我所因开展课题工作的需要，拟委托具有高通量测序资质的单位为我单位开展“中华蛸对弧菌感染的免疫反应”项目（项目编号：2023N0045）提供测序服务。按照政府采购的相关规定，现进行公开询价招标，欢迎有意愿且符合条件的单位报价投标。

　　一、资质要求

　　具有GB/T *****-2016/ISO9001:2015的资质认证。

　　二、委托服务期限

　　委托合同生效且样本合格后，15个工作日内完成测序及质控分析，提供合格的质控报告后，以单宗计费方式一并结算费用。

　　三、委托内容

　　在服务期内承担本项目的测序相关工作，包括60个样品转录组测序和40个样品的miRNA测序，服务包括样品RNA的提取、文库构建、库检、illumina PE150测序6G，并按要求出具测序数据的质控报告以及流程分析结果，并能提供个性化分析服务；要求出具转录组和miRNA进行关联分析结题报告；要求转录组和miRNA都有线上云平台可进行线上操作分析。

　　分析内容需要涵盖：

　　1.数据质控：对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理

　　2.比对分析：比对核糖体序列、参考基因组（或其他参考序列）

　　3.基因分析：

　　1) 新基因鉴定

　　2) 基因类型统计

　　3) 基因覆盖度统计

　　4) 测序饱和度分析

　　5) 基因测序随机性分析

　　4.基因表达量统计（表达量计算，表达量丰度分布）

　　5.样本关系分析（基于表达量）

　　1) 主成分分析（PCA）

　　2) 相关性系数热图

　　6.组间差异分析

　　1) 差异基因整体统计

　　2) 差异比较火山图

　　3) 差异基因聚类热图

　　4) 差异基因GO富集分析

　　5) 差异基因KEGG富集分析

　　6) 差异基因DO富集分析

　　7) 差异基因Reactome富集分析

　　7.互作网络分析（PPI分析）

　　1) String数据库蛋白互作网络分析

　　2) 网络图绘制

　　8.GSEA分析 (Gene SetEnrichment Analysis)

　　9.趋势分析

　　10.InDel/SNP突变分析

　　11.基因可变剪切鉴定

　　12.内含子miRNA的reads分布

　　13.特定通路潜在受miRNA调控的靶基因分布

　　14.miRNA-mRNA调控网络

　　1) 两两比较组关联分析

　　2) 差异表达分析

　　3) miRNA-靶基因对筛选

　　4) cytoscape分析

　　5) miRNA靶向能力分析

　　6) 基因结合miRNA能力分析

　　7) miRNA靶基因功能富集分析

　　15.针对本项目提供转录组与miRNA关联分析，以及提供个性化分析服务支持

　　16.个性化分析包括根据材料与需求，协商确定定制化信息分析内容，协助至文章发表，对于文章投递过程中补充数据分析，能按要求进行数据分析并及时提供分析结果，对审稿人的疑问及时进行解答。

　　四、最高限价

　　本次招标费用最高限价为*****元。

　　五、评定办法

　　1.按照服务报价最低价中标原则确定受委托单位；

　　2.请有意向单位于2024年8月13日前向我所报价，报价包含税费、邮寄费，报价单、资质认证证书（复印件）应加盖单位公章，密封送达（可邮寄）我单位。

　　联系人：张建明 联系电话：0594-*******

　　传真：0594-******* 邮箱：15******635@163.com

　　单位名称：莆田市水产科学研究所

　　单位地址：福建省莆田市城厢区荔城南大道265号中国核建大楼

　　邮政编码：******