一、办公室

协助区总社领导处理日常工作；拟定区总社主要工作计划、工作制度；负责机关及系统组织、党务、群团、干部人事、劳动工资、专业技术职务评聘、奖惩及评优创先、综合文字材料起草等工作；承担信息宣传、社务公开、对外接待、老干部、档案、保密等工作；负责扶贫、“三服务”、区人大代表建议、区政协委员提案的办理工作；负责机关安全、后勤保障；负责机关日常工作的协调和督办。

二、财务审计科

贯彻执行财政、税务、金融等有关政策法规，负责区总社部门预决算资金的编制和预算执行管理；负责编报系统财务会计报表，编写财务分析和趋势预测；指导系统财务、会计、审计工作和考核工作；负责社有全资、参控股企业的单位年度审计监督和其他专项审计调查；指导系统财会、内部审计和财务审计人员培训工作；组织系统“新网工程”及供销合作社改革发展专项资金申报和评审考核；负责区总社主管协会、学会等社团组织的财务监管和监督工作；承担机关日常财务管理工作。

三、合作指导科

负责拟定系统合作事业发展规划，负责基层供销社的改革、发展与经营绩效评价，协调相关政策以及与政府部门、社会组织的关系；负责推进新农村现代流通网络建设；负责指导系统合作社创新发展、组织建设和制度建设；参与实施农村社会化服务体系建设，组织指导基层社、综合服务社建设，发展农民专业合作社联合社、以农民为主体的综合性合作社、现代农业综合服务中心，发展农村合作金融服务；负责系统为农服务工作考核；负责系统农产品市场建设及产销对接、农产品经纪人队伍建设、防汛抗旱、扶贫开发、相关法律普及；负责系统秸秆综合利用等工作；组织指导合作社文化建设，负责中国供销合作社标识统一推广使用和规范管理工作。

四、资产管理科

负责拟定区级投资企业发展规划及年度工作计划并组织推进，促进企业转型升级，健全现代企业制度；协同承担区级投资项目的论证、建设和管理工作；负责区供销合作总社主管社团的筹建与管理工作；负责系统电子商务建设。拟订社有资产保值增值考核、激励和责任追究制度并负责监督落实；负责企业改革改制工作；承担区级社有产权、股权和债券的管理工作；拟订社有资产重组、整合的指导意见。协同推进再生资源回收利用工作。

五、社务管理科

负责指导参控股工业企业制定年度和中长期发展规划，服务基层社及社属企业改革改制。牵头负责本系统信访稳定工作。

六、监事会办公室

承担区总社监事会的日常工作。负责组织监事会的调查研究，了解并反映监事、系统服务对象对理事会工作的意见和建议；会同有关部门监督检查社有资产保值增值情况；指导基层社监事会工作，处理相关信访问题。

七、安全生产监督管理科

负责全系统安全监督管理，指导、督促全区供销合作系统农业生产资料、农副产品流通安全；指导、督促全区供销合作系统农业生产资料、农副产品流通安全的宣传、教育、培训工作；负责本级社有企业的安全监督管理。