茶叶转录组测序招标采购公告

茶叶转录组测序招标采购公告

项目名称 茶叶转录组测序招标 项目编号 EJWJ*******
公告开始日期 172*****66000 公告截止日期 172*****00000
采购单位 福建农林大学 付款方式 货到验收付款
联系人 中标后在我参与的项目中查看 联系电话 中标后在我参与的项目中查看
签约时间要求 成交后7日内 到货时间要求
预 算 *****.0
收货地址
供应商资质要求

符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件

采购商品 采购数量 计量单位 所属分类
茶叶转录组测序招标 1 农学研究服务
品牌
型号
品牌2
型号
品牌3
型号
预算 *****.0
技术参数及配置要求 1、完成28个茶叶样品RNA提取,每个样本3个重复,样品质检合格后进行常规转录组测序,illumina测序数据量6G,并进行生物信息学分析; 2、转录组分析内容如下: 2.1.数据质控:对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理 2.2比对分析:比对核糖体序列、参考基因组(或其他参考序列) 2.3. 基因分析: 1) 新基因鉴定 2) 基因类型统计 3) 基因覆盖度统计 4) 测序饱和度分析 5) 基因测序随机性分析 2.4. 基因表达量统计(表达量计算,表达量丰度分布) 2.5. 样本关系分析(基于表达量): 1) 主成分分析(PCA) 2) 相关性系数热图 2.6. 组间差异分析 : 1) 差异基因整体统计 2) 差异比较火山图 3) 差异基因聚类热图 4) 差异基因GO富集分析(富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图) 5) 差异基因KEGG富集分析(富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图) 6) 差异基因Reactome富集分析(富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图,仅限部分物种) 2.7. 互作网络分析(PPI分析) 1) String数据库蛋白互作网络分析 2) 网络图绘制 2.8. GSEA分析 (Gene Set Enrichment Analysis) 1) 基于GSEA的GO富集分析 2) 基于GSEA的KEGG富集分析 3) 基于GSEA的Reactome富集分析(仅限部分物种) 2.9. 趋势分析 2.10. 基因可变剪切鉴定 3. 技术要求 交付动态结题报告,数据可在云平台上进行在线分析 4.项目周期要求:30天。
售后服务

报价地址:https://www.yuncaitong.cn/publish/2024/09/27/20M1K6D74EI9T37A.shtml

联系人:郝工
电话:010-68960698
邮箱:1049263697@qq.com

标签: 茶叶 测序

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