我院医学检验中心是集医疗、教学、科研于一体的临床实验室诊断中心，现为福州市临床检验中心挂靠单位，福州市医学会检验学分会挂靠单位，2022年获批国家区域医疗中心福建省检验医学专科联盟副理事长单位。已形成门诊检验科、临床检验实验室、临床生化实验室、临床免疫实验室、临床分子诊断实验室、临床微生物实验室、辅助生殖系统检验实验室、“两癌”筛查实验室、脑脊液检测实验室九个亚专业实验室，拥有先进的检验设备，包括全自动生化分析仪、化学发光流水线、凝血功能检测流水线、全自动微生物质谱检测系统、全自动细菌鉴定药敏系统、全自动血培养仪、实时荧光定量PCR扩增仪、全自动时间分辨荧光免疫分析系统、多功能显微影像系统，已开展临床检验项目300余项。

科室拥有高素质人才梯队，总人数77人，其中高级职称15人，中级职称30人，初级职称32人，具有博士3人，硕士10人。近年来通过引进海内外人才，先后承担国家级、省市级科研项目10余项，发表学术论文50余篇。多次获得“优秀科室”称号。中心每年参加省部级室间质评，合格率达100%。