国家重点专项——口腔癌测序等多组学检测招标公告
国家重点专项——口腔癌测序等多组学检测招标公告
项目背景 我单位（上海交通大学医学院附属第九人民医院）因国家重点专项项目实施需要，拟对200例样本（癌与癌旁组织）进行全外显子测序，120例样本（癌与癌旁）进行简化甲基化测序，120例样本（癌与癌旁）进行小RNA测序。现公开征询供应商。本单位将根据公开、公平、公正原则，产品性价比、客户评价和售后服务质量相结合的方式，选择最合适的供应商。 应标人要求和材料 一、依法注册经营，财务独立，运作合法，具备独立法人资格。 二、具有相应的经营、代理（经销）资质和履行合同所需的技术、销售、服务资质。有承担国家重点项目肿瘤组织多组学检测和分析丰富经验。 三、须注册资金1000 万人民币及以上。 四、信誉度良好、无违法违纪记录，银行资信良好。 五、投标时需提交的材料： 1. 公司介绍； 2. 应征方案； 3.投标报价； 4.公司营业执照复印件； 5.法人授权函，被授权人身份证； 6. 联系方式等资料并加盖公章； 7. 售后服务等内容； 8．投标人认为必要的其他资质文件。 以上材料资料密封后送交我单位相关负责人邮箱。 联系人: 叶冬霞 联系电话： ******** 邮箱: iadr_sh@sina.com 地址: 上海市制造局路639号，8号楼413室 截止日期： 2017年8月23日17:00（以实际送达日或邮局邮戳日期为准）。截止日期后本单位概不受理。 附： 招标内容、主要技术指标及要求 1.样品前处理 对400个组织样品进行DNA/RNA抽提、纯化与测序前的保存。所有材料需制备两份相同的样品并妥善保存，以便招标方进行后续验证。 2.测序 本项目中200例样品中，400份做测序100X深度（不低于10Gb的raw data）的全外显子测序，240份做小RNA-seq和RRBS，使用Illumina测序平台，要求Q30>85%，Q20>95%。 3.提供针对本项目的数据结果答疑、数据修订、数据补充等技术及相关培训。 4.对于本项目其他的个性化需求及未尽事宜，能积极配合。 5.赔偿条款：中标后，应标公司必须在标书的报价下完成测试。如中标公司无法顺利完成测试服务（由中标方过失导致数据量缺失>5%），我方有权向中标方索取标的金额的110%作为违约赔偿。这一条款将会写入最终的合同。因此，请各招标公司在力所能及的情况下报价。 投标报价 1.报价依据 报价方法为综合单价法（包括检测价格、服务费、管理费及税金所有费用），投标单位根据国家有关的收费规定，参照行业收费标准及测序市场价，以及其他有关收费标准等，提出具体报价金额，并列出具体金额（含税费）及优惠条件。 2．投标控制价 按投标单价*此次招标预估例数=投标总价，如投标总价超出国家重点专项经费预算，作废标处理。（具体预算额度详见附件） 3.单价及总价 请各应标公司以测序费用报价。评标方法采用综合评估法，招标方将综合考虑投标报价及应标方提供的服务后，择优选择合作伙伴。 中标后，综合单价固定，根据实际检测项目数结算。 口腔癌组织测序等多组学检测招标说明 陈万涛课题组主持了国家重点研发计划“精准医学研究”2016年度项目《口腔癌分子分型和精准预防诊治标志物的研究》，项目编号：2016YFC*******。课题实施中需要对大样本口腔鳞癌组织和正常对照组织进行全基因组外显子测序、甲基化检测、微小RNA测序等检。 其中，外显子测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法，可以查找基因的位点突变、缺失或者插入等形状。 微小RNA是一类重要的体内调节分子，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是诱导基因沉默，参与基因转录后调控，从而调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。小RNA测序技术采用胶分离技术，收集样品中18-30nt的RNA片段，利用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息，依托强大的生物信息分析平台，鉴定已知小RNA，并预测新的小RNA及其靶标基因。 简化甲基化测序是一种准确、高效、经济的DNA甲基化研究方法，通过酶切富集启动子及CpG岛区域，并进行Bisulfite测序，同时实现DNA甲基化状态检测的高分辨率和测序数据的高利用率。DNA甲基化研究一直是疾病研究的热点，与基因表达、表型性状息息相关。上述检测项目是课题完成的基础。 投标报价一览表
此次招标控制价为 元，超过控制价按废标处理。 |
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