第一包华大基因测序专有仪器设备招标公告
第一包华大基因测序专有仪器设备招标公告
玉溪农业职业技术学院、云南云投职教扶贫开发玉溪农业职业技术学院有限责任公司拟申请单一来源采购“玉溪华大高原特色现代农业基因测序中心仪器设备采购项目-第一包华大基因测序专有仪器设备采购项目”的公示
玉溪农业职业技术学院、云南云投职教扶贫开发玉溪农业职业技术学院有限责任公司拟申请单一来源采购“玉溪华大高原特色现代农业基因测序中心仪器设备采购项目-第一包华大基因测序专有仪器设备采购项目”。现将有关情况公示如下:
一、拟单一来源采购项目名称、以及采购内容及要求、预算
(一)项目名称:玉溪华大高原特色现代农业基因测序中心仪器设备采购项目-第一包华大基因测序专有仪器设备采购项目;
(二)采购内容及要求:1. 高通量测序仪(1台)。
生产厂家:武汉华大智造科技有限公司型号:MGISEQ-2000RS
高通量测序仪采购预算:人民币贰佰肆拾贰万伍仟元整(¥*******.00)。
高通量测序技术(High-throughput sequencing)以能一次并行对几千万到上亿条DNA分子进行序列测定。同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deep sequencing)。科学界也开始越来越多地应用第二代测序技术来解决生物学问题。比如在基因组水平上对还没有参考序列的物种进行从头测序(de novo sequencing),并利用生物信息学方法将测序序列进行拼接、组装获得该物种的参考序列,为本单位后续功能基因组研究和分子育种奠定基础;对有参考序列的物种,进行全基因组重测序(resequencing),在全基因组水平上扫描并检测突变位点,发现个体差异的分子基础。该高通量测序仪系统在以上研究上具有重要意义,在本单位尚未购置此类高通量测序仪系统,经过相关科研人员对于研究内容、研究方法、研究目标的讨论,我们急需购置一套高通量测序仪系统。
2.病原整体解决方案(1套)。
生产厂家:武汉华大智造科技有限公司 型号:BGISEQ-50RS+病原感染快速鉴定系统(简称PFI)软件(含服务器HP Z840)
病原整体解决方案采购预算:人民币壹佰壹拾捌万元整(¥*******.00)。
病原整体解决方案包含病原感染快速鉴定系统(简称PFI)软件(含服务器HP Z840)以及基因测序仪BGISEQ-50RS。可从宏基因组/宏转录组水平上对原始样本中的微生物核酸序列进行快速、准确、全面的鉴定,并自动生成鉴定报告及分析结果。可针对不明原因的感染进行广谱的病原微生物筛查,为感染性疾病的诊疗提供帮助和借鉴。其中软件包含分析流程和微生物数据库,原始样本无需分离培养,无需经验预判,一次可鉴定多达9881种微生物,整套系统可做到从核酸到报告的一站式服务。
3.自动化样本制备系统(1台)。
生产厂家:武汉华大智造科技有限公司 型号:MGISP-100RS
自动化样本制备系统采购预算:人民币肆拾捌万元整(¥480000.00)。
自动化样本制备系统,能够提高工作效率,有效降低人力成本,为临床或科研工作者提供基因测序领域的一站式平台。
该款产品相比其他竞品,更加专注于基因测序领域,整合了实验过程中的各类仪器,能够提供完整的解决方案,包括试剂和操作软件。此外,能够节约二次研发所需的时间和开发成本。该产品整合了移液器、PCR仪、磁力架和温控设备等,集成了文库构建过程中的各类仪器,可以完成核酸提取及纯化、PCR文库的构建和纯化、文库混合、DNB制备等功能,一站式操作,自动化程度高。此外,该产品通过内置高效过滤系统和紫外消毒灯,能够有效保障实验内环境的清洁,避免污物累积。
(三)采购总预算:人民币肆佰零捌万伍仟元整(¥*******.00元)。
二、项目申请原因、理由及相关说明
1. 高通量测序仪:
武汉华大智造科技有限公司生产的MGISEQ-2000RS采用联合探针锚定聚合技术(Combinatorial Probe Anchor Systhensis,授权公告号:US********1B2;US********5B2;US********5B2)和DNBSeqTM(DNA纳米球核心测序技术,授权公告号:C N ********7 B;C N ******** B;C N ********3 B)的下一代高通量测序平台(Next generation Sequencer)。
