广西药用植物园关于“辅助决策知识库”开发服务项目采购的公告第二次公告

广西药用植物园关于“辅助决策知识库”开发服务项目采购的公告第二次公告

广西药用植物园关于“辅助决策知识库”开发服务项目采购的公告(第二次公告)

发布时间:2024年08月21日 来源:广西药用植物园

广西药用植物园关于“辅助决策知识库”开发服务项目采购的公告(第二次公告)

广西药用植物园因科研工作需要,拟对“辅助决策知识库”开发服务项目进行采购。于2024年8月13日发布了采购公告,但因递交响应文件的供应商不足三家,采购失败。现进行第二次采购公告(采购需求有调整),有关事项公告如下:

一、采购项目名称

“辅助决策知识库”开发服务项目

二、预算金额

38万元(含税)

三、采购需求主要内容

在指定的30个权威公开生物医学数据库获取所有数据信息,再将获取到的数据进行清理,整合,转换,最终通过数据库设计、存储与部署,创建形成新的辅助决策知识库,并且基于辅助决策知识库做生物信息学分析。项目在质保期内,若源数据库信息产生更新,则需同步更新至该辅助决策知识库。

四、具体需求参数

1.需要整合超过5万个基因/蛋白信息(包括基因信息,分子通路,分子功能以及蛋白相互作用关系);

2.超过5000个中药及分子信息(包括中药成分及靶点关系、中药毒理信息、中药肝损伤信息和中药代谢信息);

3.超过50万个西药/化合物及分子信息(包括西药及靶点关系、化合物及靶点关系,药物肝损伤和药物副作用信息);

4.超过2万个疾病表型及分子信息(包括疾病信息和疾病-基因关系);

5.需要结合实体抽取和关系抽取等自然语言处理技术,以及实体和概念对齐,实体映射等知识融合技术,实现生物医学知识的抽取,对齐和融合,形成数据库。

6.具体到各个源数据库包含的实体类型,关系类型以及数据量都有所差别,因此实际数据量无法确定,暂按每个数据库中能找到的数据及数量进行参考。

7. 响应时间:数据库查询响应时间≤5s;

8. 操作系统和硬件平台支持:确保数据库系统能够在不同的操作系统(包括Windows、Ubuntu和CentOS系统)和硬件平台上(CPU内核数量不小于4,内存不小于16G,存储不小于1T)运行。

9. 数据格式和接口兼容性:确保数据库能够处理各种数。据格式和接口,包括但不限于SQL标准、API接口等。

10. 数据库类型:结构化数据库MySQL,其中结构化数据存储到MySQL数据库,格式为.sql文件;非结构化数据以文本形式存储,格式为文本.txt等。

一级类别

二级类别

数据库

数据量(参考值)

基因/蛋白

基因信息

基因数据库NCBI Gene

*****个基因

分子通路/

分子功能

分子通路数据库KEGG

305个通路

分子功能标注数据库COG

4600个COGs

分子功能标注数据库GO

*****个GO条目

蛋白相互作用关系数据

蛋白互作数据库STRING11

****** PPIs(Score>700)

蛋白互作数据库BioGRID

8***** PPIs

蛋白互作数据库HI_union

***** PPIs

蛋白互作数据库IntAct

7600 PPIs

中药

中药、成分、靶点、疾病及其关系

中药分子信息数据库SymMap

658个中药、*****个成分、*****个靶点、*****个疾病以及它们之间的关系

中医药百科全书数据库ETCM

1800个草药,*****个成分,1040个靶点以及它们之间的关系

本草组鉴数据库HERB

6900个中药,*****个成分,*****个靶点以及它们之间的关系

中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP

449个中药,*****个成分,以及它们之间的关系

中药分子信息数据库TCMBank

8900个中药,*****个成分,*****个靶点以及它们之间的关系

中药分子靶点数据库HIT2.0

1100个中药,1100个成分,2000个靶点以及它们之间的关系

中药分子靶点数据库BATMAN

8300个中药,*****个成分,9500个蛋白以及它们之间的关系

中药毒理

中药系统毒理学数据库TCMSTD

242个中药,4100个成分,210个有毒成分,2300个靶点,以及它们之间的关系

中药肝损伤

药物性肝损伤专业数据库Hepatox

西药,中药和中成药共600余个

中药代谢

中药血液吸收成分及代谢物数据库DCABM-TCM

184个中药,1640个化合物以及它们之间的关系

西药/化合物

药物及靶点

药物靶点数据库DrugBank

5200个药物,2100个靶点以及它们之间的关系

药物靶标数据库TTD

*****个药物,3600个靶点以及它们之间的关系

配体受体数据库GLASS

51余万化合物靶点关系

药物分子靶标数据库BindingDB

5*****余化合物,2600余靶点以及它们之间的关系

化合物及靶点机制

化合物数据库ChEMBL

230余万化合物,*****余靶点以及它们之间的关系

比较毒物基因组库CTD

*****余化合物,*****余基因以及它们之间的关系

药物肝损伤

药物肝损伤数据库LiverTox

560个药物

药物副作用

药物副作用资源数据库SIDER

1000药物和920个疾病表型以及它们之间的关系

疾病/表型

疾病信息及分子机制

疾病分子信息数据库SympGAN

*****余疾病表型和*****余基因以及它们之间的40余万关系

疾病基因关系数据库DisGeNet

*****个疾病和8500个基因以及它们之间的13余万关系

疾病分子信息数据库OMIM

6200个疾病表型和*****个基因信息

疾病分子信息数据库MalaCards

*****个疾病及其基因信息

六、报价资料(文件名称格式请命名“辅助决策知识库”开发服务项目报价—司(xx万元),按顺序排版PDF,每页加盖公章)。

(一)封面:报价项目名称、报价公司、联系人及电话;

(二)营业执照副本扫描件(原件备查);

(三)公司法定代表人身份证明,授权委托人的授权委托书及身份证扫描件(原件备查)。企业信誉状况良好,自成立以来三年内无违法记录。

(四)开发服务内容及报价(含税)。

七、报价要求

报价时间:2024年8月21日起至8月26日12:00截止。

报价方式:网络邮箱报价。

邮箱:gxyyzwykybcg@163.com

联系人:0771-******* 马工

纪检监督电话:0771-******* 朱老师

八、其他说明

本次采购公告发布后,若满足采购要求的报价文件仍不足三家,将从符合采购要求报价的1或2家中以最低价中标的原则选定1个供应商。


广西壮族自治区药用植物园

2024年8月21日



联系人:郝工
电话:010-68960698
邮箱:1049263697@qq.com

标签: 开发服务 知识库 决策

0人觉得有用

招标
业主

-

关注我们可获得更多采购需求

关注
相关推荐
 
查看详情 免费咨询

最近搜索

热门搜索