成都市第七人民医院测序检测服务项目（二次），现进行挂网比选，欢迎符合条件的供应商积极报名。

一、项目名称：测序检测服务项目（二次）

二、项目编号：CGB2023-40

三、项目概述：

（一）为更好地执行四川省科技厅科研课题研究工作，用于高效、准确探查青蒿琥酯诱导肝癌细胞铁代谢相关蛋白及蛋白变化挑动的代谢变化探寻线索。现采购测序检测服务项目。

（二）本项目预算9.6万元，最高限价9.6万元。

四、资格要求：

（一）具有独立承担民事责任的能力；

（二）具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；

（三）具有履行合同所必需的设备和专业技术能力；

（四）具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；

（五）参加本次采购活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录；

（六）法律、行政法规规定的其他条件；

（七）不允许联合体参加；

五、参数要求（实质性要求）:

（一）技术/服务要求（实质性要求）：

1、4D label free蛋白组学检测要求：

对细胞样本27例开展基于质谱的蛋白质组学分析，其中蛋白质组学分析应包括供试样本制备、4D labelfree蛋白质组学质谱检测、质控分析、定性定量结果分析及生物信息学分析。分析内容主要包括鉴定分析、表达差异分析、功能分析等。拥有免费的云平台分析系统，提供针对性的技术服务。

（1）各项指标要求：

检测平台：tims TOF Pro 平台。

BCA法进行蛋白质定量，质控样本蛋白含量是否满足实验需求，等量进行后续实验保证定量检测的准确性，SDS-PAGE结果，质控每例样本蛋白完整性；

样本前处理、提取蛋白质及质控，酶解蛋白提供统一、标准化流程服务，使用4D蛋白组仪器tims TOF Pro 2上机检测，单次上机检测时长不低于80min；

采用MaxQuant 软件(版本号 1.6.14) 进行查库鉴定及定量分析,搜库参数的阈值为默认值：蛋白和肽段的设置FDR≦0.01；

实时监测项目进度，包括从送样到数据分析，至发送报告，有迹可循，做到随时跟踪，及时反馈；

及时反馈完整的实验报告（包括实验记录、实验材料、实验设备、实验方法、实验过程、实验结果等）、完整的数据分析报告。

（2）下机数据质控分析：

质控分析：肽段离子质量偏差分布、肽段离子得分分布、蛋白质丰度比分布；

蛋白与肽段特性分析:蛋白质相对分子质量分布、肽段序列长度分布、肽段序列覆盖度、鉴定肽段数量分布。

（3）生物信息学分析：

鉴定数量分析：鉴定与定量结果统计、单个样本蛋白质鉴定结果统计、韦恩图分析；

表达差异分析：差异结果数量统计、火山图、聚类分析；

功能分析：亚细胞定位分析、结构域分析、GO 功能分析、KEGG 通路分析、KEGG 通路分析。

2、非靶向代谢组学检测要求：

基于质谱的LC-MS/MS代谢组学检测分析，对细胞样本54例的代谢产物进行非靶向代谢组学筛选。数据分析中可提供相同样本的代谢组和蛋白质组的联合分析。采用液相色谱-质谱联用技术对样本使用非偏向的提取和分离方法进行代谢组数据的采集。得到代谢谱图，比较不同组代谢产物的含量，寻找尽可能多的差异代谢物，并探索差异代谢物之间的代谢通路。拥有免费的云平台分析系统，提供针对性地技术服务。

（1）各项指标要求：

检测平台：Q Exactive 系列质谱仪(Thermo)平台；

使用质谱仪上机检测，实际单个样本检测时长小于20min，（POS+NEG）两种模式，检测过程中样本间穿插空白样本、QC样本用于监测仪器稳定运行状态；

原始数据（raw）经 ProteoWizard 转换成mzXML 格式，采用XCMS软件进行峰对齐、保留时间校正和提取峰面积。对XCMS提取得到的数据首先进行代谢物结构鉴定、数据预处理，然后进行实验数据质量评价，最后再进行数据分析；

实时监测项目进度，包括从送样到数据分析，至发送报告，每一步有迹可循，做到随时跟踪，及时反馈；

及时反馈完整的实验报告（包括实验材料、实验设备、实验方法、实验过程、实验结果等）、完整的数据分析报告。

（2）实验数据质控：

使用样本总离子流图（TIC）、总体样本主成分分析（PCA）、样本相关性、总体样本 Hotelling’s T2 检验、样本的多变量控制图、样本的相对标准偏差对数据进行质控 。

（3）实验数据质控：

鉴定结果统计与分析：代谢物鉴定数量统计、代谢物化学分类归属统计；

组间差异分析：单变量统计分析、多维统计分析、差异代谢物筛选；

差异代谢物生物信息学分析：聚类分析、相关性分析、KEGG 通路注释与分析。

3、真核转录组检测要求：

开展基于二代测序的转录组检测分析，对细胞样本27例中的差异表达基因进行筛选。通过进一步的富集分析挖掘关键功能基因以及相关代谢通路。数据分析中可提供相同样本的代谢组和蛋白质组的联合分析。

