长沙市中心医院:基因测序仪(配套辅助设备+生信分析系统)采购需求公开
长沙市中心医院:基因测序仪(配套辅助设备+生信分析系统)采购需求公开
一、设备名称:基因测序仪(配套辅助设备+生信分析系统)
二、采购预算金额:*******元
三、技术参数及要求
1.二代基因测序(配套辅助设备仪及生信分析)系统组成
1.1.二代基因测序仪:可开展胎儿染色体异常无创产前基因检测、胚胎植入前染色体异常检测、单基因遗传病基因检测、肿瘤基因检测、未知病原微生物基因检测等临床应用,可开展全基因组测序、全外显子测序、宏基因组测序、单细胞测序等科研应用。
1.2.生信分析系统:至少包括无创项目专用,信息分析、实验室管理;病原项目专用,信息分析、实验室管理;肿瘤项目专用,信息分析、实验室管理三个方面。
1.3.自动化样本制备系统:至少包括无创项目专用;病原项目专用;肿瘤项目专用三个方面独立的全自动样本建库。
1.4.生物分析仪/全自动核酸蛋白分析系统:采用毛细管电泳原理,可应用于DNA、RNA等核酸的电泳分析,能进行全自动的核酸片段大小测定,核酸质控,浓度测定,具有2bp-3bp分辨率的高分辨率功能。
1.5.单独配备辅助基因测序仪1台(可选多种测序芯片试剂种类,可选的单端或双端测序;读长达2x150bp时,单次测序可生成24亿(2.4G)、75亿(7.5G)碱基数据,满足多种实验需求;读长达1x100bp时,单次测序可生成20亿(2.0G)碱基数据,测序时间短,满足对测序时间要求快的实验需求):可开展胎儿染色体异常无创产前基因检测、肿瘤基因检测、未知病原微生物基因检测等临床应用。
1.6.其他辅助设备:满足无创、病原微生物和肿瘤基因检测检测实验过程需求的整套辅助设备。
2.二代高通量测序仪技术参数
2.1.临床通用型平台,临床注册适用范围包含NIPT、肿瘤等多种应用,还可用于其他体外诊断项目的检测。
2.2.采取国际认可度高的测序核心技术:边合成边测序或联合探针锚定聚合测序法。
2.3.通量:测序数据通量可选择至少两种通量的测序芯片,满足不同时期的业务需求,高通量芯片每次运行可生成至少120G碱基数据。单张芯片单次运行最高可至少达到400M有效信号点。
2.4.芯片:单张芯片≥有4个独立的流道,至少可同时运行≥3种不同的检测样本(文库)。
2.5.测序质量:以Q30为测序质量标准(即每个碱基的准确度为99.9%),标准品Phix在2X150测序模式下,75%以上的碱基比例可达到Q30。
2.6.可精确读取≥12个的连续单个重复碱基
2.7.▲测序时间:测序时间短,75循环测序时间低于18小时,300循环测序时间低于30小时。
2.8.单位时间测序通量:每24小时可产出不少于100Gb数据量。
2.9.▲使用双色荧光系统进行碱基识别,以提高测序速度。
2.10.仪器有配套的国械注册NIPT试剂盒以及肿瘤体外诊断试剂盒。
2.11.▲数据分析结果无灰区设置,提高实验成功率。
2.12.▲模板扩增:测序的模板扩增过程为自动化,无需手工操作,且在同一台仪器上完成,无需配置额外的设备。
2.13.文库构建操作简单、单管操作、无PCR反应过程,有效避免因PCR扩增带来的偏好性。
3.生信分析系统
3.1.★自动本地化完成信息分析,分析结束后直接输出检测报告,所有数据分析必须在本实验室完成,数据不需要外发,本地化存储、分析及管理。
3.2.无创、病原、肿瘤三个方向的项目信息分析、实验室管理等生信分析系统独立专用,互不交叉。
3.3.各生信分析系统功能可支持样品管理、实验管理、数据管理、报告管理、多种临床检测应用的信息分析、权限设置。
3.4.各生信分析系统具备成熟的检测相关信息分析软件,并获得医疗器械注册证。
4.自动化样本制备系统
4.1.★提供无创项目、病原项目及肿瘤项目三个独立的全自动样本建库系统。
4.2.全自动样本制备系统。可应用环节:自动完成NGS文库制备、包括核酸纯化、DNA片段长度选择、样品浓度均一化、酶反应体系构建、测序反应体系构建、磁珠纯化、温控反应、文库pooling、PCR/QPCR体系构建、分液配液等。
4.3.自动化样本制备系统可配备自动PCR仪模块,进而实现文库构建全流程操作。建库纯化标准流程通量为至少1-48个样本,优化好试剂与程序后建库纯化通量为1-96;整合PCR仪后,系统设置好程序后可以一次性全自动运行至少1-32个样本的二代测序文库构建全流程,全程无需人工换板以及人工操作。
5.生物分析仪/全自动核酸蛋白分析系统:
5.1.采用毛细管电泳原理,可应用于DNA、RNA等核酸的电泳分析,能进行全自动的核酸片段大小测定,核酸质控,浓度测定,具有2bp-3bp分辨率的高分辨率功能。
5.2.上样形式:直接兼容常规单管0.2ml离心管、常规8联管,具有8孔模块,可根据需要选配12孔。
5.3.可单次自动检测处理单个样本不造成浪费。
5.4.检测片段范围:15bp-50kb,可以检测大于50kb。
5.5.灵敏度:无需对样品进行纯化,可以直接对PCR产物原液进行检测。DNA样品的检测灵敏度可达<5pg/ul。
6.辅助基因测序仪
6.1.获得国家药品监督管理局(NMPA)的中华人民共和国医疗器械注册证,为临床通用型平台,临床注册适用范围包含NIPT、肿瘤、微生物等多种应用,还可用于其他体外诊断项目的检测。
7.其他辅助设备:提供满足无创及升级版、病原微生物和肿瘤基因检测实验过程需求的整套辅助设备,实验室无需为项目的开展而购买新的任何设备。
8.售后服务:
8.1.质保:承担整机系统(最终验收合格后)维护保修,使用配套试剂耗材期间承担该项目所有设备的质保,包含仪器维修维护所需要的所有耗材和配件,负责仪器的年度校准并出具校准报告,仪器故障后在2小时内响应,24小时内到达现场。
8.2.提供完善的无创项目、病原项目及肿瘤项目实验室技术人员培训,提供仪器安装、实验室布局及技术支持等全流程实验室解决方案。
8.3.供应商仪器使用期间,提供无创项目、病原项目、肿瘤项目的技术支持。
8.4.负责联接医院LIS系统及产诊系统,承担接口连接费用。
8.5.检测项目试剂价格(包括试剂、耗材、质控品、校准品等项目所需所有材料。报价包括试剂及耗材,质控品、校准品等配套提供)<每个项目收费价格(现行长沙市收费物价)的40%。试剂及耗材符合长沙市医保政策,需具有鑫卫网挂网价格,投标报价不得高于挂网价。
8.6.本项目所包含设备原厂质保5年。
9.★配置清单
9.1.二代基因测序仪1台
9.2.生信分析系统3套
9.3.自动化样本制备系统3套
9.4.生物分析仪/全自动核酸蛋白分析系统1套
9.5.辅助基因测序仪1台
9.6.其他辅助设备:满足无创、病原微生物和肿瘤基因检测检测实验过程需求的整套辅助设备。
二、相关标准:详见采购文件
三、技术规格:详见采购文件
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