高通量基因测序系统设备招标公告
高通量基因测序系统设备招标公告
河南中医学院因科研平台建设及科研实验需要,拟采购高通量基因测序系统设备,现将该产品的技术指标和功能进行公示。
公示期限从2016年12月1日起至2016年12月7日止。
请能够满足技术参数和功能要求的国内产品供应商及时联系,并对公示的内容是否有倾向性、歧视性、排他性等提出建议。请于公示期满后2个工作日内以实名书面(包括联系人、地址、联系电话)形式反馈至河南省财政厅政府采购监督管理处(联系电话:****-********;********)和河南中医药大学(地址:郑东新区金水东路1号,联系人:岳静宇,联系电话:****-********)。
2016年11月30日
高通量基因测序系统
货物名称 | 技术参数及要求 | 备注 | |
高通量基因测序系统 | 1 | 未知物种全基因组测序,已知物种再测序,全基因表达组定量分析,全基因组小RNA分析,染色质免疫互沉淀(ChIP)研究,转录组分析,扩增子测序,定向重测序 | |
*2 | 高数据通量:每次反应可生成≥150亿(15G)碱基数据 | ||
*3 | 每次运行可生成可读≥25M个片段标签序列 | ||
4 | 可以在≤8.5小时内完成样品制备、测序和数据分析,用于快速鉴定 | ||
5 | 数据读长:单端读取序列,读长不低于300个碱基 | ||
*6 | 双端读取序列:读长不低于2*300个碱基 | ||
7 | 样品用量:DNA样本需1微克 | ||
*8 | 读取精度:当测序长度为2 *150bp时,≥80%以上的碱基数据质量高于Q30,当测序长度为2*250bp时,≥70%以上碱基数据质量高于Q30 | ||
9 | 可精确读取≥12个的连续单个重复碱基(如AAAAAAAAAAAAAAA) | ||
10 | 不同样品并行性:提供稳定成熟的96个样品的混合接头 | ||
11 | 可同时进行96个样品的1536重PCR产物的测序 | ||
12 | 测序结果给出严格的Q30的数据 | ||
*13 | 采用边合成边测序的测序原理,通过可逆终止子的方法,可以根据应用的需求控制测序片段的长度 | ||
14 | 无需进行油包水PCR反应 | ||
15 | 扩增、测序和数据分析服务器在同一台仪器上完成 | ||
16 | 提供简单优化的生物信息学支持软件:如新物种拼接,小RNA分析,扩增子分析,重测序,16S宏基因组分析,文库质量QC等 | ||
17 | 具有RFID(无线电射频识别)技术的耗材 | ||
*18.1 | 样品制备用细胞计数套件,具备非染色细胞死活状态及浓度的计数,计数后细胞可用于后续实验 | ||
*18.2.1 | 核酸片段制备套件,具备≥400K Hz频率超声传感器处理样本,超声探头与样品无接触,不同样本之间无需清洗 | ||
*18.2.2 | 核酸片段制备套件,超声输出功率2.5-500W可调,具备软件参数控制系统 | ||
*18.2.3 | 核酸片段制备套件,内置冷却系统,样品处理在等温下进行,无热损伤,提高样本回收率 | ||
*18.2.4 | 核酸片段制备套件,样品水浴带温度监控装置,能实时显示系统温度 | ||
*18.2.5 | 核算片段制备套件,样本质量<1000mg或体积<10ml,优化的技术操作规程,可剪切出200bp-3kb的DNA片段 | ||
*18.2.6 | 核酸片段手动取样器,系统误差≤±2.5% | ||
*19 | 服务器主机要求: CPU:≥2个Intel 8核Xeon处理器 内存:≥128G 硬盘:≥6×1T硬盘 数据RAID类型:RAID5 操作系统:≥CentOS 6.0或WIN7 64位英文版 | ||
*20 | 在线式延时≥12小时UPS电源 | ||
*21 | 质保期内出现因设备故障导致的试剂耗材损失,由厂家对试剂进行无条件等额赔付 | ||
22 | 配置 | ||
*22.1 | 二代测序仪(含测序仪一台,装机试剂盒一套,控制及分析软件一套,测序仪内置电脑一台,无线射频识别系统一个) | 一套 | |
*22.2 | 细胞计数套件(含10000个反应) | 一台 | |
*22.3 | 分析服务器 | 一台 | |
*22.4 | 在线式延时12小时UPS电源 | 一台 | |
*22.5 | 核酸片段制备套件 | 一台 | |
*22.6 | 核酸片段手动取样器 | 三支 |
表3
政府采购进口产品专家论证意见
一、基本情况 | |
申请单位 | 河南中医药大学 |
拟采购产品名称 | 高通量基因测序系统 |
拟采购产品金额 | |
采购项目所属项目名称 | 河南中医学院中医药国际合作实验室项目 |
采购项目所属项目金额 | |
二、申请理由 | |
□1.中国境内无法获取: | |
□2.无法以合理的商业条件获取: | |
