一、项目信息

项目名称：油茶SSR测序检测与分析

项目编号：620*****890******
项目联系人及联系方式： 油茶所 158*****993

报价起止时间：2024-07-09 10:33 - 2024-07-12 10:33

采购单位：湖南省林业科学院

供应商规模要求： -

供应商资质要求： -

供应商基本要求：满足湖南省政府采购电子卖场管理办法的供应商

二、采购需求清单

附件： 油茶SSR测序检测与分析.doc

响应附件要求：1. 使用FastQC软件进行数据量统计和质量评估；
2. 分型结果统计（基于扩增滑移和不同长度多态扩增效率校正后的数据），每个样本每个SSR位点各重复数对应的 reads 数量，不同基因型之间的相对比例，不同基因型之间的绝对比例；
3. 进行遗传多样性分析，包括：HWE检验、观测等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度、香农信息指数、多态性信息量；同时提供POPGENE和GenAlEx（二倍体），以及SPAGeDi（二倍体及多倍体）软件对应格式的输入文件；
4. 对样本进行遗传距离计算，计算亚种群间的遗传距离。根据结果使用NJ、FastME、UPGMA等方法构建进化树，利用R包ggtree进行绘图（高级分析）；
5. 采用Structure软件进行群体结构估计（高级分析）；
6. PCoA分析（高级分析）；
7. 采用R包poppr进行AMOVA分析（高级分析）；
8. 采用Treemix软件进行基因流分析。（高级分析）；
9. 核心种质构建、关联分析。

三、收货信息

送货方式: 送货上门

送货时间: 工作日09:00至17:00

送货期限: 竞价成交后7个工作日内

送货地址： 湖南省 长沙市 天心区 文源街道 韶山南路658号湖南省林业科学院

送货备注： -

四、商务要求