核心技术:目前市面上的下一代高通量测序平台最核心的荧光信号采集单元技术分为DNA 纳米球和DNA分子簇两种技术,MGISEQ-2000RS测序仪的DNBSeqTM技术是唯一采用DNA纳米球结构作为荧光信号采集单元的测序仪(DNA纳米球技术为华大智造的专利技术),DNA纳米球技术相比DNA分子簇技术(1%)大大降低了index hoping率(0.0001~0.0004%),超低水平的indexhopping ratio是我们进行转录组学、超低频体细胞突变、微量病原微生物检测等研究准确性的基础保障。另外DNA纳米球是采用了Rolling Circle Amplification技术(RCA滚环扩增技术)进行线性扩增得到的,其大大减少其他公司的测序平台采用的 Bridge PCR等指数扩增方式带来的PCR Bias和Error,最终通过该平台独有的联合探针锚定聚合技术对规则阵列(Patterned Array,授予公告号:US********7 B2)的芯片上的纳米球进行大规模平行测序,因此MGISEQ-2000RS(结合PCR-free建库技术)是世界上仅有做到了0 PCR错误累积率的下一代高通量测序平台,这对于我们研究基因组GC含量异常物种至关重要。
数据质量: MGISEQ-2000RS测序系统承诺所有读长模式下,标准品的Q30均大于85%,这一点其他品牌均无法承诺,优秀的数据质量是实验结果高准确性的基础保证。鉴于本单位采购测序仪主要是动植物基因组研究,涉及项目多为动植物基因组重测序,要求测序仪通量较高,例如人基因组大小为3G,标准30X的深度,测序数据最少为90G。鉴于运行成本及人工操作成本,单次至少两到四个样本数据量要求至少300G。国产基因测序仪的通量除MGISEQ-2000RS外最大通量为安诺优达和贝瑞和康的NEXTSEQ550(参考illumina的nextseq500)单次运行通量最大为180G,无法满足我们科研实验需求,而MGISEQ-2000RS单次运行最大可产生900G以上的数据,符合我们的研究需求。
环境要求和使用成本:MGISEQ-2000RS测序系统仪器可适应海拔的极限值是3000米(0~3000),其他品牌的仪器极限值均不大于2000米(650英尺)(0~2000),这使得该测序系统拥有更强的应对气压变化、稳定测序生化反应的能力,对实验室环境适应能力较强,鉴于云贵高原的特殊环境以及避免选择其他设备对后期实验室改造造成的额外费用支出,我们选择采购MGISEQ-2000RS。并且MGISEQ-2000RS测序系统配套使用的实验试剂和耗材都已完全实现国产化,测序使用成本较进口产品大大降低。在本次预算范围内,MGISEQ-2000RS是国内仅有可以将测定10亿个碱基序列(1G数据量)的测序试剂成本控制在10美元以内的仪器,这对于我校来说超低的试剂成本是至关重要的因素。
基因测序仪属于高端制造、精密设备,目前国内仅有武汉华大智造科技有限公司具备批量生产能力且具有完全自主知识产权,武汉华大智造生产的MGISEQ-2000RS测序仪可在测序质量、测序通量、测序成本满足我们基础科研、检测需求的测序仪器。
综合上述的科研需求,根据调研结果,所以需要单一来源采购MGISEQ-2000RS。
2. 病原整体解决方案:
武汉华大智造科技有限公司生产的BGISEQ-50RS采用联合探针锚定聚合技术(Combinatorial Probe Anchor Systhensis,授权公告号:US********1B2;US********5B2;US********5B2)和DNBSeqTM(DNA纳米球核心测序技术,授权公告号:C N ********7 B;C N ******** B;C N ********3 B)的下一代高通量测序平台(Next generation Sequencer)。
核心技术:目前市面上的下一代高通量测序平台最核心的荧光信号采集单元技术分为DNA 纳米球和DNA分子簇两种技术,BGISEQ-50RS测序仪的DNBSeqTM技术是唯一采用DNA纳米球结构作为荧光信号采集单元的测序仪(DNA纳米球技术为华大智造的专利技术),DNA纳米球技术相比DNA分子簇技术(1%)大大降低了indexhoping率(0.0001~0.0004%),超低水平的index hopping ratio是我们进行转录组学、超低频体细胞突变、微量病原微生物检测等研究准确性的基础保障。另外DNA纳米球是采用了RollingCircle Amplification技术(RCA滚环扩增技术)进行线性扩增得到的,其大大减少其他公司的测序平台采用的 Bridge PCR等指数扩增方式带来的PCRBias和Error,最终通过该平台独有的联合探针锚定聚合技术对规则阵列(Patterned Array,授予公告号:US********7 B2)的芯片上的纳米球进行大规模平行测序,因此BGISEQ-50RS(结合PCR-free建库技术)是世界上仅有做到了0PCR错误累积率的下一代高通量测序平台,这对于我们研究基因组GC含量异常物种至关重要。
环境要求和使用成本:BGISEQ-50RS测序系统仪器可适应海拔的极限值是3000米(0~3000),其他品牌的仪器极限值均不大于2000米(650英尺)(0~2000),这使得该测序系统拥有更强的应对气压变化、稳定测序生化反应的能力,对实验室环境适应能力较强,鉴于云贵高原的特殊环境以及避免选择其他设备对后期实验室改造造成的额外费用支出,我们选择采购BGISEQ-50RS。并且BGISEQ-50RS测序系统配套使用的实验试剂和耗材都已完全实现国产化,测序使用成本较进口产品大大降低。
