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河南中医药大学多组学测试化验采购项目单一来源采购公示
招标编号：/

项目所在地区：河南省
一招标条件

本河南中医药大学多组学测试化验采购项目已由项目审批/核准/备案机关批准
，项目资金来源为其他资金/，招标人为河南中医药大学。本项目已具备招标条
件，现招标方式为其它方式。
二项目概况和招标范围
规模：详见公告内容
范围：本招标项目划分为1个标段，本次招标为其中的：
(001)河南中医药大学多组学测试化验采购项目
三投标人资格要求

(001河南中医药大学多组学测试化验采购项目)的投标人资格能力要求：详见公
告内容
本项目 不允许 联合体投标。
四招标文件的获取
获取时间：从2023年09月27日 00时00分到2023年10月09日 23时59分
获取方式：详见公告内容
五投标文件的递交
递交截止时间：2023年10月10日 11时00分
递交方式：详见公告内容纸质文件递交
六开标时间及地点
开标时间：2023年10月10日 11时00分
开标地点：详见公告内容
七其他

一项目信息
1.项目名称：河南中医药大学多组学测试化验采购项目
2.拟采购的货物或服务的说明
多组学测试化验采购项目包含两部分，包1为标记定量蛋白组学分析项目，包2
为转录组学测序及分析项目。
3.拟采购的货物或服务的预算金额：60.00万元
4.单一来源原因及相关说明
河南中医药大学国家重点研发计划益肾通络方干预糖尿病肾脏疾病3期循证评
价及疗效机制合作研究多组学测试化验采购项目，按照相关要求向中国人类
遗传资源管理办公室申请了中国人类遗传资源国际合作科学研究审批，目
前均已获得了批复，批件号为国科遗办审字2021GH0656号。鉴于标记定量蛋
白组学分析部分技术服务的公司上海中科新生命生物科技有限公司已获得
科技部主管部门的审核和批准，且中国人类遗传资源管理办公室已针对该公司
正式下达了人遗批准书，因此该公司为唯一标记定量蛋白组学分析项目供应商
。
转录组学测序及分析部分技术服务的公司深圳华大基因科技服务有限公司
已获得科技部主管部门的审核和批准，且中国人类遗传资源管理办公室已针对
该公司正式下达了人遗批准书，因此该公司为唯一转录组学测序及分析项目供
应商。
二拟定供应商信息
包1：标记定量蛋白组学分析项目，
供应商名称：上海中科新生命生物科技有限公司，
地址：上海市闵行区园美路58号1号楼
包2：转录组学测序及分析项目，
供应商名称：深圳华大基因科技服务有限公司，
地址：深圳市盐田区盐田街道洪安三街21号华大综合园7栋1010。
三专家论证意见不少于三名行业技术专家
专家姓名 工作单位 职务职称 论证意见
白明学 郑州市中医院 主任药师 见专家论证意见附件
杨宁辉 河南医学高等专科学校 教授 见专家论证意见附件
贾安 黄河科技学院 副教授 见专家论证意见附件
四公示期限
2023年09月27日00时00分 至 2023年10月09日23时59分北京时间，法定节
假日除外。
五异议反馈时限
2023年10月10日00时00分至2023年10月11日23时59分
六其他需要公示内容
供应商对公示的单一来源采购事项有异议的，应当在公示期满2个工作日内20
23年10月10日至2023年10月11日，将书面意见反馈给财政厅和采购人或采购
代理机构。
七联系方式
1.采购人信息
名称：河南中医药大学
地址：郑州市郑东新区金水东路156号
联系人：苏老师
联系方式：037*****0556
2.采购代理机构信息
名称：河南宏业建设管理股份有限公司
地址：郑州市郑东新区寿丰街50号凯利国际中心A座28楼
联系人：宋柯
联系方式：0371-******** 173*****070 　　　　　　　　　　
八监督部门
本招标项目的监督部门为河南中医药大学。
九联系方式
招 标 人：河南中医药大学
地 址：郑州市郑东新区金水东路156号
联 系 人：苏老师
电 话：037*****0556
电子邮件：/
招标代理机构：河南宏业建设管理股份有限公司
地 址： 郑州市郑东新区寿丰街50号凯利国际中心A座28楼
联 系 人： 宋柯
电 话： 173*****070
电子邮件： /
招标人或其招标代理机构主要负责人项目负责人： 签名

