茶叶转录组测序招标采购公告
茶叶转录组测序招标采购公告
项目名称 | 茶叶转录组测序招标 | 项目编号 | EJWJ******* |
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公告开始日期 | 172*****66000 | 公告截止日期 | 172*****00000 |
采购单位 | 福建农林大学 | 付款方式 | 货到验收付款 |
联系人 | 中标后在我参与的项目中查看 | 联系电话 | 中标后在我参与的项目中查看 |
签约时间要求 | 成交后7日内 | 到货时间要求 | 无 |
预 算 | *****.0 | ||
收货地址 | 无 | ||
供应商资质要求 | 符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商基本条件 |
采购商品 | 采购数量 | 计量单位 | 所属分类 |
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茶叶转录组测序招标 | 1 | 批 | 农学研究服务 |
品牌 | 无 |
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型号 | 无 |
品牌2 | 无 |
型号 | 无 |
品牌3 | 无 |
型号 | 无 |
预算 | *****.0 |
技术参数及配置要求 | 1、完成28个茶叶样品RNA提取,每个样本3个重复,样品质检合格后进行常规转录组测序,illumina测序数据量6G,并进行生物信息学分析; 2、转录组分析内容如下: 2.1.数据质控:对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理 2.2比对分析:比对核糖体序列、参考基因组(或其他参考序列) 2.3. 基因分析: 1) 新基因鉴定 2) 基因类型统计 3) 基因覆盖度统计 4) 测序饱和度分析 5) 基因测序随机性分析 2.4. 基因表达量统计(表达量计算,表达量丰度分布) 2.5. 样本关系分析(基于表达量): 1) 主成分分析(PCA) 2) 相关性系数热图 2.6. 组间差异分析 : 1) 差异基因整体统计 2) 差异比较火山图 3) 差异基因聚类热图 4) 差异基因GO富集分析(富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图) 5) 差异基因KEGG富集分析(富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图) 6) 差异基因Reactome富集分析(富集圈图、富集气泡图、柱形图绘制、差异富集气泡图、富集条形图,仅限部分物种) 2.7. 互作网络分析(PPI分析) 1) String数据库蛋白互作网络分析 2) 网络图绘制 2.8. GSEA分析 (Gene Set Enrichment Analysis) 1) 基于GSEA的GO富集分析 2) 基于GSEA的KEGG富集分析 3) 基于GSEA的Reactome富集分析(仅限部分物种) 2.9. 趋势分析 2.10. 基因可变剪切鉴定 3. 技术要求 交付动态结题报告,数据可在云平台上进行在线分析 4.项目周期要求:30天。 |
售后服务 | 无 |
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