（1）各项指标要求：

检测平台：Illumina NovaSeq6000；

测序数据量：6G raw data；

数据质控：Q20>90％，Q30>85％；

实时监测项目进度，包括从送样到数据分析，至发送报告，有迹可循，做到随时跟踪，及时反馈；

及时反馈完整的实验报告（包括实验材料、实验设备、实验方法、实验过程、实验结果等）、完整的数据分析报告。

（2）生物信息学分析：

基因表达定量分析、基因差异表达分析、功能富集分析、基因结构分析等。

（二）商务要求（实质性要求）：

1.付款方式：

供应商应开具合法增值税发票，合同签订后30个工作日内支付合同总金额的40%检测服务预付款，数据检测完成并交付完成后30个工作日内支付合同总金额30%，数据基础分析和个体化分析完成后30个工作日内支付合同总金额30%。

2.售后要求：

测序数据分析，包含两次，一次为基础分析（包括但不限于代谢物质鉴定数量分析、蛋白表达关联分析、蛋白GO关联分析、蛋白KEGG关联分析、基因表达定量分析、基因差异表达分析、功能富集分析、基因结构分析），一次为个体化分析。

3.项目交付的时间和地点：

测序检测时间：合同签订之日起-2023年11月25日；数据分析完成时间：2023年12月15日前。

4.验收的标准:

提供分析报告模板中包含的分析内容、附件、全部原始数据。

5.本项目不收取履约保证金。

6.其它：无

六、评分方法：综合评分法（评分表见附件）

七、报名需提供的资料：(以下资料均需加盖供应商公章)

（一）营业执照（复印件）；

（二）法定代表人报名时提供身份证明材料；非法定代表人报名时提供法定代表人授权书原件（格式见附件）；

（三）法定代表人及被授权人的身份证复印件（正反面）；

（四）报名时提交联系人联系方式（电话号码和QQ邮箱号码）。

八、比选时需提交的资料及注意事项（响应资料正本一份即可，无需副本。）

(一) 资格响应

1.营业执照（复印件）；

2.承诺函（格式详见附件）；

3. 法定代表人报名时提供身份证明材料；非法定代表人参加需提供法定代表人授权书原件（格式详见附件）；

4.法定代表人及被授权人的身份证复印件（正反面）；

5.提供2023年9月25日以后的“信用中国”网站的信用查询记录并下载打印。（信用信息资料图片要求模板见附件），查询方法：登陆“信用中国官方网站” →搜索条内输入公司名称并点击查询→点击界面上出现的公司名称→点击“下载信用信息报告” →下载并打印出相关信用信息资料即可）；

［注］：以上1-5项为响应文件的资格响应部分，缺一不可，须全部加盖供应商公章，若出现资料不齐、内容与采购公告要求不符、未按规定签署及盖章、材料过期失效等情形，将不能通过资格审查。

（二）其他响应

6.报价函（格式详见附件）；

7.技术/服务响应表（格式详见附件）；

8.商务响应表（格式详见附件）；

9.业绩证明材料。若无业绩证明材料可以不提供；

10.比选公告及评分表中要求提供的相关承诺函及其它内容资料（格式自拟）。

［注］：

1.评审过程中，对于已通过资格性审查的供应商，评审小组对其响应文件的有效性、完整性和响应程度进行审查（符合性审查），审查中发现供应商响应文件属于下列情况之一的，应按照无效响应文件处理：

（1）响应文件组成明显不符合采购公告的规定要求，影响评审小组评判的；

（2）响应文件的语言、计量单位、知识产权、响应有效期等不符合采购公告的规定，影响评审小组评判的；

（3）评审小组与供应商在评审现场沟通后，供应商的响应文件仍不能完全响应采购公告的实质性要求的；

（4）未载明或者载明的采购项目履约时间、方式、数量及其他采购合同实质性内容与本采购公告要求不一致，且采购人无法接受的。

但评审小组对响应文件签署、盖章等进行审查过程中，有下列情形的，评审小组应当评定为不影响整个响应文件有效性和采购活动公平竞争，并通过响应文件的有效性审查：

（1）响应文件除采购公告明确要求加盖单位(法人)公章的以外，其他地方以相关专用章加盖的；

（2）以骑缝章的形式代替响应文件内容逐页盖章的（但是骑缝章模糊不清，印章名称无法辨认的除外）。

2.报价如果出现下列不一致的，可按以下原则进行修改：

（1）大写金额和小写金额不一致的，以大写金额为准，但大写金额文字存在错误的，应当先对大写金额的文字错误进行澄清、说明或者更正，再行修正；

（2）总价金额与按单价汇总金额不一致的，以单价金额计算结果为准，但单价或者单价汇总金额存在数字或者文字错误的，应当先对数字或者文字错误进行澄清、说明或者更正，再行修正；

（3）单价金额小数点或者百分比有明显错位的，以总价为准，修正单价。

同时出现两种以上不一致的，按照上述规定的顺序修正。修正后的报价经供应商确认后产生约束力，供应商不确认的，其响应文件作为无效处理。供应商确认采取书面且加盖单位公章或者供应商授权代表签字的方式。

