一、项目概况

利用高通量二代测序仪的下机数据，在实验室的本地电脑上（Linux操作系统），整合各种生物信息学软件以及结核分枝杆菌研究领域分子流行病学分析工具，搭建成一套快速的、易用的结核病传播风险因素分析流程。

二、分析流程应具备的功能

1. 质量控制：对于测序所得的原始数据进行质量控制，去除测序、建库过程中添加的引物、接头及低质量序列等。

2. 序列过滤：可去除宿主和非结核分枝杆菌的序列。

3. WGS-SNPs分析：与参考基因组序列比对，检测分析样本菌株全基因组的单核苷酸多态性（SNPs）。

4. 构建进化树：根据菌株之间WGS-SNPs的差异，评估菌株间的亲缘关系（遗传距离），构建传播网络。

5. 传播风险因素推测：元数据文件输入病例流行病学特征数据与菌株成簇结果进行单因素回归分析，推测传播风险因素。

三、服务地点和内容：结核病防制所办公室本地电脑上完成分析流程的安装和调试运行，培训不少于5人次会使用并能运行维护。

四、服务时间：2023年8月-2023年12月

五、收集的材料：

1. 分析流程搭建的方案。

2. 报价及编制说明。

3. 加盖有公章的营业执照复印件。

4. 其他补充的资质证明材料。

六、材料递交及联系方式：

1.网上递交：所有材料打印加盖公章后扫描成PDF文件格式，发送至邮箱：gxjfk-tbc@163.com

2.现场递交或寄送：所有材料装入密封文件袋，并用密封条封口后加盖公章寄送或递交至本中心。

地址：南宁市青秀区金洲路18号广西疾病预防控制中心。

联系人及电话：区老师 0771-*******。

七、征集截止日期：2023年7月28日

　　　　　　　　　　　　　　　　广西壮族自治区疾病预防控制中心

　　　 　 2023年7月1７日