招标人或其招标代理机构： 盖章






河南中医药大学多组学测试化验采购项目仪器设备货物需求一览表
包号 项目名称 序号 技术参数及要求 数量
1
应用范围：主要用于国家重点研发计划益肾通络方干
预糖尿病肾脏疾病 3
期循证评价及疗效机制合作研究项目编号：2020YF
E*******课题的蛋白组学检测及分析服务
　
2 配置或系统组成 　
2.1
完成150个人样本的血清样本深度血液蛋白组学检测，
使用纳米石墨烯磁珠富集低丰度蛋白，并进行LC-
MS/MStimsTOFDDA模式建库分析，得到DDA
library数据库。对各样本分别进行LC-MS/MStimsTOF
DIA模式分析，并用商业版Spectronaut软件构建图谱
库并搜库，对定性定量蛋白进行统计分析和生物信息学
分析。
2.2
具备AB SCIEX质谱检测平台Thermo fisher QE-
系列质谱仪检测平台Bruker timsTOF Pro
4D质谱仪检测平台等三大质谱平台提供自有设备清单
并标明设备序列号，及现场图片。
150
2.3
具备ISO9001质量管理体系认证检验检测机构资质认
定证书中国合格评定国家认可委员会实验室认可证书
邓白氏注册认证企业的优先考虑。
3 技术参数
包1
标记定量蛋
白组学分析
项目
3.1
每例样品取一定量采用磁珠法进行低丰度蛋白富集。将
一定量血清加入一定量磁珠使用wash
buffer清洗过2遍中混匀孵育2h，置于磁力架上，将
血清去除后加入清洗试剂清洗，每遍颠倒混洗5min，重
复5遍。所有样品，采用溶液内方法进行胰蛋白酶酶解
。所有样品的肽段均使用C18
Cartridge进行脱盐，肽段冻干后加入20L
0.1%甲酸溶液复溶，
OD280测定样品的肽段浓度。每份样本取等量肽
段混合成一份Pool样品肽段进行RP分级。RP分级样品和
每个样品的酶解肽段中分别加入适量iRT标准肽段，分
布进行DDA质谱检测和 DIA质谱检测。
　
3.2
DDA分析采用纳升流速Evosep
one系统进行色谱分离(Denmark)，纳升级高效液相色谱
分离后的样品用timsTOF质谱仪Bruker进行DDA数
据依赖质谱分析。检测模式：正离子。质谱方法：电
压1500v,离子源温度180，干燥气3L/min，PASEF
cycles: 8，TIMS累积时间: 100ms，TIMS
range离子淌度: 0.75-
1.35Vs/cm2，MS和MSMS范围：100-
1700Da，动态排除时间：24s。
DIA分析采用纳升流速 Evosep
one系统进行色谱分离，纳升级高效液相色谱分离后的
样品用timsTOF2质谱仪Bruker进行DIA(数据非依赖
)质谱分析。检测模式：正离子，MS和MSMS质谱扫描。
范围：100-1700 m/z。MS2
采用DIA数据采集模式，设置4个TIMS
Scan采集窗口，每个窗口累积时间100ms。在PASEF模式
下，碰撞能量大小与离子淌度1/K0呈线性变化碎裂能
从20到59 eV对应
离子淌度1/K00.85到1.30Vs/cm 2。
　
3.3
DDA数据直接导入Spectronaut软件Spectronaut TM
16 构建 Spectral
Library。下载相应的swissport数据库。检索参数设置
如下：酶为trypsin，max miss cleavage
site为1，固定修饰为Carbamidomethyl(C)，动态修饰
设定为 Oxidation(M)和Acetyl(Protein N-
term)，数据库检索鉴定到
的蛋白必须通过设定的过滤参数FDR<1%。
DIA数据采用Spectronaut软件Spectronaut TM
16进行数据处理，数据库与建库所用数据库相同。
