三门峡市中心医院

12例二库全转录组建库测序分析采购公告

编号：采2024-20

一、采购单位名称：三门峡市中心医院

二、采购单位地址：湖滨区崤山路三门峡市中心医院

三、采购项目内容：12例二库全转录组建库测序分析

四、采购参数：

对在某个时期或者在某种环境条件下转录出来的mRNA、LncRNA、smallRNA、circRNA进行测序，而后进行比对、定量、基因表达水平差异分析、功能富集分析和全转录组的关联分析。

1. 样本类型和数量：

2. RNA提取：对样本进行TotalRNA提取，无污染无降解，RIN≥7。

3.测序平台及数据量：

（1） LncRNA文库

构建LncRNA文库，使用Illumina Novaseq平台，PE150，测序12G raw data。

（2） SmallRNA文库

构建SmallRNA文库，使用Illumina Novaseq平台，SE50，测序10M reads。

在总数据量达标的情况下，每个样本总数据量均大于承诺数据量，测序质量平均Q20≥90%，Q30≥85%

4. 生物信息学分析内容

（1）LncRNA文库分析内容

测序数据质控，序列比对拼接，lncRNA筛选，lncRNA、mRNA表达水平分析，lncRNA靶基因预测，差异lncRNA分析，差异mRNA分析，差异lncRNA靶基因GO/KEGG功能富集分析，差异基因GO/KEGG功能富集分析，可变剪切分析，SNP/InDel分析。

CircRNA鉴定注释，circRNA表达水平分析，差异circRNA分析，差异circRNA来源基因及GO/KEGG富集分析，miRNA结合位点分析，circRNA编码潜能预测。

（2）SmallRNA文库分析内容

测序数据质控，参考序列比对，已知miRNA鉴定，新miRNA预测和二级结构分析，miRNA表达量分析，miRNA家族分析，miRNA碱基编辑分析，样本间miRNA表达水平的相关性分析，miRNA差异表达分析和聚类分析，miRNA靶基因预测，差异表达miRNA靶基因的GO/KEGG富集分析。

（3）全转录组关联分析内容

WTS分析：lncRNA 与 mRNA 关联分析，lncRNA 与 miRNA 关联分析，miRNA 与 mRNA 关联分析，circRNA 与 mRNA 关联分析，circRNA 与 miRNA 关联分析，lncRNA、miRNA 与 mRNA 的调控网络，circRNA、miRNA 与 mRNA 的调控网络。

CeRNA分析：miRNA 与 mRNA 关联分析，miRNA 与 lncRNA 关联分析，miRNA 与 circRNA 关联分析，lncRNA、miRNA 与 mRNA 的调控网络，circRNA、miRNA 与 mRNA 的调控网络。

五、采购方式：竞争性谈判

六、控制价：3.5万元

七、报名企业需提供资质要求：

1、注册于中华人民共和国境内，具有独立承担民事责任能力的法人或其他组织提供营业执照（具有本次采购货物的经营或生产能力的制造商或代理商）。

2、如果报名企业代表为非企业法定代表人的，企业代表应执有企业法定代表人签字、盖章的授权书原件。

3、企业法定代表人或授权企业代表（非企业法定代表人的）有效身份证复印件。

4、根据《关于在政府采购活动中查询及使用信用记录有关问题的通知》(财库[2016]125号)的规定，对列入失信被执行人、重大税收违法案件当事人名单、政府采购严重违法失信行为记录名单的单位，拒绝参与本项目政府采购活动【查询渠道：“信用中国”网站（www.creditchina.gov.cn）、中国政府采购网（www.ccgp.gov.cn）】。

5、供应商需出具在中国裁判文书网的无行贿证明查询结果截图或自行承诺（查询对象：企业、法定代表人）。

6、潜在投标人（法人或委托人）须提供依法缴纳社会保障资金的良好记录（提供公告发布之日以前连续六个月的缴纳社会保障资金的证明）。个体户除外

7、本项目不接受联合体投标。注：以上证书或资格证明文件提供复印件，必须加盖谈判企业人公章并注明“与原件一致”。

8、本项目执行优先采购节能环保、环境标志性产品，扶持不发达地区和少数民族地区，促进中小企业、监狱企业、残疾人福利性企业发展等。

9、企业报名后，不能参加开标，需提前三天告知综合采购办公室，如无故不参加开标的，将该企业拉入黑名单。

备注：报名资料按照公告资质序号排序整理，写明投标人姓名、电话、邮箱，使用抽杆文件夹报送。

七、报名时间: 2024年3月12日至 2024 年3月18日（工作日）

八、报名地点：三门峡市眼科医院综合采购办（3号楼2楼综合采购办）

九、磋商时间：2023年3月26日下午15:00

磋商地点：眼科医院3号楼2楼采购办会议室

十、发布公告的媒体：《三门峡市中心医院网站》

联系电话： 183*****081 （王老师）

综合采购办公室

2024年3月11日