√3.其他。 | |
原因阐述: 实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。 | |
三、专家论证意见 | |
第二代高通量基因测序系统数据处理量大,速度快,大大降低了测序成本,满足了科研和精准医疗诊断的应用。目前国内尚无设备的开发,建议购置进口产品。 工作单位:新乡医学院 联系电话:159*****109 专家签字:韩金红 副教授 2016年11月10日 |
表3
政府采购进口产品专家论证意见
一、基本情况 | |
申请单位 | 河南中医药大学 |
拟采购产品名称 | 高通量基因测序系统 |
拟采购产品金额 | |
采购项目所属项目名称 | 河南中医学院中医药国际合作实验室项目 |
采购项目所属项目金额 | |
二、申请理由 | |
□1.中国境内无法获取: | |
□2.无法以合理的商业条件获取: | |
√3.其他。 | |
原因阐述: 实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。 | |
三、专家论证意见 | |
高通量基因测序仪具备双流动通道,支持高输出和快速排序方式,国内无相关一起,建议采购进口设备 工作单位:河南省疾病预防控制中心 联系电话:185*****996 专家签字:黄学勇 2016年11月10日 |
表3
政府采购进口产品专家论证意见
一、基本情况 | |
申请单位 | 河南中医药大学 |
拟采购产品名称 | 高通量基因测序系统 |
拟采购产品金额 | |
采购项目所属项目名称 | 河南中医学院中医药国际合作实验室项目 |
采购项目所属项目金额 | |
二、申请理由 | |
□1.中国境内无法获取: | |
□2.无法以合理的商业条件获取: | |
√3.其他。 | |
原因阐述: 实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。 | |
三、专家论证意见 | |
高通量基因测序仪实现了高通量多样品测序,可同时进行96个样品的1536重PCR产物的测序,从样品制备到测序分析仅需9小时以内,国内设备无法满足,建议购买进口设备 工作单位:郑州大学 联系电话:138*****001 专家签字:范清堂 2016年11月10日 |
表3
政府采购进口产品专家论证意见
一、基本情况 | |
申请单位 | 河南中医药大学 |
拟采购产品名称 | 高通量基因测序系统 |
拟采购产品金额 | |
采购项目所属项目名称 | 河南中医学院中医药国际合作实验室项目 |
采购项目所属项目金额 | |
二、申请理由 | |
□1.中国境内无法获取: | |
□2.无法以合理的商业条件获取: | |
√3.其他。 | |
原因阐述: 实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。 | |
三、专家论证意见 | |
高通量基因测序时间段,数据量大,应用范围广,双向读取长度可达300bp,国内设备不能满足要求,建议采购进口设备 工作单位:河南省农业科学院 联系电话:135*****666 专家签字:郅玉宝 2016年11月10日 |
表3
政府采购进口产品专家论证意见
一、基本情况 | |
申请单位 | 河南中医药大学 |
拟采购产品名称 | 高通量基因测序系统 |
拟采购产品金额 | |
采购项目所属项目名称 | 河南中医学院中医药国际合作实验室项目 |
采购项目所属项目金额 | |
二、申请理由 | |
□1.中国境内无法获取: | |
□2.无法以合理的商业条件获取: | |
√3.其他。 | |
原因阐述: 实验室为河南省病毒性疾病中医药防治重点实验室,是高层次人才培养和高水平科研基地。病毒变异能力强,容易产生耐药基因突变,中药对调节机体免疫功能、抗病毒方面有很大潜力,在研究上需对大量标本进行测序,第一代测序仪通量低,无法进行大量的平行测序。第二代高通量基因测序系统在读取精度达到Q30标准下降低了单个样本的成本,并且9小时内可完成样品制备、测序和数据分析,每次反应可生成≥150亿碱基数据,实验过程无需对样品细胞进行染色即可计数,具备精确控温的核酸片段打断套件提高实验效率,高性能服务器可高效完成对分子生物信息学的处理,配套试剂完善。目前国内尚无此类设备,需购买进口设备。 | |
三、专家论证意见 | |
经对采购方提交的相关资料进行审核,并充分听取了采购方和其他专家的意见,本次采购符合我国相关法律、法规的规定。因该设备属于非限制性进口仪器,根据采购方的实际需求,可以采购进口设备。 工作单位:河南迪卡沃律师事务所 联系电话:136*****456 专家签字:刘中光 2016年11月10日 |
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