内蒙古综合疾控中心免疫规划科软件购置公开招采公告

内蒙古综合疾控中心免疫规划科软件购置公开招采公告

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内蒙古自治区综合疾病预防控制中心免疫规划科
软件购置公开招采公告
根据内蒙古自治区政府采购中心批复的采购组织形式及内蒙古
自治区综合疾病预防控制中心实施办法的要求,免疫规划科现公开招
采CLC软件,欢迎符合条件的供应商前来报名参加。
一项目名称:免疫软件购置
二采购项目编号:项目流水号202225766号
采购方式:竞争性谈判
预算金额:壹拾叁万陆仟元整136000
三项目技术参数及具体要求
l.操作系统:支持Windows,macOS,Linxu操作系统
l.1windows系统包含:Windows7,Windows8,Windows10,WindowsServer
2012,WindowsServer2016
1.2mac0S:0SX10.10,10.11和mac0S10.12,10.13,10.14:
l.3Linux:RHEL7及以上版本,SUSELinuxEnterpriseServer11及以
上版本,亦支持其他Linux版本。
2.运行硬件要求:
2.1Intel或AMD的中央处理器,建议选择16物理核或32物理核的CPU,
不要超过64逻辑核(32物理核)。64位计算机或操作系统
2.2RAM:最低要求2GBRAM:推荐使用16GB或更高RAM,具体根据待处理
数据或者其他限制来配置运行内存
2.3屏幕分辨率:最低要求1024X768,推荐使用1600X1200。
2.4显卡:需要支持openGL2.0
2.5硬盘:推荐选择选择2T或者更高存贮硬盘。
3.操作界面:可视化操作系统,无需命令行操作经验
4.数据类型:支持Sanger测序数据NGS数据和三代测序数据
4.1Sanger测序数据文件:abi等文件
4.2NGS数据:几乎所有二代测序平台数据,如SOLIDLifeIonTorrent
CompleteGenomics,Roche454,IlluminaGenomeAnalyzer
4.3三代测序数据:Nanopore和PacBio测序平台数据
5.功能模块:提供DNA-seq,RNA-seq,Chip-seq,metagenomics等测序数据
的生物信息学分析,具体功能如下:
5.1重测序数据分析:CLCGenomicsWorkbench包含完整的重测序分析流
程,包含完整变异位点的检测和遗传变异位点比较。CC重测序数据分析支
持不同格式的测序数据,包括短读长和长读长数据,以及所有类型的
Paired--end数据,无论插入片段大小或读取方向是哪种类型,而且支持混
合类型的数据集。
5.2变异分析:提供不同变异类型的算法,包括SNW(单核苷酸变异)
MNVs(多核苷酸变异)不同长度的插入缺失或替换以及大的结构变异。
5.3denovo拼接:支持NGS和三代测序数据的denovoassemble支持
三代测序数据的错误矫正等分析功能:支持短读长和长读长测序数据的混合
拼接:支持基因组完成图的拼接
5.4转录组数据分析:提供RNA-seq数据分析的标准化分析流程,且可以
自主拓展高级化差异表达数据分析:提供case-control多组实验以及多因
素实验的设计。提供Track格式表格展示数据:提供多种可视化方式来展
示Metadata,例如火山图2D热图主成分分析和维恩图等。
5.5宏基因组和病原体分析:支持MLST,16S/宏基因组数据分析:支持微
生物物种多样性及丰度分析支持微生物种类和功能进行鉴定并比较:支持
进化树构建,提供K-mer和SNP两种方式构建进化树:支持基因预测分析:
支持耐药性分析。
5.6经典序列分析:提供BLASTSanger数据或参考序列的从头组装引
物设计分子克隆3D结构可视化以及一系列不同的比对算法和工具用于
系统发育树的分析。
5.7数据库:提供多种类型数据下载功能,如人类参考基因,常见微生物
数据库,宏基因组数据库,16s扩增子数据库,耐药性数据库等:亦支持导
入其他类型数据库。
6。结果呈现:数据分析结果,同时支持以图和数据方式呈现。
6.图形式呈现:支持heatmap,Krona,.柱状堆叠图等多种图形展示方式:
交互式自定义图形展示行列,如不同taxonomylevel的展示:支持自定义
图形字体及图样:
6.2数据表格式呈现:自定义展示列:支持自定义过滤方式:
7.数据导出:图类型支持常见的JPEG,PDF,SVG等,支持不同分辨率导出:
表类型结果,支持特定分析结果格式导出,如TAB,EXCEL,BAM,VCF等。
8.软件更新:软件及插件可实现每季度进行更新,用户可自主选择更新。
四报价及报价函要求
1投标报名人须提供经国家工商机关年检合格有效并加盖投标
企业公章的营业执照营业执照经营范围须包含公开招采内容复印
件经企业法人签字并加盖公章的授权委托书及被委托人的身
份证复印件。
2.投标报价须报出单价及总价,报价函须加盖企业公章后密封签
字盖章递交,封面标注投标项目名称企业名称企业联系人及联
系方式。
3.投标报价须在有效期投标,报价包含所有税费。
4.中心设备与试剂科负责资格初审,最终资格由中心采购小组认
定。
5.请投标供应商通过传真及电子邮箱发送报价资料时务必在文件
名中注明:所投标项目名称备案流水号预算总金额。否则不予接
收。
五投标报名时间及地点
1.投标报名时间:2022年12月2日-2022年12月4日(9:00-16:30)
2投标报名地点:内蒙古自治区综合疾病预防控制中心设备与试剂科
(鸿盛工业园办公区1号楼306室)
3.投标报名联系人:董冰
联系电话:0471-4395884
传真:0471-5964101
邮箱:nmg404040163.com
备注:因疫情原因我中心现开通传真及电子邮箱渠道接收投标供应商
报名。
内蒙古觳综合编防控制中心
2022年12月2日
15

标签: 免疫规划 疾控 软件

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