高通量基因测序系统设备招标公告

高通量基因测序系统设备招标公告

河南中医学院因科研平台建设及科研实验需要,拟采购高通量基因测序系统设备,现将该产品的技术指标和功能进行公示。

公示期限从2016年12月1日起至2016年12月7日止。

请能够满足技术参数和功能要求的国内产品供应商及时联系,并对公示的内容是否有倾向性、歧视性、排他性等提出建议。请于公示期满后2个工作日内以实名书面(包括联系人、地址、联系电话)形式反馈至河南省财政厅政府采购监督管理处(联系电话:****-****************)和河南中医药大学(地址:郑东新区金水东路1号,联系人:岳静宇,联系电话:****-********)。

2016年11月30日

高通量基因测序系统


货物名称

技术参数及要求

备注

高通量基因测序系统

1

未知物种全基因组测序,已知物种再测序,全基因表达组定量分析,全基因组小RNA分析,染色质免疫互沉淀(ChIP)研究,转录组分析,扩增子测序,定向重测序

*2

高数据通量:每次反应可生成≥150亿(15G)碱基数据

*3

每次运行可生成可读≥25M个片段标签序列

4

可以在≤8.5小时内完成样品制备、测序和数据分析,用于快速鉴定

5

数据读长:单端读取序列,读长不低于300个碱基

*6

双端读取序列:读长不低于2*300个碱基

7

样品用量:DNA样本需1微克

*8

读取精度:当测序长度为2 *150bp时,≥80%以上的碱基数据质量高于Q30,当测序长度为2*250bp时,≥70%以上碱基数据质量高于Q30

9

可精确读取≥12个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAAAAAAA)

10

不同样品并行性:提供稳定成熟的96个样品的混合接头

11

可同时进行96个样品的1536重PCR产物的测序

12

测序结果给出严格的Q30的数据

*13

采用边合成边测序的测序原理,通过可逆终止子的方法,可以根据应用的需求控制测序片段的长度

14

无需进行油包水PCR反应

15

扩增、测序和数据分析服务器在同一台仪器上完成

16

提供简单优化的生物信息学支持软件:如新物种拼接,小RNA分析,扩增子分析,重测序,16S宏基因组分析,文库质量QC等

17

具有RFID(无线电射频识别)技术的耗材

*18.1

样品制备用细胞计数套件,具备非染色细胞死活状态及浓度的计数,计数后细胞可用于后续实验

*18.2.1

核酸片段制备套件,具备≥400K Hz频率超声传感器处理样本,超声探头与样品无接触,不同样本之间无需清洗

*18.2.2

核酸片段制备套件,超声输出功率2.5-500W可调,具备软件参数控制系统

*18.2.3

核酸片段制备套件,内置冷却系统,样品处理在等温下进行,无热损伤,提高样本回收率

*18.2.4

核酸片段制备套件,样品水浴带温度监控装置,能实时显示系统温度

*18.2.5

核算片段制备套件,样本质量<1000mg或体积<10ml,优化的技术操作规程,可剪切出200bp-3kb的DNA片段

*18.2.6

核酸片段手动取样器,系统误差≤±2.5%

*19

服务器主机要求:

CPU:≥2个Intel 8核Xeon处理器

内存:≥128G

硬盘:≥6×1T硬盘

数据RAID类型:RAID5

操作系统:≥CentOS 6.0或WIN7 64位英文版

*20

在线式延时≥12小时UPS电源

*21

质保期内出现因设备故障导致的试剂耗材损失,由厂家对试剂进行无条件等额赔付

22

配置

*22.1

二代测序仪(含测序仪一台,装机试剂盒一套,控制及分析软件一套,测序仪内置电脑一台,无线射频识别系统一个)

一套

*22.2

细胞计数套件(含10000个反应)

一台

*22.3

分析服务器

一台

*22.4

在线式延时12小时UPS电源

一台

*22.5

核酸片段制备套件

一台

*22.6

核酸片段手动取样器

三支


表3

政府采购进口产品专家论证意见

一、基本情况

申请单位

河南中医药大学

拟采购产品名称

高通量基因测序系统

拟采购产品金额

采购项目所属项目名称

河南中医学院中医药国际合作实验室项目

采购项目所属项目金额

二、申请理由

□1.中国境内无法获取:

□2.无法以合理的商业条件获取:

√3.其他。

原因阐述:

实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。

三、专家论证意见

第二代高通量基因测序系统数据处理量大,速度快,大大降低了测序成本,满足了科研和精准医疗诊断的应用。目前国内尚无设备的开发,建议购置进口产品。

工作单位:新乡医学院 联系电话:159*****109

专家签字:韩金红 副教授 2016年11月10日




表3

政府采购进口产品专家论证意见


一、基本情况

申请单位

河南中医药大学

拟采购产品名称

高通量基因测序系统

拟采购产品金额

采购项目所属项目名称

河南中医学院中医药国际合作实验室项目

采购项目所属项目金额

二、申请理由

□1.中国境内无法获取:

□2.无法以合理的商业条件获取:

√3.其他。

原因阐述:

实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。

三、专家论证意见

高通量基因测序仪具备双流动通道,支持高输出和快速排序方式,国内无相关一起,建议采购进口设备

工作单位:河南省疾病预防控制中心 联系电话:185*****996

专家签字:黄学勇 2016年11月10日



表3

政府采购进口产品专家论证意见


一、基本情况

申请单位

河南中医药大学

拟采购产品名称

高通量基因测序系统

拟采购产品金额

采购项目所属项目名称

河南中医学院中医药国际合作实验室项目

采购项目所属项目金额

二、申请理由

□1.中国境内无法获取:

□2.无法以合理的商业条件获取:

√3.其他。

原因阐述:

实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。

三、专家论证意见

高通量基因测序仪实现了高通量多样品测序,可同时进行96个样品的1536重PCR产物的测序,从样品制备到测序分析仅需9小时以内,国内设备无法满足,建议购买进口设备

工作单位:郑州大学 联系电话:138*****001

专家签字:范清堂 2016年11月10日



表3

政府采购进口产品专家论证意见


一、基本情况

申请单位

河南中医药大学

拟采购产品名称

高通量基因测序系统

拟采购产品金额

采购项目所属项目名称

河南中医学院中医药国际合作实验室项目

采购项目所属项目金额

二、申请理由

□1.中国境内无法获取:

□2.无法以合理的商业条件获取:

√3.其他。

原因阐述:

实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。

三、专家论证意见

高通量基因测序时间段,数据量大,应用范围广,双向读取长度可达300bp,国内设备不能满足要求,建议采购进口设备

工作单位:河南省农业科学院 联系电话:135*****666

专家签字:郅玉宝 2016年11月10日


表3

政府采购进口产品专家论证意见


一、基本情况

申请单位

河南中医药大学

拟采购产品名称

高通量基因测序系统

拟采购产品金额

采购项目所属项目名称

河南中医学院中医药国际合作实验室项目

采购项目所属项目金额

二、申请理由

□1.中国境内无法获取:

□2.无法以合理的商业条件获取:

√3.其他。

原因阐述:

实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。

三、专家论证意见

经对采购方提交的相关资料进行审核,并充分听取了采购方和其他专家的意见,本次采购符合我国相关法律、法规的规定。因该设备属于非限制性进口仪器,根据采购方的实际需求,可以采购进口设备。

工作单位:河南迪卡沃律师事务所 联系电话:136*****456

专家签字:刘中光 2016年11月10日




标签: 系统设备 基因测序 通量

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