2 |
1.开放试剂
序号 | 用途 | 品名 | 规格 | 单位 | 备注 |
1 | 清洗试剂 | Tween-20 | 瓶 | ||
2 | 核酸提取试剂 | DNA提取试剂盒 | 根据不同样本类型选用不同提取试剂盒 | 盒 | |
3 | 核酸提取试剂 | RNA病毒提取试剂盒 | RNA病毒提取 | 盒 | |
4 | 核酸提取试剂 | Quick-DNA/RNA Viral Kit | DNA/RNA病毒提取试剂盒 | 盒 | |
5 | 核酸提取试剂 | 细菌性呼吸系统感染检测前处理试剂盒 | 前处理及提取试剂盒 | 盒 | |
6 | 核酸提取试剂 | DNeasy? Blood&Tissue Kit | 50rxn | 盒 | |
7 | 文库构建辅助试剂 | AVENIO Edge HyperPlus with UMI | 一份试剂可匹配24人份样本 | 盒 | |
8 | 文库构建辅助试剂 | Agilent High Sensitivity DNA Kit | 盒 | ||
9 | 文库构建辅助试剂 | Agilent DNA 1000 Kit | 盒 | ||
10 | 文库构建辅助试剂 | D1000 ScreenTape | 112rxn | 盒 | |
11 | 文库构建辅助试剂 | D1000 Reagents | 112rxn | 盒 | |
12 | 文库构建辅助试剂 | 100% xylene, ACS grade or higher quality(二甲苯) | 核酸提取FFPE样本前处理 | 瓶 | |
13 | 文库构建辅助试剂 | Qubit 1X dsDNA HS Assay Kit | 瓶 | ||
14 | 文库构建辅助试剂 | AMPure XP磁珠 | 瓶 | ||
15 | 文库构建辅助试剂 | AR无水乙醇 | 瓶 | ||
16 | 文库构建辅助试剂 | Nuclease-Free Water (not DEPC-Treated) | 瓶 | ||
17 | 文库构建辅助试剂 | NEB Blunt/TA Ligase Master Mix | 采用标准连接法SQK-LSK110进行EXP-NBD单反应多个文库构建的辅助试剂 | 管 | |
18 | 文库构建辅助试剂 | NEBNext FFPE Repair Mix | 采用标准连接法SQK-LSK110进行文库构建的辅助试剂 | 管 | |
19 | 文库构建辅助试剂 | NEBNext End repair / dA-tailing Module | 采用标准连接法SQK-LSK110进行文库构建的辅助试剂 | 管 | |
20 | 文库构建辅助试剂 | 1 M TrisHCl, pH 8.0 | 瓶 | ||
21 | 文库构建辅助试剂 | 1M Tris-HCl pH7.0 | 瓶 | ||
22 | 文库构建辅助试剂 | 氢氧化钠溶液 BioUltra, for molecular biology, 10 M in H2O | |||
23 | 文库构建辅助试剂 | NEBNext Quick Ligation Module | 采用标准连接法SQK-LSK110进行文库构建的辅助试剂 | 管 | |
24 | 文库构建辅助试剂 | Qubit dsDNA HS kit | 核酸定量 | 盒 | |
25 | 文库构建辅助试剂 | VAHTS Library Quantification Kit for Illumina | 文库定量qPCR试剂 | 盒 | |
26 | 文库构建试剂 | LunaScript? SuperMix反转录试剂盒 | RNA逆转录 | 盒 | |
27 | 文库构建试剂 | Q5?热启动超保真2X预混液 | 扩增试剂 | 盒 | |
28 | 文库构建试剂 | SARS-COV-2引物 | 新冠病毒引物池，专门用于新冠溯源 | 盒 | |
29 | 文库构建试剂 | 呼吸2.0试剂盒（呼吸2.0接头） | 文库构建试剂 | 盒 | |
30 | 文库构建试剂 | 呼吸3.0扩增试剂盒 | 文库构建试剂 | 盒 | |
31 | 文库构建试剂 | AVENIO ctDNA Surveillance Kit | 适用于ctDNA的建库试剂盒 | 盒 | |
32 | 文库构建试剂 | AVENIO ctDNA Expanded Kit | 适用于ctDNA的建库试剂盒 | 盒 | |
33 | 文库构建试剂 | AVENIO FFPET Surveillance Kit（FFPE MRD） | 适用于FFPE的建库试剂盒 | 盒 | |
34 | 文库构建试剂 | AVENIO FFPET Expanded Kit（FFPE大PANEL） | 适用于FFPE的建库试剂盒 | 盒 | |
35 | 文库构建试剂 | truChIP? Chromatin Shearing Kit with Formaldehyde | DNA剪切仪配套试剂 | 盒 | |
36 | 文库构建试剂 | truChIP? FFPE Chromatin Shearing Kit | DNA剪切仪配套试剂 | 盒 | |
37 | 文库构建耗材 | Qubit Assay Tubes | Qubie配套耗材 | 包 | |
38 | 文库构建耗材 | 8micro TUBE Strip（12） | DNA剪切仪配套耗材 | 盒 | |
39 | 文库构建耗材 | microTUBE-130 AFA Fiber Screw-Cap | DNA剪切仪配套耗材 | 盒 | |
40 | 文库构建耗材 | 0.2 ml薄壁PCR离心管 | 盒 | ||
41 | 文库构建耗材 | 1.5 ml/2ml Eppendorf DNA LoBind离心管 | 包 | ||
42 | 文库构建耗材 | 1000μL、200μL、100μL、20μL、10μL带滤芯枪头 | 盒 |
封闭试剂
序号 | 用途 | 品名 | 规格型号 | 规格 | 单位 | 备注 | |
1 | 测序辅助试剂 | PhiX Control v3 | 上机内参 | illumina | |||
2 | 文库构建试剂 | TruSight Oncology 500 DNA High-Throughput (48 Samples) | 48人份 | 盒 | illumina | ||
3 | 文库构建试剂 | IDT? for Illumina? UMI DNA/RNA UD Indexes Set A, Ligation (96 Indexes, 96 Samples) | 96人份 | 盒 | illumina | ||
4 | 建库 | Illumina? DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment, (S) Tagmentation Set B (96个样本, 12-plex) | 96 | 盒 | illumina | ||
5 | 建库 | Illumina? DNA Prep with Exome 2.0 Plus Enrichment, (S) Tagmentation Set D (96个样本, 12-plex) | 96 | 盒 | illumina | ||