3.响应文件内的所有资料均需加盖供应商公章，装订成册，正本、副本各一份（副本可以用正本的复印件），密封递交（封面、封套上注明项目名称、项目编号、供应商名称等内容，格式自拟）。响应文件请于比选会当天的比选时间前密封送达比选现场，未密封或未在比选会开始时间前送达的一律拒绝收取。

4.不接受邮寄资料。

5.本次采购的所有内容均以公告形式在医院官网公开发布，报名时不再单独提供比选文件。

6.我院对供应商围标、串标和欺诈等行为依法予以追究并向社会公布，且三年内不得参与我院采购项目的竞争。一但发现有下列情形之一的，视为投标人串通投标，其投标无效。

（1）不同供应商的响应文件由同一单位或者个人编制；

（2） 不同供应商委托同一单位或者个人办理采购活动事宜；

（3）不同供应商的响应文件载明的项目管理成员或者联系人员为同一人；

（4）不同供应商的响应文件异常一致或者报价呈规律性差异；

（5）不同供应商的响应文件相互混装。

7.参考《中华人民共和国政府采购法》：中标或者成交供应商拒绝与采购人签订合同的，采购人可以按照评审报告推荐的中标或者成交候选人名单排序，确定下一候选人为中标或者成交供应商，也可以重新开展政府采购活动。

8.其余相关事宜，参考政府采购相关法律法规执行。

九、报名时间：2023年9月26日—2023年9月28日（工作日）,上午8:15-12:00时，下午13：00-17:00时。

十、报名地址：成都市第七人民医院（天府院区）采购管理办公室******室（双流区双兴大道1188号门诊大楼四楼，体检中心旁）；报名、项目咨询联系电话及联系人：028-********，严老师。

十一、比选时间：2023年10月8日，上午9时30分。

十二、比选地点：成都市第七人民医院天府院区（双流区双兴大道1188号门诊大楼采购办会议室）。

成都市第七人民医院

2023年9月25日

附件1

承诺函

致成都市第七人民医院：

本单位（供应商名称 ）参加测序检测服务项目（二次）的采购活动，现承诺：

一、具备本项目规定的条件：

（一）具有独立承担民事责任的能力；

（二）具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度；

（三）具有履行合同所必需的设备和专业技术能力；

（四）具有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录；

（五）参加本次采购活动前三年内，在经营活动中没有重大违法记录；

（六）法律、行政法规规定的其他条件；

（七）非联合体参加；

二、截至比选/比价申请文件递交截止日未被列入失信被执行人、重大税收违法案件当事人名单、政府采购严重违法失信行为记录名单。

三、我单位及其现任法定代表人/主要负责人不具有行贿犯罪记录，也无接受国家各级部门行政处罚的情况。

本单位对上述承诺的内容事项真实性负责。如经查实上述承诺的内容事项存在虚假，我单位愿意接受以提供虚假材料谋取成交追究法律责任。

供应商名称：(加盖公章)

法定代表人或委托代理人:（签字或加盖个人印章）

日期： 年 月 日

附件2

法定代表人授权书

成都市第七人民医院：

（供应商全称）法定代表人 授权 为我公司代理人，参加贵单位组织的测序检测服务项目（二次）采购活动。代理人在本次参加货物/服务采购活动中所签署的一切文件和处理的一切有关事务，我公司均予承认。

本授权书 年 月 日签字生效，并作出如下声明：

1、我方无条件认可《采购公告》中原则申明的相关内容。

2、我方将严格按《采购公告》的规定履行合同责任和义务。

3、我方同意提供按照贵方可能要求的与其采购活动有关的一切数据或资料。

供应商全称： （加盖公章）

法定代表人： （签字或加盖个人印章）

代 理 人： （签字或加盖个人印章）

代理人联系方式： 。

日 期： 年 月 日

（供应商法定代表人、代理人身份证复印件并加盖公章附后）

附件3

报价函

注:

1.所有报价均用人民币表示。

2.应完整填写产品的品牌和型号或项目内容（如适用）。

3.超过总价限价和各分项限价的报价无效。

4.报价函有多页的，须每页加盖供应商公章。

5.上表中的“报价合计”金额仅作为本项目计算报价得分使用，实际结算金额根据项目使用情况据实结算（如适用）。

供应商名称：XXX（盖单位公章）

法定代表人/委托代理人（签字或加盖个人印章）：XXX

日期：XXX年XXX月XXX日

附件4

技术参数/服务响应表

商务响应表

供应商名称：(加盖公章)

法定代表人或委托代理人:（签字或加盖个人印章）

日期：XXX年XXX月XXX日

附件5 业绩证明材料（若无业绩证明材料可以不提供）。

附件6 比选公告及评分表中要求提供的相关承诺函及其它内容资料。

附件7

综合评分表

附件8：“信用中国”查询记录资料要求如下：请提供以下样式的截图资料。（要求截图完整，能够显示右上角“生成时间”及其他相关信息。）