病原整体解决方案可从宏基因组/宏转录组水平上对原始样本中的微生物核酸序列进行快速、准确、全面的鉴定,并自动生成鉴定报告及分析结果。病原快速鉴定系统软件PFI(含服务器HP Z840)包含分析流程和微生物数据库,原始样本无需分离培养,无需经验预判,测序数据直接出报告,一次可鉴定多达9881种微生物。整套系统可做到从核酸到报告的一站式服务,对操作单位生物信息分析能力要求低,现国内没有其他厂家有相对应的产品。
综合上述的科研需求,根据调研结果,所以需要单一来源采购病原整体解决方案一套。
3. 自动化样本制备系统:
MGISP-100RS自动化样本制备系统是—款专注于二代测序领域的自动化工作站。采用自动化的流程设计,可对样本进行批立处理,省去人工实验的繁琐重要操作,提高NGS文库制备的稳定性,降低总成本,全面提升实验室整体工作效率。
自动化样本制备系统MGISP-100RS,可替代人工完成核酸提取、PCR反应、文库构建等—系列实验操作。能够提高工作效率,有效降低人力成本,为临床或科研工作者提供基因测序领域的一站式平台,该款产品相比其他竞品,更加专注于基因测序领域,整合了实验过程中的各类仪器,能够提供完整的解决方案,包括试剂和操作软件。
此外,能够节约二次研发所需的时间和开发成本。该产品整合了8通道移液器、PCR仪、磁力架和温控设备等,集成了文库构建过程中的各类仪器,可以完成核酸提取及纯化、PCR文库的构建和纯化、文库混合、DNB制备等功能,一站式操作,自动化程度高。复杂建库步骤一站式解决,无需实验人员过多干预,降低出错几率;多种已验证的配套试剂和分析软件,提供完整的解决方案。此外,该产品通过内置高效过滤系统和紫外消毒灯,能够有效保障实验内环境的清洁,避免污物累积。
综上原因,根据《云南省财政厅关于加强省级政府采购项目单一来源采购管理的通知》(云财采〔2018〕18号),“只能由特定供应商制造或者提供货物和服务,且不存在任何其他合理的选择或替代情况的其他情况。”相关规定,此次采购符合《云南省财政厅关于加强省级政府采购项目单一来源采购管理的通知》(云财采〔2018〕18号)第二条第(一)款第7项所规定的相关要求;另外,为满足云贵高原特色实验室环境要求,避免后期实验室改造造成的额外费用支出,节约财政开资。拟申请单一来源采购方式采购该项目。
三、拟定的唯一供货商名称、地址
(一)公司名称:武汉华大智造科技有限公司
(二)公司地址:武汉市东湖新技术开发区高新二路388号武汉光谷国际生物医药企业加速器3.1期24栋
四、专家论证意见
姓 名 | 工作单位 | 职称 |
刘艳 | 玉溪市中医医院 | 副主任技师 |
马红银 | 玉溪市第二人民医院 | 高级 |
杨忠保 | 玉溪市公安局刑科所 | 副主任法医师 |
逄涛 | 云南省烟草农业科学研究院 | 副高 |
李旭东 | 玉溪市疾病预防控制中心 | 副主任医师 |
2019年01月17日14:30时,召开论证会议,专家的论证意见:
武汉华大智造科技有限公司生产的MGISEQ-2000RS高通量测序仪为国内唯一采用DNA纳米球结构作为荧光信号采集单元的测序仪,且单次运行最大可产生900G的数据,其他国产测序仪的单次运行质量最大仅为180G,不能满足采购单位的需求。BGISEQ-50RS+病原整体解决方案可完成9000种微生物鉴定。MGISEQ-2000RS、BGISEQ-50RS+能够满足云贵高原的特殊实验环境。MGISP-100RS自动化样品制备系统可自动完成二代测序样品制备(包括核酸提取、PCR反应、文库构建等),在国内同类设备中自动化程度最高。
目前国内只有武汉华大智造科技有限公司生产的相关产品能够满足玉溪农业职业技术学院的科研需求。
根据上述论据,此次采购适用《云南省财政厅关于加强省级政府采购项目单一来源采购管理的通知》(云财采〔2018〕18号)第二条第(一)款第 7 项“只能由特定供应商制造或者提供货物和服务,且不存在任何其他合理的选择或替代情况的其他情况”规定。
专家组一致建议采用单一来源方式进行采购。
现予公示五个工作日,如有异议,请异议方在公示期内将阐明详细理由的经法定代表人签字并加盖单位公章的书面异议函(原件)及加盖单位公章的相关依据和证明材料,由法定代表人持本人身份证原件,或委托代理人持法定代表人签字并加盖单位公章的授权委托书以及委托代理人本人身份证原件,送至我单位,由我单位进行答复。
书面异议函一式两份,请异议方同时送一份至政府采购监管部门(玉溪市财政局政府采购管理科)备查。
采购人:玉溪农业职业技术学院、云南云投职教扶贫开发玉溪农业职业技术学院有限责任公司
单位地址:玉溪市红塔区研和街道向家庄41号
联系电话:****-*******
政府采购监管部门:玉溪市财政局政府采购管理科
地址:玉溪市红塔区聂耳路35号
联系电话:****-*******、****-*******
2019年01月18日
招标
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