陕西省疾控中心生物所测序服务招标公告

陕西省疾控中心生物所测序服务招标公告

因工作需要,我中心生物所拟采购测序服务,欢迎符合资质条件的供应商携带资质报名参加。

一、项目名称:

项目名称:陕西省疾控中心生物所测序服务

采购预算:6万元

报名日期:2023年7月25日-2023年7月27日(工作日)

报名方式:电话报名。上午:8:00-11:30,下午:15:00-17:30

开标时间:2023年7月28日9:30

开标时间:陕西省疾病预防控制中心实验大楼3楼会议室

报名电话:029-******** 郝亮

二、技术要求

测序服务包括16S扩增子测序及细菌基因组二代框架图测序二部分

一、16S扩增子测序服务

样品数量:200份(次)

要求服务包括

1、食品样品DNA提取

2、16S扩增子测序

基本参数要求:

1.测序要求:使用Illumina公司TruSeq? DNA PCR-Free Sample Preparation Kit构建文库,使用Illumina Novaseq主流高通量测序平台进行 PE250 测序;单样本测序数据量(raw tags)不少于5万条,单样本交付数据量不少于承诺数据量的100%,要求原始数据Q30不低于75%,Q20不低于80%;

2.分析要求:

(1)基本质控 对原始数据进行去除接头、污染序列和低质量 reads 的处理、根据Barcode 和引物序列将数据拆分为不同样品、去除嵌合体;

(2)标准信息分析QIIME2流程,物种注释(OTU聚类及物种注释概况)、物种分布情况(相对丰度、分类树、热图等)、样本复杂度分析(Alpha Diversity、物种多样性曲线等)、多样本比较分析(Beta Diversity、矩阵热图、降维分析等)、统计检验(组间差异分析、组间群落结构差异显著性检验(Anosim、MRPP、Adonis、Amova) 组间差异物种分析)、关联分析与模型预测(环境因子关联分析、Network 分 析、随机森林)功能预测(PICRUST、Tax4fun、FAPROTAX、FunGuild、BugBase 分析) ;

3.在线分析:提供在线自主参数设置的云平台分析,可对数据进行在线分析,且分析参数等可在云平台上随时调整;

二、细菌全基因组测序服务

服务要求:对提交的细菌菌株核酸样本完成全基因组框架图测序

1、样品数量:180株(次)

2、测序技术及质量要求:使用 Illumina Novaseq高通量测序平台, PE150 或以上双向测序(单向读长150bp或以上),高质量数据(CleanData)产出不小于1000MB数据量,测序深度不小于100×,碱基平均覆盖度不小于99.5%,要求原始数据准确度Q30大于85%,Q20不低于95%,碱基分布均匀,无GC分离,基因组覆盖度不小于95%,基因区覆盖度不小于98%。组装后SCAFFOLD数量小于100个,CONTIG数量小于200个。

三、投标请提供下列文件:

1、营业执照,法人授权书,被授权人身份证,相关技术服务机构资质。(复印件盖公章)

2、报价单。需按照检测项目要求报价,写明单价、总价,联系方式。(加盖单位公章)

3、以上文件将作为最终询价文件进行评审。

四、评标办法

1、公司实力、各种证照、授权齐全。

2、以价格最低作为重要参考。

3、项目采取两轮报价,以第二轮报价作为最终报价进行评审。


联系人:郝工
电话:010-68960698
邮箱:1049263697@qq.com

标签: 测序服务

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