6 | 核酸提取 | Flex Lysis Reagent Kit (96次反应) | 96 | 盒 | illumina | ||
7 | 特异性接头 | IDT? for Illumina? DNA/RNA UD Indexes Set A,酶切法片段化（96个标签，96个样本） | 96 | 盒 | illumina | ||
8 | 特异性接头 | IDT? for Illumina? DNA/RNA UD Indexes Set C,酶切法片段化（96个标签，96个样本） | 96 | 盒 | illumina | ||
9 | 建库 | Illumina? DNA PCR-Free Prep, Tagmentation (96 Samples) | 96 | 盒 | illumina | ||
10 | 特异性接头 | IDT? for Illumina? DNA/RNA UD Indexes Set A, Tagmentation (96 Indexes, 96 Samples) | 96 | 盒 | illumina | ||
11 | 核酸提取 | Flex Lysis Reagent Kit (96次反应) | 96 | 盒 | illumina | ||
12 | 建库 | TruSight Oncology 500 DNA/RNA High-Throughput（大样本量方案）试剂盒（24样本） | 24 | 盒 | illumina | ||
13 | 建库 | TruSight Oncology 500 DNA/RNA High-Throughput（大样本量方案）试剂盒（72样本） | 72 | 盒 | illumina | ||
14 | 特异性接头 | IDT? for Illumina? UMI DNA/RNA UD Indexes Set A，Ligation（96标签，96样本） | 96 | 盒 | illumina | ||
15 | 特异性接头 | IDT? for Illumina? UMI DNA/RNA UD Indexes Set B，Ligation（96标签，96样本） | 96 | 盒 | illumina | ||
16 | 测序芯片 | NovaSeq 6000 SP Reagent Kit v1.5 | 具体数据量详见‘3.测序kit参数’ | 盒 | illumina | ||
17 | 测序芯片 | NovaSeq 6000 S1 Reagent Kit v1.5 | 具体数据量详见‘3.测序kit参数’ | 盒 | illumina | ||
18 | 测序芯片 | NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5 | 具体数据量详见‘3.测序kit参数’ | 盒 | illumina | ||
19 | 测序芯片 | NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 | 具体数据量详见‘3.测序kit参数’ | 盒 | illumina | ||
20 | 清洗试剂 | 清洗试剂盒 | EXP-WSH004 | 芯片清洗试剂盒，每个试剂盒可清洗6次测序芯片，每个试剂盒可匹配144人份新冠溯源样本 | 盒 | Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) | |
21 | 测序辅助试剂 | 测序启动扩展试剂盒-Nanopore | EXP-FLP002 | 上机缓冲液，每一盒测序试剂盒送一盒 | 盒 | Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) | |
22 | 测序芯片 | Flow Cell(测序芯片) | FLO-MIN106D | 测序芯片Flow cells R9.4。一张芯片可产生30Gb数据，每张芯片可测24人份新冠溯源样本 | 张 | Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) | |
23 | 文库构建试剂 | Native Barcoding Kit 1-12(无扩增条形码扩展试剂盒1 -12) | EXP-NBD104 | EXP-NBD104,用于混样测序，一共12个条码，可配合构建6个标准DNA文库。每个试剂盒可匹配144人份新冠溯源样本 | 盒 | Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) | |
24 | 文库构建试剂 | 快速条码测序试剂盒 | SQK-RBK004 | 快速法文库构建试剂，一个试剂盒包含6次反应（每次反应最多12个样本），可构建72个快速DNA文库。 | 盒 | Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) | |
25 | 文库构建试剂 | SQK-PBK004 | SQK-PBK004 | 快速PCR法文库构建试剂，一个试剂盒包含6次反应（每次反应最多12个样本），可构建72个快速PCR文库。 | 盒 | Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) | |
26 | 文库构建试剂 | Ligation Sequencing Kit 1D (PM)(连接测序试剂盒) | SQK-LSK110 | SQK-LSK110，一个试剂盒包含6个反应，可构建6个标准DNA文库。每个试剂盒可匹配144人份新冠溯源样本 | 盒 | Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) | |
27 | 实验对照 | Control Expansion(标准控制实验扩展包) | EXP-CTL001 | EXP-CTL001，DNA标准品。一个试剂盒含6个标准反应，每个试剂盒可匹配144人份新冠溯源样本 | 盒 | Oxford Nanopore Technologies(牛津纳米孔科技有限公司) |
1.测序kit参数
Flow Cell Type | SP | S1 | S2 | S4 |
1 × 35bp | N/A | N/A | N/A | 280-350 Gb |
2 × 50bp | 65-80 Gb | 134-167 Gb | 333-417 Gb | N/A |
2 × 100bp | 134-167 Gb | 266-333 Gb | 667-833 Gb | 1600-2000 Gb |
2 × 150bp | 200-250 Gb | 400-500 Gb | 1000-1250 Gb | 2400-3000 Gb |
2 × 250bp** | 325-400 Gb | N/A | N/A | N/A |
*Specifications based on Illumina PhiX control library at supported cluster densities.
** Maximum read length.
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