辅助药物设计平台（GY202210824）采购公告

招 标 正 文
 

辅助药物设计平台（GY202210824）采购公告

项目名称辅助药物设计平台项目编号GY*********
公告开始日期167*****38000公告截止日期167*****00000
采购单位山东大学付款方式电汇，预付90%，货到验收10%
联系人中标后在我参与的项目中查看联系电话中标后在我参与的项目中查看
签约时间要求成交后15个工作日内到货时间要求收到信用证后1个月内
预 算*****.0
收货地址山东大学趵突泉校区
供应商资质要求

符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购商品采购数量计量单位所属分类
辅助药物设计平台1套其他试验仪器及装置
品牌Schr？dinger
型号Schr？dinger
品牌2无
型号无
品牌3无
型号无
预算*****.0
技术参数及配置要求1.提供药物靶标结构模建功能，模建时序列比对提供Blast和PSI-Blast两种方法，蛋白家族认证时使用HMMER/Pfam方法。软件在确定模版时可以考虑家族信息。2.提供以下算法评价靶标蛋白结构的合理区和不合理区：RamachandranPlot；PeptidePlanarity；StericClashes；BondLengthDeviations；BondAngleDeviations；BackboneDihedrals；SidechainDihedrals；G-factorSummary；AverageB-factors；GammaAtomB-factors；SidechainPlanarity；ImproperTorsions；C-alphaStereochemistry；MissingAtoms；3.对接模块，针对靶标结构可以实现高通量虚拟筛选，在虚拟筛选过程中，根据时间和精度的需要，软件提供三种对接模式：最快的模式可以2秒筛选一个配体；中等精度模式可30秒筛选一个配体；最高精度模式可5-10分钟筛选一个配体。软件在虚拟筛选时可以加入配体性质过滤器，过滤器可以是分子量、反应官能团、ADME性质等，将不符合条件的配体从库中排除。虚拟筛选时的限制条件可以加入药效团信息。对接时要求打分函数包含靶标活性位点疏水面的计算，既可以考虑熵的变化也考虑焓的变化。软件在虚拟筛选时能预测反应官能团而有效发现结果中的假阳性。4.软件在对接中可以考虑配体分子对靶标结构的诱导契合(induced-fit)模式，配体进入活性位点以后，软件采用全新预测的方式来预测配体存在的情况下活性位点的构象的改变，可以考虑两种构象改变：靶标活性位点相邻两个原子180度的几何翻转和靶标活性位点相邻两个氨基酸残基180度的几何翻转；5.可以对药物靶标分子活性位点反应机理进行研究，提供QM/MM的方法研究靶标活性位点的反应机理，在反应机理研究中保证靶标结构的完整，并对靶标的活性位点采用QM方法，蛋白其他部分采用MM方法；6.软件提供工具构建配体分子，配体分子应包括有机化合物、肽、核酸或者多糖分子；7.软件提供共价对接功能；8.可以预测药物靶标配体的ADME性质预测，能够在对接过程中，对整个数据库，或者单个分子计算ADME性质。计算的ADME性质包含反应官能团（引起对接结果的假阳性和生物体内毒性问题）、药物针对中枢神经系统的活性、药物封闭HERG K+通道的IC50值、药物的血脑屏障及血脑屏障模型MDCK细胞的渗透性；药物的皮肤渗透性、可能的代谢反应的数量、药物和人的血清白蛋白的结合能力、口服药物的吸收性、药物从皮肤吸收到血液的最大渗透率等等；9.16Tokens库, 有效期5年，含5年软件升级。包含以下模块:ConfGen，Core HoppingEpik，Glide，LigPrep，MacroModel，Prime, Jaguar, Jaguar Pka, QSite， SiteMap10.Maestro界面, 50个浮动licenses。有效期5年，含5年软件升级。11.软件基本操作界面（用户图形界面）在同一台终端上或不同终端上可以至少同时打10个界面；12.所有软件功能必须在统一图形操作界面下运行，要求提供五年的软件使用权限，并且包含五年的软件升级；13.提供原厂授权及质保函。
售后服务服务网点:不限;质保期限:1年;响应期限:报修后48小时;

报价地址：https://www.yuncaitong.cn/publish/2022/12/31/20LCBZRWMI630SKJ.shtml

标签: 药物 辅助

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