软件参数设置如下：retention time prediction type
设置为 dynamic iRT, interference on MS2 level
correction为enabled，cross run
normalization为enabled，所有结果必须通过设定的过
滤参数Q Value cutoff为0.01相当于FDR<1%。
3.4 对检测到的蛋白进行统计学分析和生物信息学分析 　
4 包装
4.1 数据包：R Version 3.4
5 其他要求 　
5.1 样品需要用纳米磁珠富集低丰度蛋白进行检测 　
5.2 对数据进行WGCNA和标志物数据研究分析
5.3
蛋白的提取5-10个工作日，低丰度蛋白的富集5-
10工作日，4D-DIA质谱检测10-
15个工作日，搜库和生信分析 8-12个工作日。
5.4 150例深度血液4D-DIA检测周期：40个工作日以内
5.5
6 技术服务 　
6.1
数据分析：
1.统计学分析：韦恩图PCA分析热图火山图箱
线图分析多组蛋白表达模式聚类
2.蛋白功能分析：亚细胞定位分析结构域分析GO功
能分析KEGG
通路分析蛋白互作网络分析表型与组学关联分析
WGCNA分析
3.质量控制：QC样本评价组间样本鉴定评价样本定
量波动评价DIA
体系评价色谱峰的平均数据点Peak capacity
峰容量iRT的保留时间Protein FDR
6.2 以拷盘形式交付数据，最终数据提供后，可继续免费保留数据3个月
6.3
售后及技术支持能够免费提供不限次数的评估后可实现
的售后生信分析指导服务，以达到符合项目结题及文章
发表之需求。
包号 项目名称 序号 技术参数及要求 数量
1
应用范围：主要用于国家重点研发计划益肾通络方干预糖
尿病肾脏疾病 3
期循证评价及疗效机制合作研究项目编号：2020YFE020
1800课题的全转录组数据分析服务
　
2 配置或系统组成 　
2.1
完成150份全转录组数据分析，结合150份蛋白数据做联合分
析。依据数据的兼容性，开展全转录组蛋白组代谢组学
数据联合分析。
2.2
具备专业的分析团队和项目分析经验，具有完备的硬件设施
及平台一(提供自有设备清单并标明设备序列号，及现场图
片)。
>20
2.3 具备ISO9001质量管理体系认证ISO*****环境管理体系认证和ISO*****职业健康安全管理体系认证的优先考虑。
3 技术参数
3.1
基本数据统计 去除接头序列低质量序列得到 reads
信息， 样品相关性， 表达量分布， RNA 分类
参考基因组比对
　
3.2 mRNA鉴定定量分析 　
3.3 mRNA差异表达分析聚类分析
3.4 云平台交付 　
4 包装
4.1 数据包
包2
转录组学
测序及分
析项目
5 其他要求 　
5.1 融合基因分析，仅限人，推荐数据量8Gb clean data 　
5.2
生信人员需要根据建库方法链特异
性文库/非链特异性文库，来设置正确的分析参数
5.3 150个样本数据完成，分析周期为20个工作日以内
6 技术服务 　
6.1
对于转录组 resequencing，首先，我们过滤掉低质量
reads接头污染以及未知碱基 N含量过高的 reads，获得
clean reads。再将 clean reads
比对到参考基因组上，之后进行差异可变剪接基因检测。然
后计算基因表达水平。最后，对于多个样品根据需求检测不
同样品之间的差异表达基因，并对差异表达基因做深入的聚
类分析和功能富集分析等
6.2 云平台交付数据
6.3
售后及技术支持能够免费提供不限次数的评估后可实现的售
后生信分析指导服务，以达到符合项目结题及文章发表之需
求。

联系人：郝工
电话：010-68960698
邮箱：1049263697@qq.com