采购标段信息

公告内容

• 致病菌识别网菌株测序第三次询价采购公告

  嘉峪关市疾病预防控制中心现就致病菌识别网菌株测序进行第三次公开询价采购，欢迎具有相关资格的企业或供货商报名参加。

  一、招标编号：JYGCDC-2023-076

  二.供应商资格要求：

  1.企业法人营业执照（三证合一）副本扫描件；

  2.法定代表人身份证（正、反面复印件）；

  3.提供企业法人针对本次招标的授权函（原件）及被授权人身份证（正、反面复印件）；

  4.供应商具有质量管理体系认证证书ISO 9001:2015（通过认证范围：基因测序及生物信息学分析、DNA 合成、TA 克隆荧光定量 PCR、SNP 筛查的技术服务）；

  5.上述资质复印件必须加盖投标商公章。

  三、招标报名及竞价时间：

  1.招标报名：2023年11月17日10:30至2023年11月18日10:30

  2.资质审核：2023年11月18日10:30至2023年11月18日11:00

  3.竞价时间：2023年11月18日11:00至2023年11月18日13:00

  四、联系方式：

  招标单位：甘肃省嘉峪关市疾病预防控制中心

  地 址：甘肃省嘉峪关建设西路672号

  联 系 人：杨坤合

  联系电话：173*****689

  五.相关事宜

  1.本公告在甘肃省阳光采购平台上发布

  2.本次定标在所有资质和参数符合的条件下低价确定供应商（包括邮寄等费用 ）；

  3.报价单须有报价单位、联系人及电话，并加盖公章；

  4.中标后请与我中心检验科联系（巩芳芳0937-*******）；

  5.接到中标通知2个工作日之内签订协议，15个工作日内完成服务；

  6.交货地点为嘉峪关市疾控中心

  六、参数及数量

  序号	物品名称	规格/型号/参数	单位	数量	备注
  1	10株致病菌测序ont平台完成图	1、原始测序数据的质控;2、高质量数据获取;3、基因组序列拼装与分析;4、蛋白编码基因预测;5、质粒序列比对;6、非编码 RNA 预测;7、其他非编码RNA 预测;8、CRISPRs 预测;9、重复序列预测;10、原噬菌体预测;11、基因岛预测;12、致病菌毒力因子（VFDB）分析;13、抗生素抗性（CARD）分析;14、碳水化合物活性酶（CAZy）分析;15、信号肽预测;16、跨膜螺旋预测;17、蛋白编码基因的序列比对;18、蛋白编码基因的 GO 注释;19、蛋白编码基因的eggNOG 注释;20、蛋白编码基因的 KEGG 注释;21、蛋白编码基因的 Swiss-Prot 注释;22、Pfam注释;23、TCDB 注释;24、PHI 注释;25、基因组圈图绘制;26、MLST分析;	份	10	中标商测序数据按时交给嘉峪关市疾病预防控制中心，若中标商提供测序数据及分析不合格，中标商需免费再次测序，直到数据满意可以正常使用为止。
  2	61株致病菌测序框架图	1、原始测序数据的质控;2、高质量数据获取;3、基因组序列拼装与分析;4、蛋白编码基因预测 ;5、非编码 RNA 预测 ;6、其他非编码 RNA 预测 ;7、CRISPRs 预测 ;8、蛋白编码基因的序列比对;9、蛋白编码基因的 GO 注释 ;10、蛋白编码基因的 eggNOG 注释 ;11、蛋白编码基因的 KEGG 注释 ;12、蛋白编码基因的 Swiss-Prot 注释;13、致病菌毒力因子分析;14、抗生素抗性（CARD）分析;15、fusA基因;	份	61
  3	40份样品中真菌菌群分析（ITS扩增子测序）	一、测序数据预处理 1. 原始测序数据预处理 2.序列去噪或聚类 3.物种分类学注释 4.构建系统发育树5.ASV/OTU 表抽平 二、物种组成分析 1. 分类单元数统计 2.分类学组成分析 3.分类等级树图 4.GraPhlAn进化树图 5.Krona 物种组成图 三、Alpha 多样性分析1.Alpha 多样性指数 2.稀疏曲线 3.物种累积曲线 4. 丰度等级曲线 四、Beta 多样性分析 1.距离矩阵与PCoA 分析 2.NMDS 分析 3.UPGMA 聚类分析 4.组间距离显著性分析 5.Adonis 差异分析 五、物种差异分析与标志物种筛选 1.ASV/OTU 韦恩图或花瓣图2.物种组成热图 3.PCA 主成分分析4.MetagenomeSeq 分析 5.LEfSe 分析 6.OPLS-DA 分析 7.随机森林分析 六、关联网络分析 1.关联网络分析与展示 七、菌群代谢功能预测 1.PICRUSt2 分析2.功能单元 PCoA 分析 3.代谢通路统计 4.代谢通路差异分析 5.差异通路的物种组成	份	40

  嘉峪关市疾病预防控制中心

  2023年11月17日